MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020307	ACGG	2	8	1653329	1653336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_020307	CTG	2	6	1653389	1653394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_020307	GCG	2	6	1653396	1653401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_020307	CGTTCA	2	12	1653414	1653425	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_020307	CGG	2	6	1653488	1653493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_020307	CGC	2	6	1653529	1653534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_020307	GC	6	12	1653533	1653544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_020307	GCG	2	6	1653551	1653556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_020307	TAA	2	6	1653592	1653597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_020307	ATA	2	6	1653598	1653603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_020307	GAT	2	6	1653639	1653644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_020307	TCA	2	6	1653656	1653661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_020307	GGT	2	6	1653664	1653669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020307	GCG	2	6	1653696	1653701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_020307	ACG	2	6	1653723	1653728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_020307	ATA	2	6	1653744	1653749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_020307	TCGTCA	2	12	1653857	1653868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_020307	AGC	2	6	1653875	1653880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_020307	CCA	2	6	1653906	1653911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_020307	CAG	2	6	1653976	1653981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_020307	CGT	2	6	1654017	1654022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_020307	CAG	2	6	1654036	1654041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_020307	CGC	2	6	1654051	1654056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_020307	GCG	2	6	1654083	1654088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_020307	CGGCAG	2	12	1654117	1654128	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_020307	CGC	3	9	1654309	1654317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_020307	TCG	2	6	1654427	1654432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_020307	CCAG	2	8	1654464	1654471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_020307	CGGTA	2	10	1654485	1654494	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5030	NC_020307	GCCA	2	8	1654600	1654607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_020307	CGG	2	6	1654612	1654617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5033	NC_020307	GCG	2	6	1654776	1654781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_020307	GCC	2	6	1654904	1654909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_020307	GGT	2	6	1654930	1654935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_020307	T	6	6	1655073	1655078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_020307	CAT	2	6	1655088	1655093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_020307	CCG	2	6	1655094	1655099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_020307	CAG	2	6	1655125	1655130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_020307	CCA	2	6	1655154	1655159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_020307	ATG	2	6	1655198	1655203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_020307	ATG	2	6	1655212	1655217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_020307	GC	3	6	1655305	1655310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_020307	CAT	2	6	1655359	1655364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_020307	GGC	2	6	1655407	1655412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_020307	ACCG	2	8	1655453	1655460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5051	NC_020307	T	6	6	1655598	1655603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5056	NC_020307	TAT	2	6	1655658	1655663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_020307	GT	3	6	1655668	1655673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_020307	TTC	2	6	1655686	1655691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_020307	CAG	2	6	1655695	1655700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_020307	CGC	2	6	1655712	1655717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_020307	TG	3	6	1655744	1655749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_020307	CAT	2	6	1655790	1655795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5064	NC_020307	GAT	2	6	1655928	1655933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5067	NC_020307	TGG	2	6	1656029	1656034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_020307	CGG	2	6	1656186	1656191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_020307	GCC	2	6	1656278	1656283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_020307	GC	3	6	1656306	1656311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5082	NC_020307	GC	3	6	1656668	1656673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_020307	CTACCG	2	12	1656849	1656860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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5085	NC_020307	GCG	2	6	1656971	1656976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_020307	TAT	2	6	1658474	1658479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_020307	TA	3	6	1658488	1658493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_020307	AT	3	6	1658503	1658508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_020307	ATA	2	6	1658511	1658516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_020307	CG	3	6	1658566	1658571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_020307	CAC	2	6	1658582	1658587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5093	NC_020307	TCCC	2	8	1660913	1660920	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5094	NC_020307	GGGA	2	8	1660928	1660935	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_020307	A	6	6	1660942	1660947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_020307	TAA	2	6	1663519	1663524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_020307	CA	3	6	1663526	1663531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_020307	TGAG	2	8	1663602	1663609	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_020307	GCGAC	2	10	1663677	1663686	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5101	NC_020307	TCC	2	6	1664707	1664712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_020307	CTG	2	6	1664741	1664746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_020307	ACCA	2	8	1664764	1664771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_020307	T	6	6	1665465	1665470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_020307	ATAA	2	8	1665561	1665568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_020307	CAC	2	6	1665670	1665675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_020307	CCCT	2	8	1665684	1665691	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5108	NC_020307	TTG	2	6	1667691	1667696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_020307	ATC	3	9	1667715	1667723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_020307	TTG	2	6	1667777	1667782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_020307	A	7	7	1667801	1667807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020307	ACG	2	6	1667825	1667830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_020307	CAG	2	6	1667943	1667948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_020307	TCA	2	6	1667949	1667954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_020307	GCT	2	6	1667958	1667963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_020307	GA	3	6	1667974	1667979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_020307	A	6	6	1669264	1669269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_020307	ACGTTA	2	12	1670760	1670771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5120	NC_020307	A	7	7	1670778	1670784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_020307	GC	3	6	1670814	1670819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_020307	GACA	2	8	1670840	1670847	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_020307	T	6	6	1670913	1670918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_020307	CAT	2	6	1672169	1672174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_020307	TCA	2	6	1672175	1672180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_020307	CGA	2	6	1672210	1672215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_020307	TTTC	2	8	1673117	1673124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_020307	A	8	8	1673171	1673178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5130	NC_020307	A	6	6	1674591	1674596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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