MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020307	TTA	2	6	1268886	1268891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020307	AAT	2	6	1268896	1268901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020307	AAC	2	6	1268945	1268950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_020307	TAT	2	6	1270043	1270048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020307	AATA	2	8	1270085	1270092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020307	A	7	7	1270150	1270156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020307	A	6	6	1272826	1272831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020307	GTT	2	6	1273043	1273048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020307	GCCT	2	8	1274308	1274315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_020307	T	6	6	1274433	1274438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020307	AG	3	6	1274451	1274456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020307	T	8	8	1275898	1275905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020307	TAT	2	6	1275923	1275928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_020307	TAAA	2	8	1275936	1275943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_020307	CTG	2	6	1276125	1276130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_020307	CAAA	2	8	1276154	1276161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_020307	ATAAA	2	10	1276184	1276193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_020307	AAT	2	6	1276194	1276199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_020307	GTT	2	6	1276233	1276238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_020307	T	6	6	1276274	1276279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_020307	A	7	7	1276443	1276449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020307	TAA	2	6	1276460	1276465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_020307	CAG	2	6	1277562	1277567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_020307	T	7	7	1277609	1277615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020307	TC	3	6	1277617	1277622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_020307	A	6	6	1278961	1278966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020307	GTT	2	6	1280325	1280330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020307	ACA	2	6	1280453	1280458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_020307	CTT	2	6	1280471	1280476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_020307	TGC	2	6	1282368	1282373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_020307	TA	3	6	1282454	1282459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020307	CCTAA	2	10	1282478	1282487	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4033	NC_020307	AAG	2	6	1282492	1282497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020307	GA	3	6	1282520	1282525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020307	GGC	2	6	1282545	1282550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_020307	CGC	2	6	1282554	1282559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_020307	TTG	2	6	1282584	1282589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_020307	GGC	2	6	1282598	1282603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_020307	AAGCG	2	10	1282632	1282641	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4040	NC_020307	ATT	2	6	1282656	1282661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020307	GGCT	2	8	1289955	1289962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_020307	TCC	2	6	1290041	1290046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_020307	A	6	6	1290058	1290063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_020307	TAA	2	6	1291757	1291762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_020307	CGT	2	6	1291767	1291772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_020307	GAA	2	6	1291804	1291809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_020307	TGA	2	6	1291853	1291858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_020307	TCC	2	6	1292866	1292871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_020307	TCA	2	6	1294163	1294168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_020307	A	6	6	1296915	1296920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_020307	TTG	2	6	1296928	1296933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_020307	T	6	6	1299239	1299244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020307	GCA	2	6	1299263	1299268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_020307	A	6	6	1299268	1299273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_020307	A	6	6	1299332	1299337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_020307	T	6	6	1299353	1299358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_020307	TCC	2	6	1299671	1299676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_020307	GATT	2	8	1299710	1299717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_020307	GGC	2	6	1299721	1299726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_020307	GCC	2	6	1299731	1299736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_020307	GTT	2	6	1301550	1301555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020307	TAC	2	6	1301590	1301595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_020307	CGC	2	6	1302330	1302335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_020307	AAT	2	6	1302409	1302414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020307	TAT	2	6	1303248	1303253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020307	A	6	6	1303254	1303259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_020307	ATC	2	6	1303280	1303285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_020307	GC	3	6	1303336	1303341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_020307	AGA	2	6	1303363	1303368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_020307	A	6	6	1304668	1304673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_020307	A	6	6	1304710	1304715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_020307	CAC	2	6	1305820	1305825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_020307	CCTG	2	8	1305838	1305845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_020307	CGC	2	6	1305903	1305908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_020307	GAG	2	6	1305926	1305931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_020307	GC	3	6	1306796	1306801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_020307	TATT	2	8	1308663	1308670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_020307	TAA	2	6	1308692	1308697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_020307	GTT	2	6	1308713	1308718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_020307	ATTAA	2	10	1308722	1308731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_020307	TTG	2	6	1308755	1308760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_020307	ATTA	2	8	1308771	1308778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_020307	GCA	2	6	1308784	1308789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_020307	GGA	2	6	1308790	1308795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_020307	ATTT	2	8	1308833	1308840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_020307	TTA	2	6	1308841	1308846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_020307	TCG	2	6	1308961	1308966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4091	NC_020307	AG	4	8	1308979	1308986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_020307	TAAA	2	8	1309874	1309881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_020307	A	6	6	1309879	1309884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_020307	AAG	2	6	1309892	1309897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_020307	A	6	6	1312227	1312232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020307	ATT	2	6	1313236	1313241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_020307	T	6	6	1313276	1313281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_020307	GCG	2	6	1313366	1313371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_020307	ATT	2	6	1313426	1313431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_020307	CAA	2	6	1313445	1313450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_020307	A	6	6	1313469	1313474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_020307	T	6	6	1313706	1313711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_020307	CCG	2	6	1314688	1314693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_020307	CTG	3	9	1314753	1314761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_020307	AG	3	6	1316378	1316383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_020307	ATTTT	2	10	1316419	1316428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_020307	ATT	2	6	1316458	1316463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_020307	CAT	2	6	1317710	1317715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_020307	GATTT	2	10	1317778	1317787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_020307	AT	3	6	1317805	1317810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_020307	TCT	2	6	1317910	1317915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_020307	GGC	2	6	1317967	1317972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_020307	CTG	2	6	1321973	1321978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_020307	A	8	8	1321987	1321994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020307	TA	3	6	1322018	1322023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_020307	AT	3	6	1322048	1322053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020307	A	6	6	1322058	1322063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020307	TAGGG	2	10	1322117	1322126	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020307	ATT	2	6	1322127	1322132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020307	A	7	7	1322153	1322159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020307	AGA	3	9	1322179	1322187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020307	AAT	2	6	1323511	1323516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020307	TGA	2	6	1323536	1323541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020307	TGA	2	6	1323558	1323563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020307	CGA	2	6	1323610	1323615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_020307	CAA	2	6	1323619	1323624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_020307	TCA	3	9	1323686	1323694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_020307	CAT	2	6	1323713	1323718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_020307	AGA	2	6	1325794	1325799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_020307	TTG	2	6	1325812	1325817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_020307	TC	3	6	1330532	1330537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_020307	TTCC	2	8	1330542	1330549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_020307	CCTG	2	8	1330555	1330562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4134	NC_020307	GC	3	6	1330630	1330635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_020307	CATG	2	8	1330748	1330755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4137	NC_020307	CATA	2	8	1330767	1330774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4138	NC_020307	T	7	7	1330781	1330787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4142	NC_020307	TGA	2	6	1330931	1330936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4157	NC_020307	ATGA	2	8	1336996	1337003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_020307	C	7	7	1339810	1339816	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4165	NC_020307	G	6	6	1339889	1339894	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4222	NC_020307	ATCG	2	8	1368126	1368133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4254	NC_020307	A	6	6	1380528	1380533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_020307	TCC	2	6	1384173	1384178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4261	NC_020307	A	7	7	1384876	1384882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_020307	ACC	2	6	1386950	1386955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_020307	AC	3	6	1386974	1386979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4264	NC_020307	CAC	2	6	1386984	1386989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4266	NC_020307	TAA	2	6	1387010	1387015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_020307	ACG	2	6	1387023	1387028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4398	NC_020307	TC	3	6	1441053	1441058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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