MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020532	A	7	7	340733	340739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020532	TCT	2	6	342839	342844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_020532	TAA	2	6	342994	342999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020532	AAT	2	6	343008	343013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020532	ATG	2	6	343039	343044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020532	T	6	6	343055	343060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020532	GAAT	2	8	345223	345230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020532	ATG	2	6	345236	345241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020532	ATAGA	2	10	345252	345261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020532	AATG	2	8	345296	345303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020532	ATATGA	2	12	345322	345333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020532	TGACA	2	10	345444	345453	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_020532	AGA	2	6	346488	346493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020532	AAGAT	2	10	346503	346512	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020532	ATT	2	6	346527	346532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020532	GAT	2	6	346589	346594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020532	GAT	2	6	346646	346651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020532	ATT	2	6	346715	346720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020532	GAA	3	9	346739	346747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020532	AGA	2	6	346774	346779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020532	GTT	2	6	346786	346791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020532	GAT	2	6	346799	346804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020532	AAG	2	6	346812	346817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020532	AT	3	6	348588	348593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020532	CAT	2	6	349700	349705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_020532	TTA	2	6	349723	349728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020532	TTCATT	2	12	349777	349788	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1528	NC_020532	TA	3	6	349789	349794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020532	CTA	2	6	349813	349818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_020532	TA	3	6	349828	349833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020532	TAAG	2	8	350937	350944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020532	TA	3	6	350995	351000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020532	CCT	2	6	352368	352373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_020532	GTT	2	6	352388	352393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020532	TGT	2	6	352414	352419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020532	CTT	2	6	352589	352594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_020532	ACT	2	6	352617	352622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_020532	TAC	2	6	352641	352646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_020532	T	6	6	352700	352705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020532	GA	3	6	352810	352815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020532	TCA	2	6	352829	352834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_020532	TGCAAT	2	12	352909	352920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1543	NC_020532	ATCA	2	8	352963	352970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_020532	AAT	2	6	352993	352998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020532	GTA	2	6	353007	353012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020532	ATG	2	6	353069	353074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020532	GTT	2	6	353078	353083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020532	TCC	2	6	355071	355076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_020532	TTGTAA	2	12	355080	355091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020532	AAAT	2	8	355192	355199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020532	TTAG	2	8	355240	355247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020532	TGG	2	6	355261	355266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020532	TATT	2	8	355293	355300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020532	CAA	2	6	355404	355409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_020532	TTA	2	6	355473	355478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020532	GAA	2	6	355534	355539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020532	GACT	2	8	355549	355556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_020532	TGA	2	6	355598	355603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020532	GAA	3	9	355635	355643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020532	ATT	2	6	355771	355776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020532	TCGG	2	8	357187	357194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_020532	A	7	7	357209	357215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020532	AT	3	6	357219	357224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020532	A	6	6	357237	357242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020532	AT	3	6	357286	357291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020532	GAA	2	6	357299	357304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020532	GAA	2	6	357326	357331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020532	TGA	2	6	357517	357522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020532	T	6	6	357538	357543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020532	ATT	2	6	357556	357561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020532	GTG	2	6	357628	357633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020532	CAG	2	6	357651	357656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_020532	T	7	7	357685	357691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020532	TAA	2	6	357698	357703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020532	AT	3	6	357735	357740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020532	GATAA	2	10	357749	357758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020532	T	6	6	357772	357777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020532	TCC	2	6	359146	359151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_020532	A	6	6	359274	359279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020532	ATT	2	6	359312	359317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020532	TGA	2	6	364020	364025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020532	TTTA	2	8	364047	364054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020532	GTT	2	6	364072	364077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020532	TAT	2	6	364083	364088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020532	ATT	2	6	364115	364120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020532	GGA	2	6	364142	364147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020532	ATC	2	6	364157	364162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_020532	TAT	2	6	364178	364183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020532	ATA	2	6	364235	364240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020532	T	7	7	368058	368064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020532	TTG	2	6	368092	368097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020532	TGGT	2	8	368117	368124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020532	TGC	2	6	368240	368245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_020532	CCA	2	6	368885	368890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_020532	ATG	2	6	368893	368898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020532	ACG	2	6	368907	368912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_020532	GAC	2	6	368921	368926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_020532	TGT	2	6	369010	369015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020532	GT	3	6	369032	369037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020532	TCT	2	6	369058	369063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_020532	T	6	6	369120	369125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020532	AAT	2	6	369135	369140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020532	GAC	2	6	369159	369164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_020532	TTG	2	6	369170	369175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020532	TAAAA	2	10	369189	369198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020532	GTTA	2	8	369201	369208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020532	CTCA	2	8	369223	369230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_020532	AGT	2	6	369233	369238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020532	AAT	2	6	369292	369297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020532	ATA	2	6	369343	369348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020532	AAGTAC	2	12	369371	369382	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1612	NC_020532	TCA	2	6	369430	369435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_020532	TTG	2	6	369462	369467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020532	TTGTT	2	10	369494	369503	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020532	GAT	2	6	369521	369526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020532	ATC	2	6	369552	369557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_020532	TGAT	2	8	369561	369568	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020532	TTG	2	6	369669	369674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020532	TTG	2	6	369681	369686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_020532	ATA	2	6	369709	369714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020532	CAT	2	6	369752	369757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_020532	GTT	2	6	369834	369839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020532	CATA	2	8	369849	369856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_020532	T	7	7	369871	369877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020532	TAT	2	6	370129	370134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020532	GAG	2	6	370136	370141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020532	ATA	2	6	372392	372397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020532	ATC	2	6	372427	372432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_020532	GAT	2	6	372465	372470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020532	TATCA	3	15	372491	372505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1631	NC_020532	AGA	2	6	372515	372520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020532	TA	3	6	372567	372572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020532	ATTT	2	8	372593	372600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020532	TGA	2	6	372613	372618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_020532	TAAT	2	8	373910	373917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1641	NC_020532	TGA	2	6	374063	374068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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