MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020532	A	6	6	872093	872098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_020532	GAA	2	6	872216	872221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_020532	GAC	2	6	872246	872251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_020532	TAA	2	6	872303	872308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_020532	TTC	2	6	872394	872399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_020532	TGG	2	6	872408	872413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_020532	T	7	7	872432	872438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_020532	TA	3	6	873875	873880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_020532	CAC	2	6	873883	873888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_020532	TGG	2	6	873892	873897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_020532	AATG	2	8	873906	873913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_020532	CTT	2	6	873945	873950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_020532	CTT	3	9	873984	873992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_020532	ATC	2	6	873997	874002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_020532	ATA	2	6	874010	874015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_020532	ATTT	2	8	874020	874027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_020532	CAA	2	6	874107	874112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_020532	CAA	2	6	874116	874121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_020532	CT	3	6	874133	874138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_020532	TCA	2	6	874145	874150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_020532	ATCA	2	8	874162	874169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_020532	AGT	2	6	874192	874197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020532	ATA	2	6	874240	874245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_020532	TA	3	6	874244	874249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_020532	AACT	2	8	874290	874297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_020532	TGA	2	6	874327	874332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_020532	AGCA	2	8	874343	874350	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_020532	ATC	2	6	874393	874398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_020532	ATTT	2	8	874429	874436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_020532	TGAT	2	8	874464	874471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_020532	AT	3	6	874470	874475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_020532	TTA	2	6	874491	874496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_020532	CAG	2	6	874508	874513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_020532	TAA	2	6	874519	874524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_020532	TGA	2	6	874597	874602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_020532	TTA	2	6	874612	874617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_020532	TTA	2	6	874626	874631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_020532	AAGCA	2	10	876506	876515	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5039	NC_020532	TA	3	6	876549	876554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_020532	TGA	2	6	876562	876567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_020532	TGA	2	6	876603	876608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_020532	TA	3	6	876627	876632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_020532	TA	3	6	876643	876648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_020532	ATGA	2	8	876684	876691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_020532	CAA	2	6	876698	876703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_020532	AAT	2	6	876718	876723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020532	TGA	2	6	876728	876733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_020532	TAAAAT	2	12	876758	876769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_020532	A	6	6	876805	876810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_020532	TAA	2	6	876911	876916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_020532	TTA	2	6	876942	876947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_020532	TTA	2	6	876970	876975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_020532	ATTTA	2	10	876982	876991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020532	AC	4	8	877003	877010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_020532	TTC	2	6	878531	878536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_020532	ATT	2	6	878554	878559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_020532	TTA	2	6	879766	879771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_020532	GAA	2	6	879826	879831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_020532	TAT	2	6	879834	879839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_020532	ATT	3	9	879861	879869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_020532	TAT	2	6	879903	879908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_020532	AGA	2	6	879960	879965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_020532	TTGA	2	8	881176	881183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_020532	ATAGA	2	10	881215	881224	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_020532	AAT	2	6	881252	881257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_020532	TAAT	2	8	881262	881269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_020532	A	6	6	881318	881323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_020532	TAA	2	6	881330	881335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_020532	AAT	2	6	881345	881350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_020532	TGT	2	6	881367	881372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_020532	ATA	2	6	881378	881383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_020532	CTT	2	6	881445	881450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_020532	TGTAAT	2	12	881519	881530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5077	NC_020532	GA	3	6	881670	881675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_020532	TTA	2	6	881691	881696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_020532	TAT	2	6	881700	881705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_020532	ATAG	2	8	881707	881714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_020532	TAA	2	6	881717	881722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_020532	AT	3	6	881749	881754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_020532	GTA	2	6	881771	881776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_020532	AT	3	6	881874	881879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_020532	TA	3	6	881894	881899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_020532	ATTA	2	8	881983	881990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_020532	TA	3	6	882020	882025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_020532	CAAA	2	8	882026	882033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_020532	TGAA	2	8	882066	882073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_020532	AT	3	6	883262	883267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_020532	TCA	2	6	883306	883311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_020532	TTA	2	6	883347	883352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_020532	TA	3	6	883351	883356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_020532	T	7	7	883357	