MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020532	A	6	6	645042	645047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_020532	TGT	2	6	645105	645110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020532	TAC	2	6	645120	645125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_020532	A	7	7	645161	645167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020532	AAT	2	6	645186	645191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_020532	TAA	3	9	646179	646187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_020532	CATTAT	2	12	646201	646212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3508	NC_020532	AAT	2	6	646237	646242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_020532	A	7	7	646247	646253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_020532	ATG	2	6	646290	646295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_020532	CTTT	2	8	646335	646342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_020532	GTT	3	9	646372	646380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_020532	AAT	2	6	646386	646391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020532	CTA	2	6	646448	646453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_020532	GTT	2	6	646494	646499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_020532	TCC	2	6	646579	646584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_020532	TGA	2	6	646605	646610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_020532	TGTT	2	8	646723	646730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_020532	ATA	2	6	646758	646763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_020532	CCT	2	6	646801	646806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_020532	TA	3	6	646814	646819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020532	AAATA	2	10	646823	646832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020532	ATTTT	2	10	646845	646854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_020532	A	6	6	646872	646877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020532	AT	3	6	646886	646891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020532	AGG	2	6	647517	647522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020532	TTG	2	6	649958	649963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020532	TATT	2	8	649964	649971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020532	TCT	2	6	649994	649999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_020532	ATA	2	6	650009	650014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020532	TGG	3	9	650019	650027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020532	TGG	2	6	650034	650039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020532	GATT	2	8	650112	650119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020532	ATT	2	6	650134	650139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020532	ATC	2	6	650151	650156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_020532	ATA	2	6	650167	650172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_020532	T	6	6	650179	650184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_020532	AAC	2	6	650211	650216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_020532	GTT	2	6	650290	650295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_020532	TGT	2	6	650315	650320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_020532	ATT	2	6	650351	650356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_020532	AT	3	6	650390	650395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_020532	ATCA	2	8	650402	650409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_020532	AT	3	6	650439	650444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_020532	ATT	2	6	650463	650468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_020532	TAG	2	6	650492	650497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_020532	TAA	2	6	650509	650514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_020532	TGG	2	6	650516	650521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_020532	TTGT	2	8	650529	650536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_020532	TACTTG	2	12	650602	650613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3551	NC_020532	AGA	2	6	650639	650644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_020532	G	6	6	650662	650667	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_020532	ACAA	2	8	652655	652662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_020532	ATT	2	6	652677	652682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_020532	ATT	2	6	652692	652697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_020532	ATC	2	6	652713	652718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_020532	TTTA	2	8	652721	652728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_020532	ACA	2	6	652746	652751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_020532	ACA	2	6	652776	652781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_020532	GT	3	6	652807	652812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_020532	TTTC	2	8	652834	652841	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_020532	TGG	2	6	652907	652912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_020532	G	6	6	652911	652916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_020532	T	6	6	653471	653476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_020532	TAT	2	6	653478	653483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_020532	TGT	2	6	653491	653496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_020532	GTT	2	6	653510	653515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_020532	ACAA	2	8	653523	653530	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_020532	ATAAA	2	10	653537	653546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_020532	AAT	2	6	653551	653556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_020532	AT	3	6	653585	653590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_020532	AG	3	6	653690	653695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_020532	TGA	2	6	655770	655775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_020532	CCA	2	6	655787	655792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_020532	TGG	2	6	655797	655802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_020532	TA	3	6	655804	655809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_020532	A	7	7	657246	657252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_020532	CCA	2	6	657271	657276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_020532	GAA	2	6	657285	657290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_020532	TCA	2	6	657312	657317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_020532	TTTTA	2	10	657323	657332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_020532	ATAG	2	8	657343	657350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_020532	ATT	2	6	657366	657371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_020532	GGA	2	6	657409	657414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_020532	A	6	6	657461	657466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_020532	G	6	6	657513	657518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_020532	ATT	2	6	657572	657577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_020532	AAAGG	2	10	657644	657653	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_020532	TAG	2	6	657708	657713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_020532	TAGT	2	8	657778	657785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_020532	CG	3	6	657805	657810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_020532	GT	3	6	657829	657834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_020532	AGA	2	6	657862	657867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_020532	TTAA	2	8	657915	657922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_020532	AGC	2	6	657966	657971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_020532	TTAA	2	8	658048	658055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_020532	ACC	2	6	658108	658113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_020532	TA	4	8	658135	658142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_020532	AGG	2	6	658148	658153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_020532	AT	4	8	658157	658164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_020532	CATCAA	2	12	658252	658263	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_020532	TCG	2	6	659108	659113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_020532	TAC	2	6	659115	659120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_020532	ACC	2	6	659157	659162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_020532	GCA	2	6	659173	659178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_020532	TAA	2	6	659187	659192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_020532	TAA	3	9	659196	659204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_020532	TAAA	2	8	660028	660035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_020532	CCT	2	6	660802	660807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_020532	TAAT	2	8	660829	660836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_020532	TAA	2	6	660841	660846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_020532	ATATA	2	10	660881	660890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_020532	ATGT	2	8	660895	660902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_020532	CTT	2	6	661623	661628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_020532	T	6	6	661627	661632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_020532	TTA	2	6	662434	662439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_020532	TAATTT	2	12	662492	662503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_020532	ATA	2	6	662594	662599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_020532	ATG	2	6	663393	663398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_020532	ATAAAA	2	12	663399	663410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_020532	T	6	6	663441	663446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_020532	CCTT	2	8	664253	664260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_020532	TAC	2	6	664286	664291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_020532	GTT	2	6	664298	664303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_020532	TGT	2	6	664317	664322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_020532	AGA	2	6	664332	664337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_020532	TTA	2	6	664343	664348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_020532	ATC	2	6	664379	664384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_020532	AAACT	2	10	664406	664415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3630	NC_020532	TAA	2	6	664454	664459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_020532	AAT	2	6	664483	664488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_020532	ACA	2	6	664521	664526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_020532	ATT	2	6	664527	664532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_020532	ATA	2	6	664533	664538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_020532	TAA	2	6	665436	665441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_020532	TAA	2	6	666632	666637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_020532	CAA	2	6	666643	666648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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