MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020307	TA	3	6	1487027	1487032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_020307	TTTA	2	8	1487033	1487040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_020307	TGA	2	6	1487050	1487055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_020307	A	6	6	1487086	1487091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_020307	AATG	2	8	1488209	1488216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_020307	ATCT	2	8	1488228	1488235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_020307	AAT	2	6	1488278	1488283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_020307	A	7	7	1488297	1488303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_020307	ATT	2	6	1488369	1488374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_020307	CTG	2	6	1488385	1488390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_020307	CGG	2	6	1488401	1488406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_020307	TGAC	2	8	1488437	1488444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4513	NC_020307	CCA	2	6	1488478	1488483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_020307	A	6	6	1488891	1488896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_020307	ATG	2	6	1488953	1488958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_020307	TGA	2	6	1488969	1488974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_020307	TC	3	6	1490651	1490656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_020307	AAC	2	6	1491748	1491753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_020307	TAA	2	6	1491766	1491771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_020307	AAT	2	6	1491837	1491842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_020307	GGC	2	6	1491863	1491868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_020307	AGCGC	2	10	1491918	1491927	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4523	NC_020307	TGG	2	6	1492013	1492018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_020307	TCGCC	2	10	1492040	1492049	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4525	NC_020307	TGG	2	6	1492112	1492117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_020307	TCGCT	2	10	1492133	1492142	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4527	NC_020307	TGG	2	6	1492266	1492271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4529	NC_020307	TCGCC	2	10	1492403	1492412	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4530	NC_020307	ACC	2	6	1492462	1492467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_020307	TGG	2	6	1492476	1492481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4533	NC_020307	TGG	2	6	1492595	1492600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_020307	TCGCC	2	10	1492622	1492631	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4535	NC_020307	TGG	2	6	1492691	1492696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_020307	GTG	2	6	1492769	1492774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4538	NC_020307	CCG	2	6	1492793	1492798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_020307	CCT	2	6	1492803	1492808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4541	NC_020307	TGG	2	6	1492983	1492988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_020307	AATT	2	8	1494568	1494575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_020307	ACC	2	6	1495943	1495948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_020307	AAC	2	6	1495958	1495963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_020307	A	6	6	1497186	1497191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_020307	TTG	2	6	1498778	1498783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4548	NC_020307	CAA	2	6	1498862	1498867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4550	NC_020307	CG	3	6	1498897	1498902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_020307	G	6	6	1498921	1498926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_020307	AT	3	6	1498946	1498951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_020307	AGG	2	6	1498979	1498984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4555	NC_020307	ATTT	2	8	1502215	1502222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_020307	GGAA	2	8	1502250	1502257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_020307	T	6	6	1502371	1502376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4560	NC_020307	TTTTTG	2	12	1502547	1502558	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_020307	T	6	6	1502624	1502629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_020307	A	6	6	1502647	1502652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_020307	ATT	2	6	1502672	1502677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_020307	T	6	6	1502695	1502700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_020307	TTA	2	6	1502718	1502723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4569	NC_020307	ATC	2	6	1502856	1502861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_020307	TAA	2	6	1502889	1502894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_020307	AAAC	2	8	1502912	1502919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4573	NC_020307	ATT	2	6	1502974	1502979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_020307	ATT	2	6	1510306	1510311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_020307	ACT	2	6	1510434	1510439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4596	NC_020307	TCCT	2	8	1513766	1513773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_020307	TGCG	2	8	1513780	1513787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_020307	GGC	2	6	1513902	1513907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_020307	AAC	2	6	1513992	1513997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_020307	T	7	7	1513999	1514005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_020307	ATC	2	6	1514014	1514019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_020307	ACAA	2	8	1514049	1514056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_020307	TAA	2	6	1514110	1514115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_020307	TTA	2	6	1514160	1514165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_020307	TGC	2	6	1514209	1514214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_020307	AATC	2	8	1514227	1514234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_020307	GCG	2	6	1514289	1514294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_020307	TTGA	2	8	1514319	1514326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_020307	ACG	2	6	1514354	1514359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_020307	ATT	2	6	1515777	1515782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_020307	CT	3	6	1515800	1515805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_020307	ATTA	2	8	1515809	1515816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_020307	ATA	2	6	1517744	1517749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_020307	AAT	2	6	1517960	1517965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_020307	TA	4	8	1520814	1520821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_020307	ATGA	2	8	1520835	1520842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_020307	TTA	2	6	1520873	1520878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4620	NC_020307	CAT	2	6	1520975	1520980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4622	NC_020307	TAT	2	6	1522798	1522803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_020307	TGA	2	6	1522896	1522901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_020307	TTA	2	6	1522904	1522909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_020307	TCA	2	6	1522928	1522933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_020307	ATCTC	2	10	1522983	1522992	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4627	NC_020307	CTTTT	2	10	1522995	1523004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4628	NC_020307	CATC	2	8	1523034	1523041	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_020307	GATT	2	8	1523055	1523062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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