MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020307	AATT	2	8	167493	167500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020307	ATGA	2	8	169566	169573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020307	G	10	10	175214	175223	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020307	T	6	6	177138	177143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020307	A	6	6	179501	179506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020307	TAT	2	6	179516	179521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020307	GAT	2	6	179563	179568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020307	TA	3	6	179635	179640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020307	GTT	2	6	179666	179671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020307	TCTT	2	8	179738	179745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_020307	TAT	2	6	179794	179799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020307	T	6	6	179811	179816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020307	TAT	2	6	179851	179856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020307	TAA	2	6	179881	179886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020307	GCTT	2	8	179894	179901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_020307	ATTT	2	8	179904	179911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020307	TAA	2	6	179974	179979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020307	GTC	2	6	179986	179991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020307	TATTT	2	10	184939	184948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020307	AAT	3	9	186429	186437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020307	T	8	8	188019	188026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020307	TAA	2	6	188070	188075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020307	TA	3	6	188130	188135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020307	CAT	2	6	188178	188183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020307	TGA	2	6	189399	189404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020307	GAT	2	6	189410	189415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020307	AAT	2	6	189432	189437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020307	AT	3	6	189466	189471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020307	T	7	7	189506	189512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020307	CTT	2	6	190511	190516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020307	TGG	2	6	190524	190529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020307	A	6	6	190572	190577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020307	T	7	7	190593	190599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020307	AGCGC	2	10	196817	196826	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
535	NC_020307	CG	3	6	197779	197784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_020307	A	8	8	197787	197794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020307	GAT	2	6	197805	197810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020307	CAC	2	6	197839	197844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_020307	CA	3	6	197868	197873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_020307	GAT	2	6	197894	197899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020307	TGA	2	6	197902	197907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020307	TGG	2	6	197908	197913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020307	T	6	6	198009	198014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020307	GTCA	2	8	198039	198046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_020307	CGG	2	6	198047	198052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_020307	CAG	2	6	198933	198938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020307	AATC	2	8	199885	199892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_020307	T	6	6	199908	199913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020307	CGC	2	6	199963	199968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_020307	A	6	6	199973	199978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020307	T	7	7	200013	200019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020307	CAT	2	6	200030	200035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020307	GATA	2	8	200065	200072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020307	CTTA	2	8	200073	200080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_020307	GTT	2	6	200091	200096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020307	T	6	6	200126	200131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020307	CG	3	6	201529	201534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_020307	TAT	2	6	201535	201540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020307	T	6	6	201574	201579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020307	GGC	2	6	201607	201612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020307	TATATG	2	12	203114	203125	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020307	TTGA	2	8	203152	203159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020307	TTG	2	6	203183	203188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020307	A	6	6	203354	203359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020307	CAT	2	6	205019	205024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_020307	AT	3	6	205070	205075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020307	TTTGAA	2	12	205090	205101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020307	ATA	2	6	205117	205122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020307	G	6	6	205146	205151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020307	TGA	2	6	205278	205283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020307	GAGG	2	8	205308	205315	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020307	TGG	2	6	205323	205328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020307	TGAT	2	8	205425	205432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020307	TGC	2	6	205455	205460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_020307	TCT	3	9	205477	205485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_020307	TAT	2	6	205505	205510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020307	TGTTT	2	10	205542	205551	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020307	AAG	2	6	205576	205581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020307	T	6	6	205589	205594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020307	TAAT	2	8	205721	205728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020307	T	6	6	205728	205733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020307	TAG	2	6	205748	205753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020307	AATT	2	8	205757	205764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020307	TGA	2	6	205770	205775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020307	CAT	2	6	205801	205806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_020307	AAGT	2	8	205841	205848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020307	TTTC	2	8	205902	205909	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_020307	CAT	2	6	205928	205933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_020307	AG	3	6	205983	205988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020307	CGGGT	2	10	205989	205998	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
591	NC_020307	ATT	2	6	206162	206167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020307	GTT	2	6	206209	206214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020307	CTG	2	6	206223	206228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020307	ATT	2	6	206229	206234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020307	AAC	2	6	206316	206321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_020307	ATA	2	6	206353	206358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020307	TAA	2	6	206387	206392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020307	AGG	2	6	206394	206399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020307	ATAAA	2	10	210043	210052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020307	TGTT	2	8	210101	210108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020307	CGTG	2	8	211992	211999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
602	NC_020307	T	6	6	212032	212037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020307	TGAA	2	8	213134	213141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020307	TGC	2	6	213147	213152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_020307	GGC	2	6	213274	213279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_020307	CGAATC	2	12	213331	213342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_020307	TTA	2	6	214655	214660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020307	CGT	2	6	214679	214684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_020307	CAG	2	6	215849	215854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_020307	AAG	2	6	230547	230552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020307	AAT	2	6	230596	230601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020307	ATTTA	2	10	230657	230666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020307	ATT	2	6	230681	230686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020307	TAT	2	6	230694	230699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020307	TAT	2	6	230807	230812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020307	ATG	2	6	230848	230853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020307	GCT	2	6	230855	230860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_020307	AGGC	2	8	230911	230918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
619	NC_020307	CAA	2	6	230930	230935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020307	ATG	2	6	231853	231858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020307	TAA	2	6	231979	231984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020307	TGTTT	2	10	232004	232013	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020307	AGAA	2	8	233012	233019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020307	CAA	2	6	233054	233059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020307	AAT	2	6	233060	233065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020307	TGA	2	6	233104	233109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020307	TTA	2	6	233135	233140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020307	ATT	2	6	233248	233253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020307	GCT	2	6	233350	233355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020307	GAC	2	6	233364	233369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020307	GAG	2	6	233410	233415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020307	AGA	2	6	233427	233432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020307	CCTG	2	8	233433	233440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
634	NC_020307	CAA	2	6	233452	233457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_020307	ACC	2	6	233529	233534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_020307	GAC	2	6	235890	235895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_020307	ATT	2	6	248959	248964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_020307	A	6	6	250080	250085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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