MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019765	CTAGA	2	10	279	288	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019765	GAATT	2	10	17852	17861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019765	GTTTT	2	10	24600	24609	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019765	TTCAA	2	10	32594	32603	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019765	CCTAC	2	10	35405	35414	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_019765	TAACT	2	10	43853	43862	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019765	AAACC	2	10	47777	47786	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019765	GTTCT	2	10	55977	55986	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019765	TAAAA	2	10	60289	60298	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019765	TAATC	2	10	62128	62137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019765	TAAAT	2	10	62182	62191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019765	CGATC	2	10	63276	63285	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019765	GGGAA	2	10	63387	63396	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019765	TAAAA	2	10	70408	70417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019765	CCCTA	2	10	79665	79674	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_019765	CCCGT	2	10	85197	85206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_019765	TCGGG	2	10	89863	89872	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019765	ATTTA	2	10	89996	90005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019765	AAATT	2	10	109514	109523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019765	ATTTT	2	10	115949	115958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019765	AGCGA	2	10	137957	137966	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019765	TTCAG	2	10	141075	141084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019765	ACGGC	2	10	143984	143993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019765	TTAAT	2	10	149599	149608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019765	AAATT	2	10	161297	161306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019765	AAACA	2	10	161662	161671	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019765	CTTGT	2	10	163230	163239	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019765	GTTAA	2	10	163385	163394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019765	GAACA	2	10	173423	173432	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019765	AAAAT	2	10	189260	189269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019765	ATTTC	2	10	194640	194649	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019765	AAAGA	2	10	200211	200220	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019765	TAACT	2	10	202464	202473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019765	TAACG	2	10	205768	205777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019765	TAGTT	2	10	206189	206198	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019765	TCACT	2	10	206388	206397	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019765	TTATG	2	10	206573	206582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019765	TTATC	2	10	207167	207176	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019765	ATTAA	2	10	215436	215445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019765	TCCCC	2	10	217684	217693	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
41	NC_019765	GGCAA	2	10	218004	218013	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019765	GTAAA	2	10	239462	239471	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019765	CTATA	2	10	239837	239846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019765	ATTAA	2	10	243756	243765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019765	TAGAT	2	10	245604	245613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019765	GTCAA	2	10	254355	254364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019765	CGGAT	2	10	258607	258616	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019765	ATCCA	2	10	263116	263125	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019765	TAAAA	2	10	270891	270900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019765	TGTCA	2	10	285758	285767	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019765	AAATT	2	10	309226	309235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.