MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.02

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019749	CGAG	2	8	31	38	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019749	AGCG	2	8	2605	2612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019749	AAAC	2	8	3536	3543	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019749	GGTT	2	8	7978	7985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019749	ATGA	2	8	8244	8251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019749	ATTG	2	8	8253	8260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019749	TATT	2	8	8423	8430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019749	ATTA	2	8	9581	9588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019749	TTAA	2	8	10708	10715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019749	GTTT	2	8	11501	11508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019749	ATCG	2	8	11670	11677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019749	CTTT	2	8	12278	12285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019749	ATTA	2	8	12322	12329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019749	GATA	2	8	12332	12339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019749	AAAC	2	8	12957	12964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019749	AGCA	2	8	13097	13104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019749	AATA	2	8	13211	13218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019749	TACC	2	8	14874	14881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019749	TTAA	2	8	18874	18881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019749	TCTA	2	8	21943	21950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019749	ATTT	2	8	22619	22626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019749	TCGT	2	8	23011	23018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019749	CATT	2	8	25274	25281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019749	TATT	2	8	25334	25341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019749	TCTA	2	8	25599	25606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019749	TTCC	2	8	26068	26075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019749	GTAC	2	8	33653	33660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019749	TGTA	2	8	33677	33684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019749	TTTA	2	8	36726	36733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019749	TTGG	2	8	36770	36777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019749	ATTT	2	8	43698	43705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019749	ATTT	2	8	48237	48244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019749	TTAA	2	8	48964	48971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019749	TAAA	2	8	50017	50024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019749	TGAA	2	8	50235	50242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019749	CAAA	2	8	53440	53447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019749	TAAT	2	8	54253	54260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019749	ATTA	2	8	54776	54783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019749	GTAA	2	8	54965	54972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019749	TGGT	2	8	55191	55198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019749	TAAA	2	8	58818	58825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019749	TAAA	2	8	61675	61682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019749	TTAA	2	8	68447	68454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019749	TATT	2	8	69461	69468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019749	CTAA	2	8	71203	71210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019749	CTTA	2	8	71443	71450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019749	AGCT	2	8	71508	71515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019749	GACA	2	8	72286	72293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019749	TGAC	2	8	72461	72468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019749	TTCG	2	8	72972	72979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019749	TTCC	2	8	73157	73164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019749	TTGT	2	8	73189	73196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019749	ACTC	2	8	73743	73750	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019749	TTTA	2	8	76000	76007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019749	AATT	2	8	79567	79574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019749	ATTA	2	8	79683	79690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019749	AATT	2	8	79876	79883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019749	GTTT	2	8	85316	85323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019749	AAAG	2	8	90149	90156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019749	AACA	2	8	90779	90786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019749	CGAG	2	8	92355	92362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019749	GTTC	2	8	92399	92406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019749	GAGC	2	8	92445	92452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019749	TTGA	2	8	92605	92612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019749	AAAT	2	8	92811	92818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019749	CTTA	2	8	92878	92885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019749	AATT	2	8	96378	96385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019749	TAAT	2	8	96386	96393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019749	ATAA	2	8	99417	99424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019749	AACT	2	8	100897	100904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019749	GATT	2	8	101340	101347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019749	TTAT	2	8	102588	102595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019749	CAAA	2	8	105665	105672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019749	GATA	2	8	106016	106023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019749	CCAA	2	8	106085	106092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019749	GTCG	2	8	108347	108354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019749	GTTT	2	8	108510	108517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.