MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020532	ATA	2	6	228255	228260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020532	A	7	7	228260	228266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020532	TGT	2	6	228270	228275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020532	AATAT	2	10	228315	228324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020532	TGA	2	6	228367	228372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020532	TATT	2	8	228972	228979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020532	TAA	2	6	229039	229044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020532	AT	3	6	229077	229082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020532	AT	3	6	230601	230606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020532	CT	3	6	230752	230757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_020532	GAAA	2	8	230770	230777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020532	TGT	2	6	231472	231477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020532	TATTG	2	10	231519	231528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020532	AAT	2	6	231573	231578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020532	TCA	3	9	231583	231591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_020532	AAT	2	6	234159	234164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020532	TGT	2	6	234240	234245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020532	TTTG	2	8	234260	234267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020532	TATTT	2	10	234306	234315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020532	TA	3	6	234324	234329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020532	AT	3	6	234402	234407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020532	CAA	2	6	234445	234450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020532	T	6	6	234454	234459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020532	AT	3	6	234468	234473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020532	TGT	2	6	234521	234526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020532	ACAT	2	8	234586	234593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_020532	TGA	2	6	234595	234600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020532	A	7	7	234622	234628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020532	CAA	2	6	234632	234637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020532	AAAG	2	8	237757	237764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020532	CTT	2	6	237797	237802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_020532	GTA	2	6	237833	237838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020532	ATC	2	6	237938	237943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_020532	TTA	2	6	237951	237956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020532	ATATGA	2	12	237969	237980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020532	GAT	2	6	239854	239859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020532	ATT	2	6	239985	239990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020532	AATTG	2	10	240019	240028	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020532	ATTT	2	8	240159	240166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020532	TGCT	2	8	240246	240253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_020532	TGT	2	6	240325	240330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020532	A	7	7	240364	240370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020532	AT	3	6	240445	240450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020532	GGA	2	6	240506	240511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020532	A	6	6	240515	240520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020532	ACA	2	6	242553	242558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_020532	ATG	2	6	242574	242579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020532	ATT	2	6	242626	242631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020532	AACAT	2	10	242649	242658	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_020532	AT	3	6	242665	242670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020532	AAT	3	9	242726	242734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020532	AC	4	8	242781	242788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_020532	ATT	2	6	242853	242858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020532	ACC	2	6	242940	242945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_020532	T	6	6	242961	242966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020532	CA	3	6	242984	242989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_020532	TAA	2	6	242997	243002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020532	TTCA	2	8	243040	243047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_020532	CT	3	6	244281	244286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_020532	TCC	2	6	246568	246573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_020532	GATAA	2	10	246586	246595	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020532	ATTA	2	8	246634	246641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020532	T	6	6	246705	246710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020532	ATT	2	6	246735	246740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020532	ACA	2	6	248015	248020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_020532	ATAAC	2	10	251233	251242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_020532	ATA	2	6	251280	251285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020532	TGAAT	2	10	251344	251353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020532	TA	3	6	251368	251373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020532	ATTAA	2	10	251485	251494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020532	TAT	2	6	251503	251508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020532	GGAATA	2	12	252830	252841	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020532	A	6	6	252854	252859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020532	TA	3	6	252895	252900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020532	TAA	2	6	252928	252933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020532	TCA	2	6	252949	252954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_020532	CT	3	6	254561	254566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_020532	CAA	2	6	254588	254593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_020532	TGT	2	6	254629	254634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020532	ATT	2	6	254647	254652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020532	AATT	2	8	254660	254667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020532	GTA	2	6	254668	254673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020532	AAAT	2	8	254688	254695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020532	AT	3	6	254740	254745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020532	CTG	2	6	254763	254768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_020532	TAC	2	6	254772	254777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_020532	TGC	2	6	254802	254807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_020532	AAT	2	6	254987	254992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020532	TAT	2	6	255062	255067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020532	TGT	2	6	255152	255157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020532	GAC	2	6	255163	255168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_020532	AAAT	2	8	255170	255177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020532	ATC	2	6	255189	255194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_020532	A	6	6	255213	255218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020532	AAAGT	2	10	255229	255238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020532	ATTT	2	8	255263	255270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020532	AATTA	2	10	255342	255351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020532	AAT	2	6	255363	