MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 chromosome

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019892	CTGG	2	8	599	606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019892	GACC	2	8	738	745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019892	AGGG	2	8	2348	2355	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019892	TCCA	2	8	10450	10457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019892	CACC	2	8	11769	11776	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_019892	TCGG	2	8	12950	12957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019892	CCGG	2	8	12978	12985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019892	TCCC	2	8	14459	14466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_019892	AGCG	2	8	14479	14486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019892	CAGC	2	8	14513	14520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019892	TCGC	2	8	14650	14657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019892	GCAA	2	8	16231	16238	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019892	ACTC	2	8	16260	16267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019892	GGAT	2	8	16314	16321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019892	AAAT	2	8	16537	16544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019892	CCAA	2	8	16870	16877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019892	CCGG	2	8	17991	17998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019892	TTCG	2	8	25291	25298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019892	GACA	2	8	27335	27342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019892	CAAT	2	8	27389	27396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019892	CCGA	2	8	28126	28133	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019892	TTAT	2	8	32570	32577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019892	AAGC	2	8	33187	33194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019892	TCGC	2	8	33196	33203	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019892	TTCC	2	8	36289	36296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019892	TTCC	2	8	36349	36356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019892	CCGG	2	8	36670	36677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019892	GCCG	2	8	36690	36697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019892	CCGC	2	8	36712	36719	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_019892	CGAT	2	8	38133	38140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019892	CGGC	2	8	38209	38216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019892	CCCT	2	8	40975	40982	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_019892	GATC	2	8	41194	41201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019892	GGAA	2	8	42511	42518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019892	GAAC	2	8	42566	42573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019892	CGGT	2	8	42588	42595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019892	GTTT	2	8	43662	43669	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019892	CGGC	2	8	44438	44445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019892	CCCG	2	8	45556	45563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_019892	TAAG	2	8	47371	47378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019892	AGGC	2	8	47603	47610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019892	TGAT	2	8	47624	47631	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019892	CGTC	2	8	55757	55764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019892	GCGA	2	8	55816	55823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019892	AGGC	2	8	55825	55832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019892	CCTC	2	8	55860	55867	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_019892	GGCG	2	8	56868	56875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019892	CCCG	2	8	56906	56913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_019892	CCCG	2	8	61041	61048	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_019892	AGTT	2	8	61050	61057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019892	GGCC	2	8	63725	63732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019892	GAAC	2	8	66677	66684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019892	CTAA	2	8	69749	69756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019892	TCCC	2	8	71540	71547	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_019892	TTCG	2	8	73231	73238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019892	AAAG	2	8	76523	76530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019892	CGTC	2	8	76646	76653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019892	CGGC	2	8	81547	81554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019892	AAAG	2	8	81700	81707	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019892	TGTC	2	8	84028	84035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019892	GAAT	2	8	84041	84048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019892	TAGC	2	8	84132	84139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019892	GACA	2	8	84202	84209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019892	GATC	2	8	84327	84334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019892	CCGG	2	8	84444	84451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019892	AGCC	2	8	84581	84588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019892	ACCC	2	8	86099	86106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_019892	GCGG	2	8	87302	87309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019892	GGGA	2	8	87741	87748	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019892	CGTC	2	8	89430	89437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019892	GCCA	2	8	90208	90215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019892	TGCA	2	8	91723	91730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019892	GAAT	2	8	93013	93020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019892	CTCG	2	8	95730	95737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019892	CGGC	2	8	95780	95787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019892	CGGC	2	8	96293	96300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019892	GGCT	2	8	97872	97879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019892	CGCC	2	8	97946	97953	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_019892	GCCT	2	8	101071	101078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019892	GACG	2	8	102118	102125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019892	GGGC	2	8	102219	102226	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019892	GCGG	2	8	106269	106276	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019892	CCTA	2	8	107411	107418	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019892	CGAT	2	8	109851	109858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019892	AGGT	2	8	110718	110725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019892	AGCA	2	8	110787	110794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019892	AATC	2	8	113622	113629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019892	GATC	2	8	114171	114178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019892	AGGA	2	8	114862	114869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019892	GCGG	2	8	115016	115023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019892	GAAC	2	8	115130	115137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019892	GGAT	