MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw3 genomic sequence

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020265	TAT	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020265	TAAA	2	8	319	326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020265	AGA	2	6	327	332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020265	A	6	6	343	348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020265	GTA	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020265	GAT	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020265	A	7	7	420	426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020265	AAC	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020265	TA	3	6	515	520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020265	TAAT	2	8	539	546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020265	AT	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020265	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020265	TAAAT	2	10	560	569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020265	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020265	GTAA	2	8	654	661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020265	TAAGTA	2	12	679	690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020265	AAT	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020265	ATA	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020265	ATA	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020265	AT	3	6	761	766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020265	GTTG	2	8	793	800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020265	GTAA	2	8	838	845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020265	AATTAA	2	12	868	879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020265	AGC	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020265	ATTA	2	8	2958	2965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020265	TAA	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020265	AT	3	6	3096	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020265	TAA	3	9	3128	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020265	TA	3	6	3168	3173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020265	AAATA	2	10	3207	3216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020265	A	7	7	3270	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020265	GAA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020265	GAA	2	6	3319	3324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.