MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw2 genomic sequence

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020264	AGA	2	6	737	742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020264	ACA	2	6	844	849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020264	ATT	2	6	868	873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020264	TTG	2	6	889	894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020264	TAT	3	9	919	927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020264	TTG	2	6	1012	1017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020264	ATA	2	6	1224	1229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020264	TAA	3	9	1370	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020264	TAA	2	6	1485	1490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020264	CCT	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_020264	GAC	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020264	TAT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020264	TAT	2	6	1848	1853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020264	TAT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020264	CAT	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020264	CAT	2	6	2942	2947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020264	GCG	2	6	3016	3021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020264	ACT	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020264	ACT	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020264	ACT	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020264	ACT	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020264	ACT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020264	AGT	2	6	3252	3257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020264	ATT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020264	GTA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020264	TAA	2	6	3479	3484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020264	TAA	2	6	3642	3647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020264	ATT	3	9	3664	3672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020264	ATG	2	6	3740	3745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020264	TCA	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020264	TTA	2	6	4006	4011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020264	ACC	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020264	CAA	2	6	4174	4179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020264	GAG	2	6	4842	4847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020264	CAA	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020264	CAA	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020264	TAA	2	6	5252	5257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020264	CAA	2	6	5332	5337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020264	TAT	3	9	5341	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020264	CAA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020264	AAT	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020264	AAT	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020264	ATT	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020264	GAA	2	6	5656	5661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020264	GAA	2	6	5767	5772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020264	TTA	2	6	5789	5794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020264	GAT	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020264	TAA	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020264	TTA	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020264	TAA	3	9	6054	6062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020264	ATT	2	6	6096	6101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020264	TCT	3	9	6102	6110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020264	AAT	2	6	6119	6124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020264	TTA	2	6	6141	6146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020264	TTC	2	6	6185	6190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020264	GAT	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020264	AGT	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020264	ATC	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020264	CTC	2	6	6572	6577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020264	TTA	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020264	AGG	2	6	6724	6729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020264	ATA	2	6	7643	7648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020264	ATA	2	6	7936	7941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.