MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020532	TTCG	2	8	1054735	1054742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_020532	T	6	6	1054765	1054770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_020532	TAA	2	6	1054786	1054791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_020532	T	6	6	1054858	1054863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_020532	TAA	2	6	1056528	1056533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_020532	TAG	2	6	1059212	1059217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_020532	TA	3	6	1059226	1059231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_020532	TAA	2	6	1059240	1059245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_020532	TGA	2	6	1060300	1060305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_020532	AGTA	2	8	1060316	1060323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_020532	TTA	2	6	1060336	1060341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_020532	ATC	2	6	1060365	1060370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_020532	TTAA	2	8	1060379	1060386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_020532	ATC	2	6	1060443	1060448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_020532	TAT	2	6	1060467	1060472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_020532	GTA	2	6	1060535	1060540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_020532	TTA	2	6	1060544	1060549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_020532	AAAG	2	8	1060561	1060568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_020532	TAGTAT	2	12	1060619	1060630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_020532	TATT	3	12	1060631	1060642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_020532	GAA	2	6	1060695	1060700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_020532	ACA	2	6	1060755	1060760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_020532	ATT	2	6	1060776	1060781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_020532	TTA	2	6	1060782	1060787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_020532	TTAAT	2	10	1060891	1060900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_020532	TGA	2	6	1060924	1060929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_020532	A	6	6	1060944	1060949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_020532	A	7	7	1061010	1061016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_020532	GTT	2	6	1061032	1061037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_020532	ATT	2	6	1061039	1061044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_020532	CAAC	2	8	1061050	1061057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_020532	CTT	2	6	1062444	1062449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_020532	ATA	2	6	1062459	1062464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_020532	TAA	2	6	1062468	1062473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_020532	ATTT	2	8	1062493	1062500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_020532	T	6	6	1062503	1062508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_020532	ATT	2	6	1062519	1062524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_020532	A	6	6	1062552	1062557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_020532	TAT	2	6	1062590	1062595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_020532	CCT	2	6	1063231	1063236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_020532	AAG	2	6	1063325	1063330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_020532	TAA	2	6	1063355	1063360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_020532	ATA	2	6	1064271	1064276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_020532	TG	3	6	1064322	1064327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_020532	T	6	6	1064386	1064391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_020532	GTA	2	6	1064396	1064401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_020532	ATC	2	6	1064444	1064449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_020532	ATA	2	6	1064484	1064489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_020532	ACA	2	6	1064498	1064503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_020532	T	8	8	1064539	1064546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_020532	ATA	2	6	1064595	1064600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_020532	A	6	6	1064600	1064605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_020532	ATA	2	6	1066509	1066514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_020532	ATA	2	6	1066561	1066566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_020532	TAT	2	6	1066588	1066593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_020532	GTT	2	6	1066668	1066673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_020532	GT	3	6	1066677	1066682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_020532	ATC	2	6	1066699	1066704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_020532	TA	3	6	1067413	1067418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_020532	CAA	2	6	1067447	1067452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_020532	TGA	2	6	1067490	1067495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_020532	GAA	2	6	1067557	1067562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_020532	AAG	2	6	1067594	1067599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_020532	CAAA	2	8	1067643	1067650	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_020532	AT	3	6	1067716	1067721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_020532	TTTATA	2	12	1067769	1067780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_020532	TGT	2	6	1067809	1067814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_020532	CTT	2	6	1067815	1067820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_020532	GTCA	2	8	1067829	1067836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6070	NC_020532	TA	3	6	1067936	1067941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_020532	TA	3	6	1069317	1069322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_020532	TGA	2	6	1069341	1069346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_020532	AAC	2	6	1069373	1069378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_020532	TTTTG	2	10	1069391	1069400	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_020532	AAACA	2	10	1069436	1069445	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6076	NC_020532	TGG	2	6	1069490	1069495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_020532	ATG	2	6	1069509	1069514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_020532	ATA	2	6	1069538	1069543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_020532	ATTTT	2	10	1069561	1069570	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_020532	T	6	6	1069574	1069579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_020532	CAA	2	6	1069607	1069612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_020532	TGT	2	6	1069627	1069632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_020532	ATT	3	9	1069651	1069659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_020532	TAT	2	6	1069753	1069758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_020532	TTAG	2	8	1069763	1069770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_020532	TAAAA	2	10	1073262	1073271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_020532	ACA	2	6	1073281	1073286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_020532	A	6	6	1073342	1073347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_020532	T	6	6	1073388	1073393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_020532	T	7	7	1074488	1074494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_020532	TTA	2	6	1074572	1074577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_020532	TAAAT	2	10	1074606	1074615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_020532	ATTTTA	2	12	1074665	1074676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_020532	AGG	2	6	1074734	1074739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_020532	ATTA	2	8	1075658	1075665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_020532	TTGG	2	8	1075749	1075756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_020532	AAAT	2	8	1075776	1075783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_020532	ATGTT	2	10	1075794	1075803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_020532	T	6	6	1075828	1075833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_020532	CAA	2	6	1075941	1075946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_020532	TGG	2	6	1075948	1075953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_020532	ATT	2	6	1075973	1075978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_020532	