MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020532	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020532	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020532	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020532	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020532	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020532	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020532	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020532	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020532	ATGAG	2	10	37186	37195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020532	CAAAA	2	10	38214	38223	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020532	TTTGT	2	10	43592	43601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020532	TTTTG	2	10	45238	45247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020532	AAGTA	2	10	56410	56419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020532	TTTTA	2	10	56774	56783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020532	CATTT	2	10	62393	62402	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020532	TTTTA	2	10	65253	65262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020532	GTGTT	2	10	71061	71070	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020532	ATTCA	2	10	73653	73662	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020532	GTAAT	2	10	95750	95759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020532	AGATG	2	10	102346	102355	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020532	ATTTT	2	10	117898	117907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020532	TGATT	2	10	160238	160247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020532	CAAAA	2	10	160491	160500	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020532	CAAAA	2	10	162602	162611	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020532	TAAAG	2	10	162951	162960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020532	TATCA	2	10	172979	172988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020532	ATCAT	2	10	181111	181120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020532	CAACT	2	10	193243	193252	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020532	GCTTT	2	10	197755	197764	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020532	TGAAG	2	10	197957	197966	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020532	AAAAT	2	10	198028	198037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020532	TGATT	2	10	198101	198110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020532	GAAAA	2	10	208749	208758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020532	TAACA	2	10	209120	209129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020532	AATAT	2	10	228315	228324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020532	TATTG	2	10	231519	231528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020532	TATTT	2	10	234306	234315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020532	AATTG	2	10	240019	240028	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020532	AACAT	2	10	242649	242658	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020532	GATAA	2	10	246586	246595	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020532	ATAAC	2	10	251233	251242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020532	TGAAT	2	10	251344	251353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020532	ATTAA	2	10	251485	251494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020532	AAAGT	2	10	255229	255238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020532	AATTA	2	10	255342	255351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020532	TAAAA	2	10	256942	256951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020532	AAATT	2	10	258258	258267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020532	TAAAA	2	10	272404	272413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020532	GAAAA	2	10	280194	280203	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020532	ATAAA	2	10	280312	280321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020532	TCATA	2	10	288774	288783	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020532	ATTTA	2	10	302697	302706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020532	ACTCG	2	10	306558	306567	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_020532	AATTT	2	10	312969	312978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020532	AATTA	2	10	314350	314359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020532	TAAAT	2	10	333451	333460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020532	ATTTT	2	10	339008	339017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020532	ATAGA	2	10	345252	345261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020532	TGACA	2	10	345444	345453	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020532	AAGAT	2	10	346503	346512	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020532	GATAA	2	10	357749	357758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020532	TAAAA	2	10	369189	369198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020532	TTGTT	2	10	369494	369503	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020532	TATCA	3	15	372491	372505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020532	GAATG	2	10	386753	386762	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020532	AGATA	2	10	393623	393632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020532	AGAAT	2	10	393864	393873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020532	TAAGG	2	10	393928	393937	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020532	ATTGT	2	10	395147	395156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020532	TAAAT	2	10	401386	401395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020532	AGATA	2	10	401489	401498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020532	ACAGT	2	10	405480	405489	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020532	CATAA	2	10	415964	415973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020532	TAAAA	2	10	416188	416197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020532	AAAGT	2	10	429141	429150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020532	AAATT	2	10	432320	432329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020532	GAAAA	2	10	443026	443035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020532	ATAGC	2	10	443893	443902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020532	TGAAA	2	10	443907	443916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020532	AATGC	2	10	444010	444019	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020532	TAAAG	2	10	444103	444112	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020532	CTCAC	2	10	446008	446017	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_020532	CAAAG	2	10	446033	446042	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020532	CTTAA	2	10	463659	463668	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020532	TGGTG	2	10	481478	481487	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020532	CAACT	2	10	482049	482058	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_020532	TCGTG	2	10	483342	483351	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020532	TTAAT	2	10	483983	483992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020532	GATTG	2	10	485785	485794	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020532	GATTT	2	10	490714	490723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020532	TCTGT	2	10	492891	492900	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020532	ATATA	2	10	493132	493141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020532	CAAAG	2	10	499680	499689	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020532	ATGGT	2	10	502114	502123	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020532	CATTA	2	10	502564	502573	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020532	TTGAT	2	10	502841	502850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020532	AAAAG	2	10	514057	514066	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020532	AGACA	2	10	516823	516832	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020532	AAGTA	2	10	519258	519267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020532	TTAAA	2	10	521381	521390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020532	GATAA	2	10	521420	521429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020532	GGTAA	2	10	526952	526961	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020532	TCGTG	2	10	527771	527780	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020532	GATTG	2	10	530077	530086	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020532	ATATA	2	10	536691	536700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020532	AAAAT	2	10	541466	541475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020532	TTTAT	2	10	541575	541584	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020532	TTATG	2	10	544581	544590	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020532	ATTTA	2	10	544726	544735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020532	ACAAT	2	10	546531	546540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020532	AAATA	2	10	549020	549029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020532	TGAAT	2	10	550998	551007	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020532	GTATA	2	10	551055	551064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020532	TATAA	2	10	554772	554781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020532	GTTTA	2	10	570915	570924	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020532	TAAAG	2	10	575107	575116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020532	GAAGC	2	10	576463	576472	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020532	ATATT	2	10	581244	581253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020532	TTAAC	2	10	584119	584128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020532	AATTT	2	10	584204	584213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020532	ATAAA	2	10	592525	592534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020532	TAAAA	2	10	607990	607999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020532	TTATA	2	10	608423	608432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020532	CACAT	2	10	608819	608828	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_020532	AGCAG	2	10	610619	610628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020532	GTAAA	2	10	610828	610837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020532	ATGAT	2	10	617842	617851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020532	TAATT	2	10	621329	621338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020532	TAAAT	2	10	630730	630739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020532	AAATT	2	10	632734	632743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020532	TAAAA	2	10	639629	639638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020532	CTATC	2	10	640431	640440	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_020532	ATTAA	2	10	641817	641826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020532	TTATT	2	10	641866	641875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020532	CAATA	2	10	641932	641941	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020532	TTAAT	2	10	644558	644567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020532	AAATA	2	10	646823	646832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020532	ATTTT	2	10	646845	646854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020532	ATAAA	2	10	653537	653546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020532	TTTTA	2	10	657323	657332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020532	AAAGG	2	10	657644	657653	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020532	ATATA	2	10	660881	660890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020532	AAACT	2	10	664406	664415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_020532	TTCAC	2	10	669619	669628	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_020532	TTTGT	2	10	673525	673534	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020532	AATGA	2	10	673598	673607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020532	GGTTG	2	10	680600	680609	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020532	TAAAC	2	10	688526	688535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_020532	AATTG	2	10	690790	690799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_020532	AATTA	2	10	716151	716160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_020532	TTTTA	2	10	772140	772149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_020532	ATCAT	2	10	1097750	1097759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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