883363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_020532	AAAT	2	8	883376	883383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020532	ACTA	2	8	883390	883397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_020532	GTT	2	6	883432	883437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020532	CAT	2	6	883450	883455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_020532	TC	3	6	883539	883544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_020532	TTG	2	6	883679	883684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_020532	GAA	2	6	883699	883704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_020532	TTA	2	6	883705	883710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_020532	AT	4	8	883715	883722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_020532	T	6	6	883745	883750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_020532	AGG	2	6	883752	883757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_020532	AGC	2	6	883788	883793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_020532	AAATG	2	10	883824	883833	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_020532	TGG	2	6	883863	883868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_020532	AGA	2	6	883902	883907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_020532	ATG	2	6	883922	883927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020532	TAG	2	6	883958	883963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_020532	AGA	2	6	883968	883973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_020532	TAA	2	6	884122	884127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_020532	TTA	2	6	884233	884238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_020532	A	6	6	884329	884334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_020532	TTAA	2	8	884335	884342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_020532	T	6	6	884343	884348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_020532	CTGA	2	8	884355	884362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_020532	CTTG	2	8	884365	884372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_020532	T	6	6	884420	884425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_020532	ATG	2	6	884473	884478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_020532	AGT	2	6	884504	884509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_020532	GTT	2	6	884518	884523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_020532	A	7	7	884548	884554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_020532	TAAA	2	8	885791	885798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_020532	ATT	2	6	885824	885829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_020532	TTG	2	6	887487	887492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_020532	TTA	2	6	887555	887560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_020532	ACT	2	6	887586	887591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_020532	TTTAA	2	10	887647	887656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_020532	ATT	2	6	887668	887673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_020532	AAGA	2	8	887676	887683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_020532	A	6	6	887693	887698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_020532	TTA	2	6	889147	889152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_020532	GTT	2	6	889195	889200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5412	NC_020532	TAA	2	6	949231	949236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5413	NC_020532	T	6	6	949239	949244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5414	NC_020532	TTTAAT	2	12	949285	949296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5415	NC_020532	TAA	2	6	949309	949314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5416	NC_020532	A	7	7	949338	949344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5417	NC_020532	T	6	6	949347	949352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5418	NC_020532	ATTC	2	8	949388	949395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5419	NC_020532	ATT	2	6	949423	949428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5420	NC_020532	T	6	6	949509	949514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5421	NC_020532	TGA	2	6	949531	949536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5422	NC_020532	TGA	2	6	949573	949578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5423	NC_020532	TTA	2	6	949679	949684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5425	NC_020532	ATT	2	6	949694	949699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5426	NC_020532	ATA	2	6	949704	949709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5427	NC_020532	AAG	2	6	949785	949790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5429	NC_020532	T	6	6	949879	949884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5430	NC_020532	AAT	2	6	949899	949904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5432	NC_020532	TTA	2	6	950066	950071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5435	NC_020532	TTTG	2	8	950121	950128	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5438	NC_020532	T	7	7	950949	950955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5439	NC_020532	TAG	2	6	950982	950987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5441	NC_020532	TAC	2	6	952047	952052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5442	NC_020532	TAT	2	6	953953	953958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5443	NC_020532	AACA	2	8	953979	953986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5444	NC_020532	TTTG	2	8	953993	954000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5445	NC_020532	CGT	2	6	954034	954039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5448	NC_020532	T	6	6	954069	954074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5449	NC_020532	AG	3	6	954079	954084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5450	NC_020532	TAT	2	6	954149	954154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5451	NC_020532	AT	3	6	954213	954218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5452	NC_020532	TAA	2	6	954245	954250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5453	NC_020532	AATT	2	8	955144	955151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5454	NC_020532	AAAT	2	8	955194	955201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5456	NC_020532	TTGTTT	2	12	955374	955385	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5457	NC_020532	AATC	2	8	955460	955467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5458	NC_020532	CTT	2	6	955481	955486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5461	NC_020532	AT	3	6	955562	955567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5462	NC_020532	GAA	2	6	955597	955602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5463	NC_020532	TAT	2	6	956257	956262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5464	NC_020532	TAT	2	6	956302	956307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5465	NC_020532	TAT	2	6	956352	956357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5466	NC_020532	AGG	2	6	956387	956392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5468	NC_020532	AAATTA	2	12	956419	956430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5493	NC_020532	AT	3	6	963414	963419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_020532	A	7	7	963504	963510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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