MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_020307	CTTA	2	8	2177178	2177185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6502	NC_020307	ATA	2	6	2177226	2177231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_020307	GTT	2	6	2177257	2177262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_020307	CAC	2	6	2178706	2178711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6505	NC_020307	GGTA	2	8	2180796	2180803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_020307	TC	3	6	2182942	2182947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_020307	TTC	2	6	2182959	2182964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_020307	CTA	2	6	2182969	2182974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_020307	TA	3	6	2183009	2183014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_020307	TGA	2	6	2183015	2183020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_020307	T	6	6	2183029	2183034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_020307	T	6	6	2183063	2183068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_020307	CAGT	2	8	2183073	2183080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6514	NC_020307	TGA	2	6	2183084	2183089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_020307	TC	3	6	2183506	2183511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_020307	AAC	2	6	2183539	2183544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_020307	ATGCG	2	10	2183612	2183621	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6518	NC_020307	GATT	2	8	2183638	2183645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_020307	A	6	6	2183713	2183718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_020307	TAAT	2	8	2183734	2183741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_020307	T	7	7	2183786	2183792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_020307	AC	3	6	2183808	2183813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6523	NC_020307	CCG	2	6	2183866	2183871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_020307	GCG	2	6	2183906	2183911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_020307	CAT	2	6	2183976	2183981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_020307	C	6	6	2183986	2183991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6527	NC_020307	CGT	2	6	2184037	2184042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_020307	AGGC	2	8	2184076	2184083	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6529	NC_020307	TA	3	6	2184118	2184123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_020307	GC	3	6	2184164	2184169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6531	NC_020307	TTC	2	6	2184224	2184229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_020307	ATA	2	6	2184230	2184235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_020307	AAT	2	6	2184274	2184279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_020307	CCA	2	6	2184292	2184297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_020307	TTC	2	6	2184311	2184316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_020307	GCT	2	6	2184338	2184343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_020307	CTG	2	6	2184407	2184412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_020307	TGC	2	6	2184655	2184660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_020307	GCAG	2	8	2184662	2184669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6540	NC_020307	CAG	2	6	2184846	2184851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_020307	TAAAA	2	10	2186102	2186111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_020307	T	6	6	2186173	2186178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_020307	AT	3	6	2188473	2188478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_020307	TCA	2	6	2188499	2188504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_020307	AAT	2	6	2188599	2188604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_020307	T	7	7	2188618	2188624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_020307	A	6	6	2188627	2188632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_020307	TAT	2	6	2188645	2188650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_020307	AGGG	2	8	2188767	2188774	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_020307	ATT	2	6	2188881	2188886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_020307	GAT	2	6	2188895	2188900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_020307	AAT	2	6	2189258	2189263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_020307	GAC	2	6	2189291	2189296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_020307	AATA	2	8	2189300	2189307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_020307	AAC	2	6	2189309	2189314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_020307	GGC	2	6	2189337	2189342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_020307	GCT	2	6	2189414	2189419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_020307	GCA	2	6	2189723	2189728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_020307	A	7	7	2189754	2189760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_020307	TCA	2	6	2189818	2189823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_020307	ATTT	2	8	2189830	2189837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_020307	GACC	2	8	2189872	2189879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_020307	A	6	6	2189934	2189939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_020307	TAA	2	6	2189967	2189972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_020307	GCA	2	6	2189988	2189993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_020307	ATT	2	6	2189998	2190003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_020307	T	6	6	2190013	2190018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6569	NC_020307	A	6	6	2190077	2190082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_020307	AC	3	6	2190088	2190093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_020307	ATT	2	6	2190096	2190101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_020307	A	7	7	2190110	2190116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6575	NC_020307	CATAG	2	10	2190293	2190302	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6576	NC_020307	ATAAA	2	10	2190387	2190396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_020307	TTTA	2	8	2190404	2190411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6600	NC_020307	AT	3	6	2199356	2199361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_020307	T	6	6	2200073	2200078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_020307	TAA	3	9	2200139	2200147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_020307	TAA	2	6	2200245	2200250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_020307	GC	3	6	2200307	2200312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_020307	TGG	2	6	2203380	2203385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6609	NC_020307	CTG	2	6	2203633	2203638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6613	NC_020307	TTCCGG	2	12	2203709	2203720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_020307	T	6	6	2203822	2203827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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