MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020307	AAGCG	2	10	4302585	4302594	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12502	NC_020307	GCC	2	6	4303459	4303464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_020307	CCT	2	6	4303476	4303481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12504	NC_020307	TCTG	2	8	4303536	4303543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12505	NC_020307	AAG	2	6	4303569	4303574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_020307	CGG	2	6	4303732	4303737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_020307	ATA	2	6	4303753	4303758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_020307	CAT	2	6	4304006	4304011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_020307	A	6	6	4304697	4304702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_020307	TGA	2	6	4304747	4304752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_020307	A	6	6	4304787	4304792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020307	TTA	2	6	4304800	4304805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_020307	AAT	2	6	4304812	4304817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020307	AGA	2	6	4305838	4305843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020307	TGGC	2	8	4305852	4305859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12516	NC_020307	CAT	2	6	4305888	4305893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_020307	ATA	2	6	4305932	4305937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_020307	TCA	2	6	4305940	4305945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_020307	AT	3	6	4313246	4313251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_020307	TTTAA	2	10	4313263	4313272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_020307	ATT	2	6	4313291	4313296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_020307	TTG	2	6	4318062	4318067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_020307	ATTTT	2	10	4318077	4318086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_020307	A	7	7	4318087	4318093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_020307	AAC	2	6	4318151	4318156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_020307	ATT	2	6	4318665	4318670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12530	NC_020307	AAT	2	6	4320034	4320039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_020307	AAT	2	6	4320064	4320069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_020307	CAA	2	6	4320112	4320117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_020307	TAAC	2	8	4320188	4320195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12534	NC_020307	GGGC	2	8	4320213	4320220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12535	NC_020307	TCG	2	6	4320229	4320234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12538	NC_020307	GTTC	2	8	4322482	4322489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12539	NC_020307	A	6	6	4325654	4325659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_020307	GC	3	6	4325710	4325715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12541	NC_020307	TGA	2	6	4325722	4325727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_020307	T	7	7	4325728	4325734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_020307	GCGCT	2	10	4327254	4327263	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12544	NC_020307	GAG	2	6	4327299	4327304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_020307	GCAGA	2	10	4327554	4327563	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12546	NC_020307	ATT	2	6	4327685	4327690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_020307	AAAT	2	8	4327709	4327716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_020307	CTTT	2	8	4327722	4327729	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12549	NC_020307	TTTA	2	8	4327730	4327737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_020307	AT	3	6	4327787	4327792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_020307	GTTA	2	8	4327801	4327808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_020307	ATC	2	6	4327822	4327827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_020307	ATA	2	6	4327831	4327836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_020307	GCG	2	6	4327847	4327852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_020307	TTTA	2	8	4327855	4327862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_020307	CCAG	2	8	4330090	4330097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12557	NC_020307	GAAT	2	8	4331189	4331196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_020307	GC	3	6	4336828	4336833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_020307	A	7	7	4344274	4344280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_020307	CATT	2	8	4344326	4344333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12561	NC_020307	CAC	2	6	4344362	4344367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12562	NC_020307	GT	3	6	4344380	4344385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_020307	AAT	2	6	4344440	4344445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_020307	CGCAGC	2	12	4344460	4344471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12565	NC_020307	AT	3	6	4344564	4344569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_020307	TCAT	2	8	4344584	4344591	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12567	NC_020307	GATA	2	8	4344613	4344620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_020307	TAA	2	6	4344685	4344690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_020307	ATA	2	6	4344701	4344706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_020307	GAT	2	6	4344717	4344722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_020307	TCAT	2	8	4344728	4344735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12572	NC_020307	TTAT	2	8	4344751	4344758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_020307	TA	3	6	4344772	4344777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_020307	AATCAA	2	12	4344803	4344814	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12575	NC_020307	TTA	2	6	4344831	4344836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12581	NC_020307	TTTA	2	8	4355606	4355613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_020307	GCA	2	6	4355693	4355698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12587	NC_020307	ACAA	2	8	4356306	4356313	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12588	NC_020307	ATA	2	6	4356320	4356325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_020307	TGA	2	6	4356332	4356337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12591	NC_020307	GCT	2	6	4356407	4356412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_020307	CAT	2	6	4356463	4356468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12595	NC_020307	TG	3	6	4356590	4356595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_020307	CCAT	2	8	4356631	4356638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12597	NC_020307	AAG	2	6	4356701	4356706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12599	NC_020307	CCA	2	6	4356810	4356815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12601	NC_020307	GAT	2	6	4356974	4356979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12603	NC_020307	AGG	2	6	4357085	4357090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_020307	A	6	6	4357091	4357096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_020307	GGC	2	6	4357124	4357129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12607	NC_020307	AAT	2	6	4360112	4360117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_020307	AGT	2	6	4360140	4360145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_020307	TTAT	2	8	4360227	4360234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_020307	ATT	2	6	4360246	4360251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_020307	CAT	2	6	4360259	4360264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_020307	T	7	7	4360281	4360287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_020307	GCG	2	6	4360292	4360297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_020307	ACT	2	6	4360365	4360370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_020307	TAA	2	6	4361947	4361952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_020307	A	7	7	4361984	4361990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_020307	T	7	7	4362019	4362025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_020307	A	6	6	4362031	4362036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_020307	AGGGA	2	10	4362087	4362096	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_020307	ATA	2	6	4362133	4362138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12622	NC_020307	TAA	2	6	4362612	4362617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_020307	TAA	2	6	4362646	4362651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_020307	CAT	2	6	4362685	4362690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_020307	CTGT	2	8	4362714	4362721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12626	NC_020307	G	6	6	4362740	4362745	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_020307	CTG	2	6	4362748	4362753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12628	NC_020307	CGC	2	6	4364982	4364987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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