2	8	115138	115145	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019892	TGCG	2	8	115151	115158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019892	GGAG	2	8	116383	116390	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019892	ATCG	2	8	116563	116570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019892	GATC	2	8	116942	116949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019892	CCCG	2	8	117138	117145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_019892	AATC	2	8	117162	117169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019892	TCCG	2	8	117646	117653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019892	GCGA	2	8	119753	119760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019892	ACCA	2	8	120277	120284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019892	AATG	2	8	125815	125822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019892	TCAA	2	8	127436	127443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019892	GTCA	2	8	131367	131374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019892	TTCC	2	8	134973	134980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019892	CGAT	2	8	136080	136087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019892	GCCG	2	8	137872	137879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019892	TAAT	2	8	137982	137989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019892	ACGA	2	8	138162	138169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019892	TCTT	2	8	139502	139509	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019892	TTGC	2	8	139839	139846	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019892	GCCG	2	8	140450	140457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019892	TGCG	2	8	140496	140503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019892	CCGG	2	8	140538	140545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019892	CATG	2	8	141064	141071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019892	CTTC	2	8	141136	141143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019892	GCGG	2	8	141467	141474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019892	GAGC	2	8	143250	143257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019892	CGGC	2	8	147146	147153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019892	TCAC	2	8	147351	147358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019892	ACCA	2	8	147451	147458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019892	AGCG	2	8	147496	147503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019892	CCGC	2	8	147556	147563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_019892	ATCG	2	8	150196	150203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019892	CGGC	2	8	150256	150263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019892	AGCC	2	8	152289	152296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019892	CCCG	2	8	152403	152410	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_019892	AAAC	2	8	152464	152471	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019892	CGGG	2	8	152799	152806	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019892	GCGA	2	8	154411	154418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019892	GGGT	2	8	155864	155871	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019892	CCCT	2	8	156011	156018	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_019892	CCGG	2	8	156058	156065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019892	ATTA	2	8	156406	156413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019892	GCTC	2	8	156630	156637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019892	TTTG	2	8	157784	157791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019892	ATCG	2	8	158575	158582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019892	CGGC	2	8	160176	160183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019892	TGCA	2	8	163035	163042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019892	CCCA	2	8	163521	163528	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_019892	CGGC	2	8	163581	163588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019892	TCCG	2	8	165482	165489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019892	GTTG	2	8	172641	172648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019892	TCGG	2	8	172752	172759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019892	GTGG	2	8	172827	172834	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019892	CGGG	2	8	175793	175800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019892	TCGG	2	8	177188	177195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019892	CCAC	2	8	178096	178103	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_019892	TCGC	2	8	179495	179502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019892	TCCG	2	8	181204	181211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019892	GGGT	2	8	181375	181382	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019892	ATCG	2	8	181926	181933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019892	GATG	2	8	182090	182097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_019892	GGTC	2	8	297306	297313	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
233	NC_019892	GGAA	2	8	297471	297478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_019892	CGAT	2	8	610690	610697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
455	NC_019892	TCCG	2	8	613148	613155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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466	NC_019892	AACC	2	8	632405	632412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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470	NC_019892	GCCG	2	8	645356	645363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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473	NC_019892	CCGG	2	8	654251	654258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
474	NC_019892	CGGG	2	8	655904	655911	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
475	NC_019892	CTTT	2	8	656333	656340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
476	NC_019892	GTGG	2	8	656382	656389	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_019892	CCAA	2	8	663651	663658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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484	NC_019892	CGCC	2	8	664053	664060	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
485	NC_019892	TGGC	2	8	668381	668388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
486	NC_019892	GCCT	2	8	672430	672437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_019892	ACGG	2	8	672448	672455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_019892	GAAT	2	8	672579	672586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
490	NC_019892	CGAC	2	8	675342	675349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
491	NC_019892	GTGA	2	8	675702	675709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_019892	TTCA	2	8	678109	678116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
495	NC_019892	TGGG	2	8	683354	683361	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
496	NC_019892	GGCA	2	8	683394	683401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_019892	CGTG	2	8	684203	684210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_019892	CGGC	2	8	687467	687474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_019892	CCTG	2	8	687558	687565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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