MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020246	TAACT	2	10	3346	3355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020246	TATTG	2	10	29514	29523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020246	CATAA	2	10	29592	29601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020246	ACTTA	2	10	48342	48351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020246	AAACT	2	10	49143	49152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020246	TAACA	2	10	82731	82740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020246	ATTTT	2	10	92817	92826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020246	ATATA	2	10	154717	154726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020246	GAAAA	2	10	185049	185058	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020246	ATATT	2	10	188122	188131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020246	AAATT	2	10	201573	201582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020246	GTATT	2	10	206337	206346	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020246	TCTCT	2	10	225023	225032	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_020246	CTTAA	2	10	242977	242986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020246	TTAGG	2	10	248060	248069	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020246	TAAAA	2	10	251698	251707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020246	TTATA	2	10	257052	257061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020246	ATAAA	2	10	258395	258404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020246	ATAAA	2	10	260584	260593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020246	ATTTA	2	10	271130	271139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020246	TTAAA	2	10	275318	275327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020246	TTAAA	3	15	283468	283482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020246	TTTAG	2	10	295096	295105	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020246	ATTTT	2	10	295789	295798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020246	TTTAG	2	10	296801	296810	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020246	TCAAA	2	10	299949	299958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020246	TGTGA	2	10	308077	308086	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020246	AAATA	2	10	317613	317622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020246	TAAAT	2	10	325225	325234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020246	AAAAT	2	10	329300	329309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020246	AAATT	2	10	329497	329506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020246	TTACC	2	10	331562	331571	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_020246	AATAT	2	10	333463	333472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020246	TTTTA	2	10	333873	333882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020246	TATAT	2	10	362899	362908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020246	TTTAG	2	10	371237	371246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020246	TTACG	2	10	372054	372063	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020246	ATTTT	2	10	387437	387446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020246	AAAAT	2	10	410798	410807	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020246	GTCCT	2	10	410824	410833	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_020246	AGGAT	2	10	411196	411205	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020246	CCCCG	2	10	417517	417526	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43	NC_020246	CTGAC	2	10	419131	419140	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_020246	CTTTC	2	10	419180	419189	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_020246	ACTAT	2	10	419302	419311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020246	GAAGA	2	10	420257	420266	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020246	GAATA	2	10	421078	421087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020246	ATGAA	2	10	424447	424456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020246	ATGTA	2	10	430450	430459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020246	ATCAA	2	10	431575	431584	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020246	ACTAT	2	10	435375	435384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020246	ATTTC	2	10	435432	435441	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020246	GACAT	2	10	435456	435465	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020246	AGGAA	2	10	435485	435494	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020246	ATTTT	2	10	440543	440552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020246	TATCT	2	10	442319	442328	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020246	TCCGT	2	10	449493	449502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_020246	ATTAT	2	10	500014	500023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020246	TATGA	2	10	524184	524193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020246	TAAAT	2	10	537191	537200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020246	GAAAA	2	10	537649	537658	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020246	GACGT	2	10	537969	537978	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020246	CCTCC	2	10	539107	539116	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
64	NC_020246	ATTAT	2	10	542403	542412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020246	ACTAG	2	10	544354	544363	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020246	TTTAC	2	10	544987	544996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020246	AGATT	2	10	554396	554405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020246	TAGAT	2	10	560735	560744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020246	TTATA	2	10	579364	579373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020246	ATTTT	2	10	579587	579596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020246	TGCCC	2	10	581944	581953	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_020246	TACTC	2	10	582149	582158	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_020246	ACTTA	2	10	582657	582666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020246	ATGAA	2	10	584075	584084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020246	TTTAA	2	10	594231	594240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020246	GTTTA	2	10	643521	643530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020246	GTTAT	2	10	647105	647114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020246	ACCTA	2	10	650773	650782	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_020246	AAAGG	2	10	694774	694783	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020246	ATTTA	2	10	696022	696031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020246	AGTTT	2	10	696947	696956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020246	GAAAT	2	10	698523	698532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020246	CTAAA	2	10	701627	701636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020246	TAAAT	2	10	706153	706162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020246	TATCT	2	10	716153	716162	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020246	CTAAT	2	10	731082	731091	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020246	TTTCA	2	10	731093	731102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020246	GATTT	2	10	748521	748530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020246	GGATA	2	10	782584	782593	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020246	ATATC	2	10	794891	794900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020246	TAAAA	2	10	823027	823036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020246	TCTAA	2	10	829436	829445	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020246	ATTTC	2	10	855345	855354	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020246	TTATT	2	10	858617	858626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020246	GACAG	2	10	867240	867249	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020246	AGATT	2	10	886087	886096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020246	TATCG	2	10	895779	895788	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020246	GTCCA	2	10	896503	896512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_020246	ACACT	2	10	901133	901142	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_020246	AATTA	2	10	907437	907446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020246	TCTGA	2	10	907659	907668	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020246	TTTGT	2	10	908670	908679	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020246	TATAC	2	10	921747	921756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020246	CTTTA	2	10	928138	928147	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020246	TAAGG	2	10	928272	928281	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020246	ATTTT	2	10	946304	