MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020529	AGC	2	6	1416096	1416101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_020529	TATACA	2	12	1416104	1416115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8003	NC_020529	TAT	2	6	1416210	1416215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_020529	TAT	2	6	1416324	1416329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_020529	GA	3	6	1416346	1416351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_020529	ACAAA	2	10	1416352	1416361	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8007	NC_020529	ATTA	2	8	1416397	1416404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_020529	AATA	2	8	1416410	1416417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_020529	TGATG	2	10	1416432	1416441	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_020529	CTC	2	6	1416452	1416457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_020529	TTG	2	6	1448373	1448378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_020529	TGT	2	6	1448388	1448393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_020529	CATTC	2	10	1448438	1448447	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8014	NC_020529	ATTT	2	8	1448538	1448545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_020529	ATA	2	6	1448558	1448563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_020529	AT	3	6	1448571	1448576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_020529	TAA	2	6	1448607	1448612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_020529	TAAA	2	8	1448616	1448623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_020529	TAA	2	6	1448638	1448643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_020529	A	6	6	1448642	1448647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_020529	AAT	2	6	1448669	1448674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_020529	ATT	2	6	1452776	1452781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_020529	ATT	2	6	1453940	1453945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_020529	ATTA	3	12	1453976	1453987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_020529	TAA	2	6	1454011	1454016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_020529	AT	3	6	1454024	1454029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_020529	TATTCT	2	12	1454030	1454041	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8028	NC_020529	TATT	2	8	1454069	1454076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_020529	TAAT	2	8	1454127	1454134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_020529	T	6	6	1454143	1454148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_020529	TAA	2	6	1454153	1454158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_020529	ATTT	2	8	1454192	1454199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_020529	TATC	2	8	1454244	1454251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8034	NC_020529	TTAT	2	8	1454262	1454269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_020529	CTT	2	6	1455268	1455273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_020529	GTTC	2	8	1458733	1458740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8037	NC_020529	TGCT	2	8	1458750	1458757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8038	NC_020529	TAT	2	6	1458823	1458828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_020529	GCT	2	6	1458846	1458851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_020529	AAT	2	6	1458866	1458871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_020529	TTC	2	6	1458877	1458882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_020529	ATC	2	6	1458924	1458929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_020529	AAAT	2	8	1458946	1458953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_020529	CA	3	6	1458970	1458975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_020529	GGGA	2	8	1459009	1459016	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_020529	TC	3	6	1460406	1460411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_020529	TAA	2	6	1460434	1460439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_020529	T	6	6	1460479	1460484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_020529	A	6	6	1460497	1460502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_020529	AAG	2	6	1460518	1460523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_020529	CTT	2	6	1460533	1460538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_020529	T	6	6	1460559	1460564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020529	TCA	2	6	1460592	1460597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_020529	TCA	2	6	1460615	1460620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_020529	CAT	2	6	1460655	1460660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_020529	T	6	6	1460689	1460694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_020529	T	6	6	1460808	1460813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_020529	A	6	6	1460820	1460825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_020529	AAC	2	6	1460854	1460859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_020529	T	7	7	1460886	1460892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_020529	CTC	2	6	1460906	1460911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8062	NC_020529	TAT	2	6	1460929	1460934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_020529	ATT	2	6	1460947	1460952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_020529	T	6	6	1462171	1462176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_020529	CAA	2	6	1462186	1462191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_020529	A	6	6	1462291	1462296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_020529	CAT	2	6	1462303	1462308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_020529	TAG	2	6	1462324	1462329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_020529	TGTTC	2	10	1462348	1462357	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8070	NC_020529	TCA	2	6	1462366	1462371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_020529	GT	3	6	1462435	1462440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_020529	TCA	2	6	1462634	1462639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_020529	ATC	2	6	1462655	1462660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_020529	TG	3	6	1462667	1462672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_020529	TA	3	6	1462689	1462694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_020529	ATT	2	6	1462741	1462746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_020529	ATT	2	6	1462777	1462782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_020529	ATT	2	6	1462832	1462837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_020529	TGT	3	9	1462850	1462858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_020529	ATT	2	6	1462859	1462864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_020529	GAA	2	6	1462866	1462871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_020529	TTC	2	6	1462919	1462924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8084	NC_020529	TCT	2	6	1462950	1462955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_020529	ATT	2	6	1462973	1462978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_020529	T	6	6	1462990	1462995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_020529	CTT	2	6	1463032	1463037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_020529	T	6	6	1463062	1463067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_020529	T	6	6	1463122	1463127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_020529	TAA	2	6	1463874	1463879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_020529	TTG	3	9	1463962	1463970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_020529	TGT	2	6	1464000	1464005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_020529	CCT	2	6	1464050	1464055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_020529	T	6	6	1464059	1464064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_020529	TA	3	6	1464106	1464111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_020529	T	6	6	1464126	1464131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_020529	TA	3	6	1464174	1464179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_020529	TGT	2	6	1464201	1464206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_020529	TAA	2	6	1464231	1464236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_020529	CTG	2	6	1464260	1464265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_020529	AAC	2	6	1464269	1464274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_020529	TACTTG	2	12	1464278	1464289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8107	NC_020529	AAAAAT	2	12	1464294	1464305	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_020529	AATT	2	8	1464384	1464391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_020529	TG	3	6	1464397	1464402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_020529	TAT	2	6	1464429	1464434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_020529	ATT	2	6	1464438	1464443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_020529	TCT	2	6	1465213	1465218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8115	NC_020529	A	6	6	1465260	1465265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_020529	T	7	7	1467431	1467437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_020529	TTC	2	6	1467441	1467446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_020529	TGG	2	6	1467455	1467460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_020529	T	7	7	1467479	1467485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_020529	TAG	2	6	1467513	1467518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8122	NC_020529	GTT	2	6	1467618	1467623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_020529	ATG	2	6	1467821	1467826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_020529	GACAC	2	10	1467861	1467870	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8125	NC_020529	TG	3	6	1467889	1467894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_020529	CATT	2	8	1467982	1467989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_020529	TCTT	2	8	1468067	1468074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_020529	AAT	2	6	1468160	1468165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_020529	T	6	6	1468932	1468937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_020529	AT	3	6	1469702	1469707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_020529	TAG	2	6	1469713	1469718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8401	NC_020529	GATA	2	8	1528910	1528917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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