255368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020532	CTC	2	6	256610	256615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_020532	ATT	2	6	256635	256640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020532	CTA	2	6	256641	256646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_020532	AATT	2	8	256662	256669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020532	ATAA	2	8	256683	256690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020532	T	6	6	256725	256730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020532	CGA	2	6	256776	256781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_020532	GC	3	6	256784	256789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_020532	ATTT	2	8	256790	256797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020532	A	6	6	256807	256812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020532	TTG	2	6	256815	256820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020532	A	6	6	256830	256835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020532	ATA	2	6	256845	256850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020532	AAT	2	6	256867	256872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020532	TAAAA	2	10	256942	256951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020532	AAAT	2	8	256956	256963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020532	AAAT	2	8	257014	257021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020532	AGC	2	6	257109	257114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_020532	A	6	6	258178	258183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020532	GTT	2	6	258251	258256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020532	AAATT	2	10	258258	258267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020532	GAT	2	6	258303	258308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020532	ATG	2	6	258346	258351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020532	CTT	2	6	258399	258404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_020532	ATT	2	6	259995	260000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020532	AT	4	8	260032	260039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020532	TTG	2	6	260110	260115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020532	AGGT	2	8	260170	260177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020532	CAC	2	6	260282	260287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_020532	ATAA	2	8	260288	260295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020532	AAC	2	6	260315	260320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_020532	AT	3	6	260334	260339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020532	TTAA	2	8	261284	261291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020532	ATGT	2	8	261387	261394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020532	A	6	6	261407	261412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020532	AT	3	6	261427	261432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020532	A	6	6	261474	261479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020532	TGT	2	6	261497	261502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020532	ATG	2	6	261515	261520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020532	GT	3	6	261552	261557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_020532	TGA	2	6	261574	261579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_020532	TAG	2	6	264199	264204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_020532	GTG	2	6	264208	264213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_020532	AGT	2	6	264233	264238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1164	NC_020532	AAC	2	6	268591	268596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1265	NC_020532	TAT	2	6	293164	293169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_020532	TGAT	2	8	294697	294704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_020532	T	6	6	294704	294709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_020532	GATG	2	8	295807	295814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_020532	A	6	6	321879	321884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_020532	TAT	2	6	321887	321892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_020532	CTTT	2	8	322019	322026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1408	NC_020532	ATA	3	9	322140	322148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_020532	AAT	2	6	322179	322184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_020532	AAT	2	6	322188	322193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_020532	AGC	2	6	322248	322253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_020532	CAA	2	6	322280	322285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_020532	CAG	3	9	322322	322330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_020532	TAT	2	6	322343	322348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_020532	ATT	2	6	322381	322386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_020532	A	7	7	322423	322429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_020532	TTG	2	6	322441	322446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_020532	ATT	2	6	322447	322452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_020532	TAA	2	6	322460	322465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_020532	ACT	2	6	322512	322517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1421	NC_020532	TAA	2	6	322521	322526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_020532	TAAA	2	8	322598	322605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_020532	CT	3	6	322609	322614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1424	NC_020532	A	8	8	322707	322714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1426	NC_020532	AATT	2	8	323673	323680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_020532	T	6	6	323714	323719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_020532	ATT	2	6	323729	323734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_020532	AAT	2	6	323739	323744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_020532	AGAC	2	8	323749	323756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1431	NC_020532	A	6	6	323787	323792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_020532	ATA	2	6	325125	325130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_020532	T	6	6	325136	325141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_020532	TCCT	2	8	325152	325159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1435	NC_020532	ATA	2	6	325174	325179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_020532	A	6	6	325184	325189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_020532	TAT	2	6	325243	325248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_020532	AAT	2	6	325266	325271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_020532	TAT	2	6	325282	325287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_020532	ATA	2	6	325635	325640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_020532	ATA	2	6	326704	326709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_020532	AATT	2	8	326713	326720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_020532	GTAT	2	8	326778	326785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_020532	ACG	2	6	326804	326809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1454	NC_020532	TTA	2	6	328609	328614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_020532	CAT	2	6	328623	328628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1456	NC_020532	TAT	2	6	328652	328657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_020532	TAA	3	9	328681	328689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_020532	TTA	2	6	328690	328695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_020532	ATA	2	6	328723	328728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_020532	GTA	2	6	328735	328740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1468	NC_020532	CAA	2	6	331366	331371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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