MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020246	ACTTCA	2	12	3374	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020246	CATAAA	2	12	28053	28064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020246	GTTCAT	2	12	72503	72514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020246	ATAAAT	2	12	109633	109644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020246	ATATTT	2	12	130110	130121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020246	AAATAT	2	12	135314	135325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020246	AAAGTA	2	12	138227	138238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020246	TTTTAA	2	12	263531	263542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020246	TTTGTT	2	12	288180	288191	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020246	AAACAA	2	12	298616	298627	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020246	TAAAAT	2	12	342943	342954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020246	TAACTT	2	12	348534	348545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020246	TTACAC	2	12	381797	381808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020246	TTCTAG	2	12	387605	387616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020246	GAAACA	2	12	404829	404840	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020246	CCAACT	2	12	410637	410648	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020246	CAGCTG	2	12	411265	411276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020246	AAGACC	2	12	413816	413827	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020246	ATGTTA	2	12	425433	425444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020246	GAGAAA	3	18	425817	425834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020246	GAATAA	2	12	430211	430222	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020246	AGCGCT	2	12	505786	505797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020246	AAATAT	2	12	518253	518264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020246	TTTTAT	2	12	579556	579567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020246	ACGCTT	2	12	579885	579896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020246	ATAACG	2	12	582016	582027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020246	AACTCA	2	12	593960	593971	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020246	ATAAGG	2	12	594325	594336	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020246	ACTCTG	2	12	597860	597871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020246	TATTCT	2	12	694671	694682	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020246	CATTAA	2	12	701030	701041	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020246	TAAAAT	2	12	714655	714666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020246	ATTTTT	2	12	805823	805834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020246	TTTCGA	2	12	805958	805969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020246	TTAAAT	2	12	839665	839676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020246	TTAATT	2	12	858153	858164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020246	AAAATT	2	12	877438	877449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020246	TGTCTA	2	12	890052	890063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020246	TTTAGT	2	12	906218	906229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020246	ATTAAA	2	12	907472	907483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020246	AAAATA	2	12	929248	929259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020246	TTATAT	2	12	944812	944823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020246	GTGATA	2	12	949222	949233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020246	TATATT	2	12	954374	954385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020246	AGAATA	2	12	956737	956748	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020246	ATAATT	2	12	983963	983974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020246	TATCGA	2	12	999767	999778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020246	ATTTTT	2	12	1007398	1007409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020246	TTTTTA	2	12	1009715	1009726	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020246	TACAAC	2	12	1046646	1046657	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020246	AAATTA	2	12	1051827	1051838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020246	TAAAAA	2	12	1072328	1072339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020246	TAATTT	2	12	1080041	1080052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020246	CTTTTT	2	12	1080330	1080341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020246	TTAAAA	2	12	1188578	1188589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020246	TAAAAA	2	12	1200044	1200055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020246	ATTTTT	2	12	1263821	1263832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020246	TATTTT	2	12	1268262	1268273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020246	GAAAAT	2	12	1268319	1268330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020246	CTCCTT	2	12	1422672	1422683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020246	TATAAT	2	12	1438352	1438363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020246	AAAGAA	2	12	1443345	1443356	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020246	AGTATA	2	12	1461984	1461995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020246	AATATT	2	12	1471047	1471058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020246	TTATAA	2	12	1510682	1510693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020246	TTTAAA	2	12	1514987	1514998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020246	AAATTT	2	12	1537338	1537349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020246	TATTAA	2	12	1551023	1551034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020246	CTTTTT	2	12	1553474	1553485	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020246	TCTATT	2	12	1556513	1556524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020246	ATTATA	2	12	1605882	1605893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020246	GAAAAA	2	12	1616421	1616432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020246	TTCATA	2	12	1618728	1618739	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020246	TAGTTT	2	12	1650731	1650742	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020246	TTAGTT	2	12	1651088	1651099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020246	TAGTTT	2	12	1651747	1651758	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020246	TAGTTT	2	12	1652532	1652543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020246	TTAGTT	2	12	1653073	1653084	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020246	TATTTT	2	12	1653167	1653178	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020246	TCATAC	2	12	1653999	1654010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020246	TAGTTT	2	12	1654392	1654403	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020246	AAAGAA	2	12	1654780	1654791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020246	TAAAAC	2	12	1655031	1655042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020246	TTTAGT	2	12	1657546	1657557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020246	TAGTTT	2	12	1657787	1657798	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020246	TTTTAG	2	12	1658022	1658033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020246	TAGTTT	2	12	1658207	1658218	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020246	AAACTA	2	12	1671221	1671232	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020246	AAACTA	2	12	1671692	1671703	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020246	AAACTA	2	12	1672174	1672185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020246	AGCAAC	2	12	1672789	1672800	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020246	AAACTA	2	12	1673195	1673206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020246	CTTTTT	2	12	1673816	1673827	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020246	AAACTA	2	12	1674622	1674633	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020246	AAACTA	2	12	1674924	1674935	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020246	AAACTA	2	12	1674985	1674996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020246	AAACTA	2	12	1675044	1675055	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020246	AAACTA	2	12	1675103	1675114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020246	AAACTA	2	12	1675162	1675173	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020246	AAACTA	2	12	1675221	1675232	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020246	CGTTCA	2	12	1681829	1681840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020246	AAACAT	2	12	1694955	1694966	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020246	GAATAT	2	12	1699856	1699867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020246	GTGAAA	2	12	1700590	1700601	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020246	CTGTCC	2	12	1701072	1701083	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020246	TTAAGA	2	12	1706683	1706694	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020246	TTATAA	2	12	1727868	1727879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020246	TTATAA	2	12	1727886	1727897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020246	ATTAAT	2	12	1727927	1727938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020246	TCTATA	2	12	1731031	1731042	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020246	CCTTTA	2	12	1763441	1763452	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020246	ACTCAT	2	12	1769046	1769057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020246	TCTTGG	2	12	1771327	1771338	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020246	TTATAA	2	12	1773619	1773630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020246	AAATAT	2	12	1774318	1774329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020246	CCTTAT	2	12	1802579	1802590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020246	GGAGAA	2	12	1807394	1807405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020246	AAATTG	2	12	1810875	1810886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020246	GCTGAT	2	12	1813171	1813182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020246	AGGTTA	2	12	1822541	1822552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020246	CATTAT	2	12	1825774	1825785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020246	TCTAGC	2	12	1825953	1825964	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020246	TAGGGT	2	12	1828917	1828928	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020246	ATATTT	2	12	1841749	1841760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020246	CCATAA	2	12	1850516	1850527	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020246	TAAAAA	2	12	1868152	1868163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020246	GGAAAA	2	12	1869289	1869300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020246	AAATTA	2	12	1917956	1917967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020246	TAATCT	2	12	1923842	1923853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020246	CTGAAA	2	12	1931672	1931683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_020246	GTTACT	2	12	1951801	1951812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_020246	CTAGGT	2	12	1964277	1964288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020246	CATAAA	2	12	1985385	1985396	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020246	AAATAT	2	12	1991571	1991582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_020246	TACTTT	2	12	2009474	2009485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.