MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4c

Total Repeats: 663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019848	GGAC	2	8	5149	5156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019848	TGAT	2	8	5177	5184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019848	TCGC	2	8	8806	8813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019848	TCCG	2	8	12693	12700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019848	CGTT	2	8	20905	20912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019848	TGCC	2	8	22907	22914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019848	CCGT	2	8	23329	23336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019848	GTGC	2	8	23384	23391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019848	TCCG	2	8	23634	23641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019848	CTTC	2	8	23651	23658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019848	GCGA	2	8	24192	24199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019848	CATT	2	8	25469	25476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019848	TGAG	2	8	29765	29772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019848	GGGC	2	8	36787	36794	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019848	TCGA	2	8	46333	46340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019848	CGAG	2	8	47828	47835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019848	CCGG	2	8	48164	48171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019848	ACCA	2	8	56982	56989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019848	CTGC	2	8	60544	60551	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019848	TGAA	2	8	60652	60659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019848	GCGA	2	8	60858	60865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019848	GGCA	2	8	60895	60902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019848	CGGG	2	8	64349	64356	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019848	CCCG	2	8	64363	64370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_019848	CCAG	2	8	70199	70206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019848	GCCG	2	8	74440	74447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019848	CGAT	2	8	82273	82280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019848	CCTG	2	8	83532	83539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019848	TCCG	2	8	84844	84851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019848	TATG	2	8	85765	85772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019848	CGGC	2	8	86683	86690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019848	AGAA	2	8	97016	97023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019848	GGCC	2	8	97048	97055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019848	GCAT	2	8	98022	98029	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019848	CCGT	2	8	102641	102648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019848	CTTG	2	8	105412	105419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019848	GTTG	2	8	109045	109052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019848	CGGC	2	8	110075	110082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019848	AAGG	2	8	110638	110645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019848	GCCC	2	8	110676	110683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_019848	AGCG	2	8	111241	111248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019848	TAGT	2	8	114971	114978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019848	GGAC	2	8	115616	115623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019848	GGTC	2	8	117955	117962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019848	AGCA	2	8	122787	122794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019848	GCCG	2	8	129581	129588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019848	TCGA	2	8	129826	129833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019848	GTTT	2	8	130797	130804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019848	GTGG	2	8	132819	132826	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019848	GCTG	2	8	132857	132864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019848	CCAT	2	8	132898	132905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019848	AGCA	2	8	132916	132923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019848	CACG	2	8	134743	134750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019848	GCCG	2	8	136295	136302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019848	ATGG	2	8	136433	136440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019848	GTGG	2	8	138524	138531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019848	TCCC	2	8	144309	144316	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_019848	GGCC	2	8	144390	144397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019848	AGCG	2	8	160686	160693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019848	TGCA	2	8	162300	162307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019848	TTCA	2	8	162424	162431	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019848	GGCT	2	8	162735	162742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019848	GATC	2	8	173590	173597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019848	GTCG	2	8	173804	173811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019848	GCCC	2	8	176308	176315	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_019848	ACCG	2	8	177210	177217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019848	CCTT	2	8	183071	183078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019848	CCAG	2	8	184411	184418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019848	CGAG	2	8	193387	193394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019848	GATG	2	8	193710	193717	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019848	AAGC	2	8	193827	193834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019848	TACC	2	8	195203	195210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019848	GTTC	2	8	195572	195579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019848	CTGA	2	8	196094	196101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019848	TTTG	2	8	196422	196429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019848	AGCG	2	8	201902	201909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019848	CGAG	2	8	203041	203048	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019848	GCAG	2	8	203740	203747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019848	GCAT	2	8	203790	203797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019848	GGCC	2	8	203873	203880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019848	GCGG	2	8	204327	204334	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019848	AGCC	2	8	205078	205085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019848	CCAG	2	8	205397	205404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019848	CGTC	2	8	207037	207044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019848	GGCA	2	8	207180	207187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019848	TCCG	2	8	208944	208951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019848	CATT	2	8	209033	209040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019848	CTGC	2	8	211161	211168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019848	CCGG	2	8	213909	213916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019848	GATC	2	8	213955	213962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019848	CGGC	2	8	215704	215711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019848	AGCC	2	8	216176	216183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019848	TGTC	2	8	216467	216474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019848	GCCG	2	8	217101	217108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019848	AGGG	2	8	217147	217154	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019848	GCAG	2	8	218184	218191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019848	GGAG	2	8	219409	219416	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019848	CTCC	2	8	219440	219447	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_019848	GAGG	2	8	220920	220927	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019848	TTGG	2	8	221089	221096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019848	AAAT	2	8	221228	221235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019848	TGCG	2	8	221575	