MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	ATT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019750	AAT	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019750	AAC	2	6	2123	2128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019750	AAG	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019750	CAT	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019750	AAT	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019750	CCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019750	GAA	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019750	GAG	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019750	TCA	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019750	ATC	2	6	3692	3697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019750	CTA	3	9	3760	3768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019750	ACA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019750	TGA	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019750	GCA	2	6	3888	3893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019750	TAG	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019750	AGT	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019750	AGG	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019750	AAT	2	6	4075	4080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019750	CAA	2	6	4962	4967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019750	TCT	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019750	TAA	2	6	5148	5153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019750	ATT	2	6	5161	5166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019750	ACT	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019750	AAC	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019750	ATC	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019750	GTG	2	6	9214	9219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019750	TCT	2	6	9324	9329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019750	TAT	2	6	9367	9372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019750	CAA	2	6	9536	9541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019750	CAA	2	6	9548	9553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019750	ATT	2	6	10215	10220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019750	GAA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019750	TGC	2	6	10290	10295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019750	AAT	3	9	10332	10340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019750	ATT	2	6	10568	10573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019750	CTT	2	6	14287	14292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019750	CAA	2	6	14318	14323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019750	ATA	2	6	15607	15612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019750	ATT	2	6	15668	15673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019750	AAT	2	6	15712	15717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019750	TGA	2	6	15761	15766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019750	ATT	2	6	17025	17030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019750	GAA	2	6	17040	17045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019750	TAA	2	6	17063	17068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019750	TCC	2	6	18271	18276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019750	GTA	2	6	18313	18318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019750	CGA	2	6	18372	18377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019750	CCG	2	6	21692	21697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019750	GTT	2	6	25448	25453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019750	AGC	2	6	25462	25467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019750	ATT	2	6	27472	27477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019750	ATT	2	6	27489	27494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019750	AAT	2	6	27554	27559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019750	TCT	2	6	27566	27571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019750	TTA	2	6	27597	27602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019750	ACC	2	6	27611	27616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019750	AGC	2	6	28123	28128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019750	TTC	2	6	28139	28144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019750	GAG	2	6	28280	28285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019750	GCA	2	6	28396	28401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019750	TCG	2	6	28408	28413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019750	AAT	2	6	28480	28485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019750	GAG	2	6	28519	28524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019750	TAA	2	6	28754	28759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019750	ACA	2	6	28789	28794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019750	CAA	2	6	28826	28831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019750	ACT	2	6	30194	30199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019750	CAA	2	6	30364	30369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019750	TAC	2	6	31088	31093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019750	TTG	2	6	31146	31151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019750	TCT	2	6	31204	31209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019750	CTT	2	6	31214	31219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019750	GTA	2	6	31359	31364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019750	CAA	2	6	31370	31375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019750	TCC	2	6	31567	31572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_019750	TCA	2	6	31584	31589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019750	TCC	2	6	31629	31634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019750	CTT	2	6	31759	31764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019750	TGA	2	6	31765	31770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019750	TTC	2	6	34020	34025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019750	TTG	2	6	34322	34327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019750	TCC	2	6	34375	34380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019750	ACG	2	6	34386	34391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019750	CAC	2	6	34409	34414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019750	TCT	2	6	35612	35617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019750	TAG	2	6	37791	37796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019750	TAC	2	6	37804	37809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019750	GAC	2	6	39216	39221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019750	TAA	2	6	39230	39235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019750	GCT	2	6	39970	39975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019750	TTA	2	6	40007	40012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019750	ATT	2	6	40068	40073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019750	ATT	2	6	40098	40103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019750	AAT	2	6	40229	40234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019750	TAA	2	6	40238	40243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019750	CAC	2	6	40846	40851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019750	CTA	2	6	42881	42886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019750	TCA	2	6	46639	46644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019750	GTA	3	9	46688	46696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019750	CTA	2	6	46722	46727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019750	CTG	2	6	46767	46772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019750	TAA	2	6	46815	46820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019750	CCT	2	6	48047	48052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_019750	ATG	2	6	48109	48114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019750	ACT	2	6	50220	50225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019750	ATG	2	6	50796	50801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019750	TAA	2	6	50957	50962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019750	TGA	2	6	51036	51041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019750	ACT	2	6	51084	51089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019750	AAC	2	6	51124	51129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019750	ATT	2	6	51199	51204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019750	TCT	2	6	51232	51237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019750	TCA	2	6	55547	55552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019750	GAT	2	6	57824	57829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019750	GAA	2	6	57859	57864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019750	ACA	2	6	57881	57886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019750	ATT	2	6	58711	58716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019750	GTC	2	6	58757	58762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019750	TTG	2	6	58879	58884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019750	TGG	2	6	58969	58974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019750	GTT	2	6	59008	59013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019750	CAT	2	6	59026	59031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019750	TCT	2	6	59043	59048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019750	ATA	2	6	59153	59158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019750	AGT	2	6	59234	59239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019750	GAA	2	6	59464	59469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019750	TAA	2	6	59524	59529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019750	TCT	2	6	59539	59544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019750	TAA	2	6	61479	61484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019750	TAA	2	6	61598	61603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019750	TGC	2	6	61652	61657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019750	TTC	2	6	61736	61741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019750	TAG	2	6	61928	61933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019750	AGC	2	6	61967	61972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019750	AAT	2	6	62076	62081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019750	ATA	2	6	62107	62112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019750	TTC	2	6	62135	62140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019750	ATT	2	6	66639	66644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019750	GTT	2	6	66658	66663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019750	ATA	2	6	66667	66672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019750	TAA	2	6	67153	67158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019750	CTT	2	6	67172	67177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019750	ATT	2	6	67305	67310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019750	TTG	3	9	67409	67417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019750	TTA	2	6	67418	67423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019750	GAA	2	6	67424	67429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019750	TGT	3	9	67490	67498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019750	TAT	2	6	67505	67510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.