946313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020246	ATCTT	2	10	948281	948290	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020246	AAATG	2	10	948355	948364	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020246	ATTTA	2	10	951062	951071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020246	ATACA	2	10	951452	951461	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020246	GATTT	2	10	954236	954245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020246	TTTAG	2	10	954268	954277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020246	TGAAC	2	10	966755	966764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020246	AAACA	2	10	967703	967712	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_020246	TTAAA	2	10	970771	970780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020246	ACAAA	2	10	978522	978531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020246	ATTAA	2	10	984044	984053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020246	ACTGT	2	10	986261	986270	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020246	AATAG	2	10	986272	986281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020246	TTTTA	2	10	994412	994421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020246	TTATT	2	10	999662	999671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020246	GTATA	2	10	999918	999927	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020246	AAGTA	2	10	1005039	1005048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020246	CTCTT	2	10	1039355	1039364	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_020246	AGTTT	2	10	1042125	1042134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020246	GTTAA	2	10	1051504	1051513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020246	AACTT	2	10	1051518	1051527	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_020246	TCCAC	2	10	1051620	1051629	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_020246	ATAAA	2	10	1080312	1080321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020246	CAAGC	2	10	1083480	1083489	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_020246	CTTTA	2	10	1098916	1098925	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020246	CCCCA	2	10	1103968	1103977	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_020246	AGGGG	2	10	1104030	1104039	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020246	CGAGC	2	10	1106896	1106905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_020246	AATTG	2	10	1109886	1109895	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020246	TAGTT	2	10	1113777	1113786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020246	AAAAT	2	10	1166814	1166823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020246	GATAA	2	10	1177131	1177140	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020246	ATATA	2	10	1198275	1198284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020246	GGTAA	2	10	1240300	1240309	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020246	ATTTT	2	10	1248611	1248620	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020246	TTCTC	2	10	1248716	1248725	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_020246	CTATT	2	10	1276032	1276041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_020246	ATTTA	2	10	1294046	1294055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020246	AAGAT	2	10	1300238	1300247	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020246	TATAA	2	10	1300560	1300569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020246	TTTTC	2	10	1304175	1304184	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_020246	CCATG	2	10	1305552	1305561	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_020246	TACGT	2	10	1307349	1307358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_020246	TTAAA	2	10	1314535	1314544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020246	TTTAG	2	10	1336525	1336534	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020246	CATTT	2	10	1342014	1342023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_020246	AAAAT	2	10	1355015	1355024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020246	CTTAA	2	10	1355052	1355061	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_020246	GCTCT	2	10	1400436	1400445	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_020246	ATATA	2	10	1429124	1429133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020246	TATCA	2	10	1430922	1430931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_020246	AGGTA	2	10	1440002	1440011	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020246	GTCAG	2	10	1440821	1440830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_020246	AGGAT	2	10	1455904	1455913	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020246	TATAT	2	10	1459177	1459186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020246	ATATA	2	10	1462032	1462041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020246	AATTG	2	10	1477328	1477337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020246	CTGTC	2	10	1480718	1480727	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_020246	CTACA	2	10	1481304	1481313	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_020246	ATTTA	2	10	1504433	1504442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020246	ATAAG	2	10	1504445	1504454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_020246	TATAT	2	10	1512105	1512114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020246	TATAT	2	10	1512180	1512189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020246	AATTT	2	10	1512672	1512681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_020246	TACTC	2	10	1560021	1560030	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_020246	AAATG	2	10	1571426	1571435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020246	TTATA	2	10	1573247	1573256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020246	TATGG	2	10	1575269	1575278	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
185	NC_020246	CTTTT	2	10	1588917	1588926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_020246	TGTCC	2	10	1611597	1611606	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_020246	GTTTA	2	10	1622107	1622116	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020246	CTTTT	2	10	1642245	1642254	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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194	NC_020246	AAATA	2	10	1643537	1643546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_020246	GAAGT	2	10	1643743	1643752	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_020246	TTTGT	2	10	1652938	1652947	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
199	NC_020246	CCAGC	2	10	1653462	1653471	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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264	NC_020246	CTTAT	2	10	1827031	1827040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_020246	GTCAT	2	10	1835097	1835106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_020246	AACCT	2	10	1854352	1854361	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_020246	TTGTA	2	10	1922078	1922087	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_020246	TGGAA	2	10	1938562	1938571	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_020246	TGCCC	2	10	1943502	1943511	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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282	NC_020246	TGATT	2	10	1949755	1949764	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020246	ACTTC	2	10	1957999	1958008	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
284	NC_020246	GGAAA	2	10	1958235	1958244	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
285	NC_020246	CTTTA	2	10	1961196	1961205	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_020246	AAGAC	2	10	1961223	1961232	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_020246	TTTTA	2	10	1961542	1961551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020246	AGGAG	2	10	1963411	1963420	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020246	TCTTA	2	10	1965303	1965312	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_020246	ATTCT	2	10	1969635	1969644	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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292	NC_020246	ACCTC	2	10	1973195	1973204	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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299	NC_020246	CATTT	2	10	2015673	2015682	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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321	NC_020246	TCAGT	2	10	2156317	2156326	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
322	NC_020246	AAACC	2	10	2157959	2157968	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
323	NC_020246	TTTGA	2	10	2167611	2167620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
324	NC_020246	TAATA	2	10	2168718	2168727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_020246	AACTT	2	10	2171405	2171414	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.