MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	TAAC	2	8	748	755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019750	TACA	2	8	3470	3477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019750	CAAC	2	8	3679	3686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019750	TAAA	2	8	4014	4021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019750	ACCA	2	8	5219	5226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019750	ATAC	2	8	5370	5377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019750	CAAA	2	8	9395	9402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019750	GTAA	2	8	9598	9605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019750	TCAA	2	8	10199	10206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019750	AATA	2	8	10358	10365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019750	ATTT	2	8	13745	13752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019750	CAAT	2	8	13827	13834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019750	GAGC	2	8	14250	14257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019750	AAAG	2	8	14683	14690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019750	AATA	2	8	17053	17060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019750	AAAC	2	8	28194	28201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019750	CAAC	2	8	28221	28228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019750	ACTT	2	8	28250	28257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019750	TTGG	2	8	28301	28308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019750	GTTT	2	8	28988	28995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019750	CTTT	2	8	29025	29032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019750	TGTT	2	8	30105	30112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019750	TGAT	2	8	30202	30209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019750	TTAT	2	8	30395	30402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019750	TTTA	2	8	31054	31061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019750	GTAA	2	8	31134	31141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019750	TCGC	2	8	31517	31524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019750	ATTA	2	8	34434	34441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019750	CTCG	2	8	37763	37770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019750	AAAC	2	8	40198	40205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019750	CAAC	2	8	40861	40868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019750	AAAC	2	8	42834	42841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019750	CCAG	2	8	42846	42853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019750	TTCA	2	8	46653	46660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019750	TTAG	2	8	47550	47557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019750	TAAA	2	8	48064	48071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019750	TTTA	2	8	48562	48569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019750	AAAT	2	8	48573	48580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019750	GTAC	2	8	57848	57855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019750	TAAA	2	8	58699	58706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019750	GAAA	2	8	58943	58950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019750	GTAC	2	8	59177	59184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019750	ACTA	2	8	61532	61539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019750	AAAG	2	8	61540	61547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019750	CGGG	2	8	67318	67325	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019750	CACT	2	8	67378	67385	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.