MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020307	TG	3	6	1088796	1088801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_020307	G	6	6	1088911	1088916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020307	GAC	2	6	1088929	1088934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_020307	G	6	6	1088936	1088941	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020307	AAT	2	6	1088958	1088963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_020307	AGC	2	6	1088968	1088973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_020307	ACT	2	6	1089025	1089030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_020307	TA	3	6	1089044	1089049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_020307	TA	3	6	1089767	1089772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_020307	A	6	6	1090853	1090858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_020307	T	6	6	1090880	1090885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_020307	TCC	2	6	1092150	1092155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_020307	AGGG	2	8	1092156	1092163	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020307	TAA	2	6	1092594	1092599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_020307	TA	3	6	1095290	1095295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_020307	GGC	2	6	1095323	1095328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_020307	TCG	2	6	1096431	1096436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_020307	CG	3	6	1096553	1096558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_020307	CTC	2	6	1096742	1096747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_020307	GC	3	6	1097310	1097315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_020307	AAT	2	6	1097376	1097381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020307	CA	3	6	1097385	1097390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_020307	TCA	2	6	1097473	1097478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_020307	A	6	6	1097497	1097502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020307	TCAGT	2	10	1098386	1098395	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3526	NC_020307	C	6	6	1098551	1098556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3527	NC_020307	CAAAA	2	10	1099426	1099435	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3528	NC_020307	G	6	6	1100446	1100451	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020307	CA	3	6	1100481	1100486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_020307	TTA	2	6	1100551	1100556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020307	A	6	6	1100579	1100584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020307	AAT	2	6	1100645	1100650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020307	ATC	2	6	1100719	1100724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3535	NC_020307	TCT	2	6	1100805	1100810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3538	NC_020307	AAT	2	6	1101001	1101006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_020307	T	6	6	1104259	1104264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_020307	GCGG	2	8	1104316	1104323	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_020307	ATA	2	6	1104325	1104330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_020307	GAC	2	6	1104380	1104385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_020307	A	7	7	1104387	1104393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_020307	GTT	2	6	1107124	1107129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_020307	CGG	2	6	1109961	1109966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3547	NC_020307	TCC	2	6	1114319	1114324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_020307	CG	4	8	1114364	1114371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_020307	TATT	2	8	1114403	1114410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_020307	TGCT	2	8	1114418	1114425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_020307	ATG	2	6	1115175	1115180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_020307	ATAA	2	8	1115215	1115222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_020307	ATT	2	6	1117712	1117717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_020307	TAT	2	6	1117733	1117738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_020307	AT	3	6	1117750	1117755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_020307	ATT	2	6	1117804	1117809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_020307	TAC	2	6	1117839	1117844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_020307	TCCT	2	8	1120068	1120075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_020307	T	6	6	1120148	1120153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_020307	TGC	2	6	1120158	1120163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_020307	TGA	2	6	1120171	1120176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_020307	A	7	7	1120205	1120211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_020307	A	6	6	1120233	1120238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_020307	CGC	3	9	1120244	1120252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3567	NC_020307	GGA	2	6	1121554	1121559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_020307	CGCC	2	8	1122213	1122220	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3569	NC_020307	GGC	2	6	1122222	1122227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_020307	GCC	2	6	1122239	1122244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_020307	TGC	2	6	1122288	1122293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_020307	GC	3	6	1122907	1122912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_020307	T	7	7	1122921	1122927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_020307	TTA	2	6	1122995	1123000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_020307	TTG	2	6	1124061	1124066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_020307	AT	4	8	1124087	1124094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_020307	ATGT	2	8	1124383	1124390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_020307	TGA	2	6	1124426	1124431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_020307	A	7	7	1124471	1124477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_020307	ATGA	2	8	1124479	1124486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_020307	TCC	2	6	1124531	1124536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_020307	TTA	2	6	1124565	1124570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_020307	CT	3	6	1124926	1124931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3591	NC_020307	TTA	2	6	1126167	1126172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3593	NC_020307	ACA	2	6	1126441	1126446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3596	NC_020307	TTAT	2	8	1126486	1126493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_020307	TC	3	6	1126529	1126534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_020307	GT	3	6	1126550	1126555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_020307	A	6	6	1128830	1128835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_020307	GGCA	2	8	1128843	1128850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_020307	CA	3	6	1128880	1128885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_020307	AAC	2	6	1128922	1128927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_020307	ATAATT	2	12	1130031	1130042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_020307	TGA	2	6	1130062	1130067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_020307	CAT	2	6	1130082	1130087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3608	NC_020307	TG	3	6	1136185	1136190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_020307	CGATC	2	10	1136198	1136207	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3610	NC_020307	GC	3	6	1136259	1136264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_020307	CGCGC	2	10	1136430	1136439	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3612	NC_020307	TGT	2	6	1136474	1136479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_020307	CAT	2	6	1136546	1136551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_020307	T	6	6	1136602	1136607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_020307	TGT	2	6	1136633	1136638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_020307	TGG	2	6	1136662	1136667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_020307	CT	3	6	1136781	1136786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_020307	ATA	2	6	1136800	1136805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_020307	CTGGTG	2	12	1136844	1136855	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3620	NC_020307	A	6	6	1136896	1136901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_020307	CAAG	2	8	1136911	1136918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_020307	CGC	2	6	1136927	1136932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_020307	T	7	7	1136959	1136965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_020307	CTG	2	6	1136967	1136972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3626	NC_020307	ATT	2	6	1137000	1137005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_020307	T	6	6	1137081	1137086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_020307	TTCA	2	8	1137105	1137112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_020307	GC	3	6	1137126	1137131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_020307	CAC	2	6	1137134	1137139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_020307	CTG	2	6	1137189	1137194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_020307	GCG	2	6	1137211	1137216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3634	NC_020307	TATC	2	8	1137356	1137363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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