MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020307	CGG	2	6	1798225	1798230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_020307	ATCG	2	8	1798233	1798240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_020307	A	6	6	1798699	1798704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020307	TC	3	6	1799178	1799183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_020307	G	6	6	1799208	1799213	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_020307	ATA	2	6	1799225	1799230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020307	GCT	2	6	1799239	1799244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_020307	GAT	2	6	1800836	1800841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_020307	ACA	2	6	1800875	1800880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_020307	CG	3	6	1801552	1801557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_020307	TTG	2	6	1801562	1801567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_020307	CGC	2	6	1801630	1801635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_020307	GATA	2	8	1801677	1801684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_020307	A	6	6	1802681	1802686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_020307	TGC	2	6	1802722	1802727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_020307	GCG	3	9	1802731	1802739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_020307	GCC	2	6	1802869	1802874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_020307	TTG	2	6	1802876	1802881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_020307	A	7	7	1803094	1803100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020307	A	6	6	1803180	1803185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020307	AAT	2	6	1803215	1803220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_020307	CAG	2	6	1803292	1803297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_020307	ATA	2	6	1803683	1803688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_020307	GCA	2	6	1803696	1803701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_020307	T	6	6	1803719	1803724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_020307	ATT	2	6	1806946	1806951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_020307	TAA	2	6	1808148	1808153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_020307	GCGT	2	8	1810036	1810043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5531	NC_020307	CGAT	2	8	1810112	1810119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_020307	ATTG	2	8	1810136	1810143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_020307	ATT	2	6	1810223	1810228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_020307	T	6	6	1810868	1810873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_020307	TGCG	2	8	1810875	1810882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_020307	ACC	2	6	1810892	1810897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_020307	TCA	2	6	1812778	1812783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_020307	TTA	2	6	1812793	1812798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_020307	GAG	2	6	1812802	1812807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_020307	AGG	2	6	1812813	1812818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_020307	A	6	6	1814277	1814282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_020307	GTG	2	6	1814302	1814307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_020307	TGT	2	6	1815673	1815678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_020307	GGA	2	6	1815704	1815709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_020307	GCG	2	6	1815717	1815722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_020307	T	6	6	1815723	1815728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_020307	GCG	2	6	1815762	1815767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_020307	A	6	6	1815952	1815957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020307	GTTA	2	8	1818127	1818134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020307	T	7	7	1818304	1818310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020307	ATA	2	6	1822706	1822711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020307	CACAGC	2	12	1822791	1822802	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_020307	GC	3	6	1822801	1822806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_020307	GGT	2	6	1822830	1822835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_020307	CTC	2	6	1824943	1824948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5557	NC_020307	CCG	2	6	1825989	1825994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_020307	ATT	2	6	1826312	1826317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_020307	TTA	2	6	1827056	1827061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_020307	TCG	2	6	1827064	1827069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_020307	AGC	2	6	1827133	1827138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_020307	AAT	2	6	1827169	1827174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_020307	ATTGT	2	10	1827181	1827190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_020307	ATCAT	2	10	1828115	1828124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5565	NC_020307	AAT	2	6	1828153	1828158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_020307	TCA	2	6	1828748	1828753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5569	NC_020307	TA	3	6	1831250	1831255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5572	NC_020307	ATTG	2	8	1831327	1831334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5587	NC_020307	TTTAA	2	10	1832046	1832055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_020307	TTAGC	2	10	1833341	1833350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5589	NC_020307	TGG	2	6	1833366	1833371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_020307	CGA	2	6	1838693	1838698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_020307	GCAG	2	8	1838711	1838718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5601	NC_020307	TTC	2	6	1838766	1838771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_020307	CCG	2	6	1838783	1838788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_020307	T	6	6	1838794	1838799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_020307	T	6	6	1838807	1838812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_020307	GCC	2	6	1838834	1838839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5608	NC_020307	GTC	2	6	1840049	1840054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_020307	AAT	2	6	1840730	1840735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_020307	GA	3	6	1840790	1840795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_020307	CTC	2	6	1843784	1843789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_020307	AGG	2	6	1843851	1843856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5614	NC_020307	ATT	2	6	1843886	1843891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5620	NC_020307	TA	3	6	1844157	1844162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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