221582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019848	TTCG	2	8	221767	221774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019848	TGTC	2	8	223538	223545	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019848	GGAT	2	8	223971	223978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019848	CGAC	2	8	232041	232048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019848	GATC	2	8	237734	237741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019848	CCTT	2	8	237956	237963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019848	ACCA	2	8	253443	253450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019848	TATG	2	8	258133	258140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019848	GTTT	2	8	258509	258516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019848	CTCC	2	8	260233	260240	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_019848	GGCA	2	8	266008	266015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019848	CAGG	2	8	266069	266076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019848	GCCG	2	8	266208	266215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019848	TCCG	2	8	267905	267912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019848	AGCC	2	8	268674	268681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019848	CGAA	2	8	270541	270548	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019848	TCCT	2	8	271303	271310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019848	CGCC	2	8	271427	271434	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_019848	CGGA	2	8	271920	271927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019848	GCGG	2	8	271933	271940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019848	ACCA	2	8	272141	272148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019848	CGGA	2	8	274550	274557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019848	AGGG	2	8	278516	278523	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019848	TGAT	2	8	280138	280145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019848	CGGT	2	8	280148	280155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019848	TAAA	2	8	281595	281602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019848	GCGA	2	8	290759	290766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019848	CAGG	2	8	291011	291018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019848	TCTG	2	8	292576	292583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019848	TCGC	2	8	292941	292948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019848	CTGC	2	8	292962	292969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019848	CGGC	2	8	299025	299032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019848	CGGC	2	8	299174	299181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019848	TCAA	2	8	301406	301413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019848	GAAG	2	8	304182	304189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019848	GTCG	2	8	304242	304249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019848	GGAT	2	8	304518	304525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019848	TACT	2	8	304679	304686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019848	CTTT	2	8	304869	304876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019848	ATGG	2	8	305314	305321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019848	GCCT	2	8	314975	314982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019848	GGGT	2	8	315885	315892	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019848	GCAC	2	8	316287	316294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019848	AGGC	2	8	316674	316681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019848	GGAA	2	8	316965	316972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019848	GCTC	2	8	324413	324420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019848	CCGG	2	8	328550	328557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019848	TCAC	2	8	328632	328639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019848	GATG	2	8	328766	328773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019848	ACGT	2	8	329583	329590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019848	AAAT	2	8	330683	330690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019848	TTTA	2	8	330755	330762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019848	CGCT	2	8	331369	331376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
156	NC_019848	TGAA	2	8	331549	331556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019848	CCAT	2	8	335056	335063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_019848	GAAC	2	8	335765	335772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_019848	ACGC	2	8	336014	336021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_019848	ATCG	2	8	336683	336690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_019848	GCTT	2	8	337153	337160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_019848	TGGT	2	8	339778	339785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019848	TGCA	2	8	339872	339879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_019848	TCAT	2	8	340701	340708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_019848	CATC	2	8	342898	342905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_019848	GGCC	2	8	346758	346765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_019848	TTCG	2	8	353831	353838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_019848	GCCG	2	8	358637	358644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_019848	ATCG	2	8	361593	361600	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_019848	ACGG	2	8	361777	361784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
172	NC_019848	GAGC	2	8	366587	366594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
173	NC_019848	CTTC	2	8	366767	366774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_019848	GCCG	2	8	378398	378405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
175	NC_019848	GGCA	2	8	378525	378532	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_019848	CGGT	2	8	385128	385135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_019848	ATGC	2	8	385620	385627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_019848	CATG	2	8	387822	387829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_019848	TGGG	2	8	390549	390556	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
180	NC_019848	TCTT	2	8	392376	392383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_019848	GAAA	2	8	392415	392422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_019848	TTTG	2	8	393900	393907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_019848	CAAC	2	8	397217	397224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_019848	GCGG	2	8	397937	397944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
185	NC_019848	GGGC	2	8	404373	404380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
186	NC_019848	AGCG	2	8	405235	405242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
187	NC_019848	CATT	2	8	405275	405282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
188	NC_019848	GCTT	2	8	406427	406434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_019848	GGGA	2	8	408864	408871	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
190	NC_019848	TGAT	2	8	409919	409926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_019848	CTGG	2	8	409934	409941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NC_019848	GTCC	2	8	410838	410845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
193	NC_019848	GCTT	2	8	414714	414721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
194	NC_019848	GCGA	2	8	417280	417287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
195	NC_019848	GTCC	2	8	417593	417600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
196	NC_019848	CGCT	2	8	418844	418851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
197	NC_019848	GGCC	2	8	420708	420715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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222	NC_019848	TCGC	2	8	484050	484057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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225	NC_019848	CCAG	2	8	485622	485629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_019848	CCGG	2	8	610708	610715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_019848	GCGT	2	8	1049592	1049599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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