MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC01

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019893	GAA	2	6	65	70	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019893	CAT	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019893	GAC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019893	TTC	2	6	369	374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019893	TCG	2	6	384	389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019893	CAC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_019893	GAC	2	6	441	446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019893	GAA	2	6	464	469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019893	GTG	2	6	529	534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019893	CTG	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019893	CAC	2	6	631	636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019893	ACA	2	6	850	855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019893	CAT	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019893	ACA	2	6	1046	1051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019893	AGG	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019893	TCA	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019893	ATT	2	6	4672	4677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019893	TCC	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_019893	TAA	2	6	4928	4933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019893	CTT	2	6	4948	4953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019893	CGA	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019893	GAG	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019893	ACG	2	6	6753	6758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019893	ATC	2	6	6760	6765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019893	TCC	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019893	CGC	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_019893	CCG	2	6	7052	7057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019893	CGC	2	6	7074	7079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019893	CGC	2	6	7109	7114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019893	GCT	2	6	10512	10517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019893	TTC	2	6	10555	10560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019893	TGT	3	9	10611	10619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019893	TCT	2	6	10625	10630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019893	CAA	2	6	10631	10636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019893	GAG	2	6	11080	11085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019893	CGA	2	6	11444	11449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019893	AGG	2	6	11455	11460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019893	GAT	2	6	11539	11544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019893	CGA	2	6	11550	11555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019893	CGT	2	6	11702	11707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019893	CGC	2	6	11770	11775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019893	CCG	2	6	11796	11801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019893	GCA	2	6	11949	11954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019893	GAC	2	6	11968	11973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019893	TTC	2	6	12023	12028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019893	ATT	2	6	12034	12039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019893	ATG	2	6	12139	12144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019893	TGG	2	6	12145	12150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019893	TTG	2	6	15822	15827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019893	TCA	2	6	15942	15947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019893	CTT	2	6	15955	15960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019893	GCC	2	6	16184	16189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_019893	CAT	2	6	16265	16270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019893	TTG	2	6	17226	17231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019893	TTG	2	6	17262	17267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019893	ATA	2	6	18962	18967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019893	CAC	2	6	20116	20121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019893	GCA	2	6	20151	20156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019893	GGC	2	6	21402	21407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019893	CGT	2	6	21476	21481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019893	AAT	2	6	22718	22723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019893	AGA	2	6	22890	22895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019893	GCG	2	6	22917	22922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019893	ATC	2	6	22988	22993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019893	CGA	2	6	27009	27014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019893	CGG	2	6	31589	31594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019893	ATT	2	6	31733	31738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019893	TCT	2	6	31817	31822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019893	GTT	2	6	32546	32551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019893	TGT	2	6	32592	32597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019893	GAA	2	6	32622	32627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019893	AGG	2	6	34544	34549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019893	CGG	2	6	37433	37438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019893	TCG	2	6	37538	37543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019893	CTC	2	6	37774	37779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_019893	GTT	2	6	37781	37786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019893	ACA	2	6	39208	39213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019893	CTC	2	6	42048	42053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019893	CTG	2	6	42061	42066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019893	GCG	2	6	42082	42087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019893	TGC	2	6	42106	42111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019893	GGC	2	6	42147	42152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019893	GGA	2	6	42997	43002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019893	AGT	2	6	44251	44256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.