MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020307	AGC	2	6	328262	328267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_020307	ATG	2	6	328319	328324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020307	AGG	2	6	328328	328333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020307	GCG	2	6	330552	330557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020307	GCTTTA	2	12	331022	331033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1006	NC_020307	CAT	2	6	331085	331090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_020307	ATTA	2	8	331099	331106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020307	AC	3	6	331143	331148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_020307	TTTA	2	8	331160	331167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020307	AGG	2	6	331222	331227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020307	ATTA	2	8	331245	331252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020307	ATA	2	6	331316	331321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020307	TAT	2	6	331332	331337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020307	AG	3	6	331355	331360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020307	A	6	6	331365	331370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020307	CAG	2	6	331397	331402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_020307	TTA	2	6	331430	331435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020307	AGTA	2	8	331471	331478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020307	GCT	2	6	331675	331680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_020307	CTT	2	6	331699	331704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_020307	CAG	2	6	332730	332735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_020307	GCT	2	6	332751	332756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020307	T	8	8	332756	332763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020307	GCCTT	2	10	332764	332773	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_020307	GAT	2	6	332821	332826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020307	TGAG	2	8	336665	336672	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020307	AAT	2	6	336678	336683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020307	CCA	2	6	337239	337244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_020307	CGC	2	6	337301	337306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_020307	AAAGT	2	10	337362	337371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020307	TG	3	6	339097	339102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020307	CCG	2	6	339130	339135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_020307	A	6	6	339168	339173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020307	GC	3	6	339207	339212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_020307	AAG	2	6	339235	339240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020307	AGT	2	6	341165	341170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020307	T	6	6	342223	342228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020307	GCGCT	2	10	342238	342247	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1039	NC_020307	T	6	6	342333	342338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020307	CAT	2	6	342376	342381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_020307	TGC	2	6	342408	342413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_020307	CTTT	2	8	346035	346042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_020307	CT	3	6	346061	346066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_020307	AATA	2	8	346072	346079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020307	AGGT	2	8	346104	346111	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020307	AGCTT	2	10	346178	346187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_020307	CGG	2	6	346211	346216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_020307	GCA	2	6	346228	346233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_020307	TACCTG	2	12	349330	349341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_020307	CCG	2	6	349348	349353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_020307	TC	3	6	349402	349407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_020307	TGA	2	6	349495	349500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020307	ACG	2	6	349506	349511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_020307	GC	4	8	351348	351355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_020307	AATCA	2	10	351413	351422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_020307	GGTT	2	8	351425	351432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020307	AAG	2	6	351471	351476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020307	CAT	2	6	352836	352841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_020307	ATG	2	6	352852	352857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020307	T	7	7	352896	352902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020307	GCA	2	6	352922	352927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_020307	GCC	2	6	352934	352939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_020307	CTAC	2	8	352961	352968	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_020307	TGC	2	6	352982	352987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_020307	GCC	2	6	352991	352996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_020307	TGC	2	6	352998	353003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_020307	GCG	2	6	356702	356707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_020307	CAGT	2	8	356764	356771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_020307	GCC	2	6	356864	356869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_020307	T	6	6	356870	356875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020307	TCG	2	6	356910	356915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_020307	GGCA	2	8	356923	356930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_020307	CAT	2	6	358756	358761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1075	NC_020307	TCA	2	6	358797	358802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_020307	GCG	2	6	358807	358812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_020307	CAA	2	6	358825	358830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_020307	GC	3	6	359297	359302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_020307	T	7	7	359303	359309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020307	CGG	2	6	360079	360084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_020307	ATT	2	6	361233	361238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020307	AAAT	2	8	361241	361248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020307	TATT	2	8	361255	361262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020307	AT	3	6	361360	361365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020307	GGA	2	6	361371	361376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020307	GGT	2	6	361382	361387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020307	TCA	2	6	361395	361400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_020307	TGA	2	6	361437	361442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020307	TAT	2	6	361494	361499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020307	TTA	2	6	361511	361516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020307	GTT	2	6	361561	361566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020307	T	7	7	361565	361571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020307	ATT	3	9	361593	361601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020307	GCAG	2	8	361725	361732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_020307	A	7	7	361767	361773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020307	GAT	2	6	361782	361787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020307	CAT	2	6	361793	361798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_020307	GCTG	2	8	361835	361842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_020307	GTT	2	6	361848	361853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020307	AT	5	10	361865	361874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020307	TGA	2	6	361878	361883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020307	GCA	2	6	361927	361932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_020307	AGC	2	6	361947	361952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_020307	TAG	2	6	361971	361976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020307	TAT	2	6	361996	362001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020307	GAT	2	6	362101	362106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020307	ACA	2	6	362110	362115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_020307	ATT	2	6	362145	362150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020307	T	6	6	362170	362175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020307	ATT	2	6	362216	362221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020307	G	6	6	362312	362317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020307	ATATT	2	10	362336	362345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020307	ATT	2	6	362396	362401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020307	CGT	2	6	362511	362516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_020307	T	7	7	362587	362593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020307	AGCGC	2	10	364320	364329	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_020307	AC	3	6	364339	364344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_020307	CA	3	6	365933	365938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_020307	GAT	2	6	365947	365952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020307	AG	3	6	369346	369351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020307	TAC	2	6	369373	369378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_020307	TGA	2	6	369380	369385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020307	GGA	2	6	369394	369399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020307	AAC	2	6	370865	370870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_020307	ATG	2	6	371872	371877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020307	GGC	2	6	371914	371919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_020307	A	6	6	371942	371947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020307	T	8	8	371955	371962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020307	TG	3	6	371999	372004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020307	TTA	2	6	372019	372024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020307	TAA	2	6	372121	372126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020307	GAG	2	6	372168	372173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020307	CACT	2	8	373662	373669	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_020307	GGT	2	6	373674	373679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_020307	CAT	2	6	373808	373813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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