TTA	3	9	1076075	1076083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_020532	TAT	2	6	1076088	1076093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_020532	T	6	6	1076194	1076199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_020532	GAA	2	6	1076203	1076208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_020532	T	7	7	1076253	1076259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_020532	TAA	2	6	1076276	1076281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_020532	GAT	2	6	1076364	1076369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_020532	TAAT	2	8	1076416	1076423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_020532	GTT	2	6	1076426	1076431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_020532	T	6	6	1076430	1076435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_020532	GGT	2	6	1076458	1076463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_020532	GAT	2	6	1077553	1077558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_020532	TGA	2	6	1077561	1077566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_020532	TGATA	2	10	1077573	1077582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_020532	CAT	2	6	1077602	1077607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_020532	ATCA	2	8	1077659	1077666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_020532	ATG	2	6	1077689	1077694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_020532	ATC	2	6	1077716	1077721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_020532	AGACA	2	10	1077746	1077755	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6122	NC_020532	TGA	2	6	1077831	1077836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_020532	GTT	2	6	1077838	1077843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_020532	A	6	6	1077956	1077961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_020532	GGT	2	6	1077978	1077983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_020532	ACTA	2	8	1077994	1078001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_020532	TCC	2	6	1078954	1078959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_020532	TG	3	6	1079009	1079014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_020532	GAATT	2	10	1079040	1079049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_020532	ATG	2	6	1079056	1079061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_020532	TAA	2	6	1079134	1079139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_020532	ATGAT	2	10	1079144	1079153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_020532	AAAT	2	8	1079163	1079170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_020532	TTTA	2	8	1079216	1079223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_020532	TTCA	2	8	1079270	1079277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6136	NC_020532	TATG	2	8	1079301	1079308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6252	NC_020532	ATG	2	6	1103700	1103705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_020532	GTG	2	6	1103752	1103757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_020532	CAT	2	6	1103781	1103786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_020532	G	6	6	1103804	1103809	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_020532	TAAAT	2	10	1103845	1103854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_020532	AT	3	6	1105633	1105638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_020532	AAT	2	6	1105641	1105646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_020532	T	7	7	1105671	1105677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_020532	ATC	2	6	1105715	1105720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6261	NC_020532	GT	3	6	1105786	1105791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6398	NC_020532	AAG	2	6	1116631	1116636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_020532	CAT	2	6	1116652	1116657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6400	NC_020532	TTG	2	6	1116658	1116663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_020532	TAA	2	6	1116665	1116670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_020532	TAAT	2	8	1116679	1116686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6403	NC_020532	CATG	2	8	1116698	1116705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6404	NC_020532	TA	4	8	1116707	1116714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6407	NC_020532	AT	3	6	1116787	1116792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6408	NC_020532	AAT	2	6	1116806	1116811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6410	NC_020532	TCA	2	6	1116901	1116906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6418	NC_020532	TA	3	6	1117364	1117369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6419	NC_020532	ACA	2	6	1117379	1117384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6421	NC_020532	TTAA	2	8	1117497	1117504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6422	NC_020532	TTC	2	6	1117529	1117534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6425	NC_020532	TA	3	6	1119010	1119015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6426	NC_020532	CAC	2	6	1119018	1119023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6427	NC_020532	TGG	2	6	1119027	1119032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6428	NC_020532	CAT	2	6	1119056	1119061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6430	NC_020532	AAT	2	6	1119113	1119118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6431	NC_020532	T	8	8	1120100	1120107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6432	NC_020532	AAT	2	6	1120124	1120129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6433	NC_020532	TGA	3	9	1120226	1120234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6434	NC_020532	ATT	2	6	1120238	1120243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6435	NC_020532	TTTA	2	8	1120264	1120271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6436	NC_020532	TTTG	2	8	1120386	1120393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6437	NC_020532	AATT	2	8	1120449	1120456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6438	NC_020532	TAAA	2	8	1120463	1120470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6439	NC_020532	ACT	2	6	1120478	1120483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6441	NC_020532	ATTA	2	8	1120517	1120524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6442	NC_020532	TCG	2	6	1120536	1120541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6443	NC_020532	AAT	2	6	1120544	1120549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6444	NC_020532	GTAT	2	8	1120595	1120602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6445	NC_020532	TAAAA	2	10	1120630	1120639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6446	NC_020532	TTAG	2	8	1120649	1120656	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6447	NC_020532	TAA	2	6	1120721	1120726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6448	NC_020532	AT	3	6	1120727	1120732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6449	NC_020532	TTA	3	9	1120772	1120780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6450	NC_020532	AT	3	6	1120790	1120795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6451	NC_020532	GAAAT	2	10	1120802	1120811	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6452	NC_020532	ACTG	2	8	1120821	1120828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6454	NC_020532	AAT	2	6	1120889	1120894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6455	NC_020532	CT	3	6	1120903	1120908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6456	NC_020532	TTTG	2	8	1120915	1120922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6457	NC_020532	AGA	2	6	1121008	1121013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6459	NC_020532	TAA	2	6	1121099	1121104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6461	NC_020532	ATATT	2	10	1121167	1121176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6464	NC_020532	AAAT	2	8	1121346	1121353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6469	NC_020532	TTG	2	6	1123079	1123084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6470	NC_020532	TA	3	6	1123911	1123916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6471	NC_020532	TAAA	2	8	1123939	1123946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6472	NC_020532	TAAA	2	8	1123961	1123968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6476	NC_020532	ATT	2	6	1124080	1124085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6479	NC_020532	ATT	2	6	1124173	1124178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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