MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 5419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019702	ATC	2	6	101	106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019702	TTA	2	6	150	155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019702	ATG	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019702	AGG	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019702	ATA	2	6	4689	4694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019702	AAC	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019702	GGA	2	6	9358	9363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019702	GAA	2	6	9396	9401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019702	AGC	2	6	12148	12153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019702	ATT	2	6	15634	15639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019702	TAG	2	6	15700	15705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019702	AAC	2	6	15791	15796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019702	TTC	2	6	15812	15817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019702	ATC	2	6	15927	15932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019702	TTA	2	6	15973	15978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019702	AAT	2	6	21403	21408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019702	AAT	2	6	21446	21451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019702	ATT	2	6	23248	23253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019702	ATT	2	6	24276	24281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019702	TAA	2	6	24300	24305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019702	TGA	2	6	25409	25414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019702	TAA	2	6	25427	25432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019702	TGA	2	6	25467	25472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019702	CAC	2	6	25507	25512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019702	ACT	2	6	28973	28978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019702	TGC	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019702	ATT	2	6	29119	29124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019702	ATT	2	6	29130	29135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019702	TCA	2	6	29211	29216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019702	ACT	2	6	29311	29316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019702	AAG	2	6	29319	29324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019702	AAC	2	6	29444	29449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019702	CCT	2	6	30604	30609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019702	TTA	2	6	32835	32840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019702	GTT	2	6	33034	33039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019702	AAG	2	6	37592	37597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019702	TAA	2	6	38974	38979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019702	TAA	2	6	39231	39236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019702	TTA	2	6	41061	41066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019702	ATT	2	6	41501	41506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019702	TAA	2	6	41592	41597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019702	TTA	3	9	42822	42830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019702	AAC	2	6	43091	43096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019702	TTA	2	6	43201	43206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019702	AAG	2	6	44063	44068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019702	ATT	2	6	44075	44080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019702	TGC	2	6	44206	44211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019702	TAT	2	6	45452	45457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019702	TAT	2	6	47514	47519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019702	TAA	2	6	47520	47525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019702	TGA	2	6	51414	51419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019702	AAT	2	6	51530	51535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019702	CTT	2	6	52477	52482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019702	ACA	2	6	52824	52829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019702	GAT	2	6	54454	54459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019702	TAG	2	6	54486	54491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019702	TGA	2	6	55704	55709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019702	ATC	2	6	58389	58394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019702	ATC	2	6	59856	59861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019702	CAA	2	6	59864	59869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019702	TCA	2	6	59996	60001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019702	AGA	2	6	60021	60026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019702	ATC	2	6	63391	63396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019702	CAT	2	6	63485	63490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019702	AAT	2	6	63559	63564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019702	TAC	2	6	64543	64548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019702	CTT	2	6	69972	69977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019702	GAT	2	6	70000	70005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019702	TAA	2	6	70132	70137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019702	CCA	2	6	73466	73471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019702	CAT	2	6	73537	73542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019702	ACT	2	6	73551	73556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019702	TAG	2	6	73680	73685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019702	GTG	2	6	73702	73707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019702	ATT	2	6	73717	73722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019702	TGG	2	6	73757	73762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019702	TTG	2	6	75125	75130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019702	TAT	2	6	78105	78110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019702	TAT	2	6	78118	78123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019702	GTT	2	6	78229	78234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019702	TCA	2	6	78268	78273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019702	GCC	2	6	79033	79038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019702	ACT	2	6	79067	79072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019702	TGA	2	6	79127	79132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019702	ATA	2	6	84205	84210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019702	TCA	2	6	84643	84648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019702	ATG	2	6	84661	84666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019702	ATT	3	9	84672	84680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019702	AGA	2	6	85810	85815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019702	TAA	2	6	89204	89209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019702	ATT	2	6	89365	89370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019702	TAA	2	6	91221	91226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019702	ATT	2	6	91297	91302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019702	AAT	2	6	94253	94258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019702	ATA	2	6	99436	99441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019702	AGG	2	6	99450	99455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019702	GCA	2	6	103387	103392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019702	ATG	2	6	103499	103504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019702	TAA	2	6	103883	103888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019702	TCG	2	6	105878	105883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019702	ACA	2	6	105890	105895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019702	TCA	2	6	105905	105910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019702	CAG	2	6	105944	105949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019702	CAA	2	6	107491	107496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019702	ATT	2	6	111752	111757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019702	TAT	2	6	111763	111768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019702	TTC	3	9	114781	114789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019702	GGT	2	6	114809	114814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019702	ATT	2	6	114941	114946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019702	GTT	2	6	115736	115741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019702	TAA	2	6	117651	117656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019702	TTG	2	6	120212	120217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019702	TTG	2	6	120223	120228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019702	AAT	2	6	120244	120249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019702	TAT	2	6	120755	120760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019702	ACT	2	6	120813	120818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019702	TAT	2	6	120857	120862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019702	ATT	2	6	120887	120892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019702	ACT	2	6	121010	121015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019702	GCT	2	6	121087	121092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019702	ATA	2	6	121155	121160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019702	CAA	2	6	123570	123575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019702	ATC	2	6	124375	124380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019702	TGC	2	6	124410	124415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019702	AGT	2	6	124425	124430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019702	CTA	2	6	124450	124455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019702	ATC	2	6	124531	124536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019702	GTA	2	6	127667	127672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019702	CCT	2	6	130286	130291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019702	CTG	2	6	130446	130451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019702	ATT	2	6	130495	130500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019702	ACC	2	6	130550	130555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_019702	TAA	2	6	130579	130584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019702	AAG	2	6	132714	132719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019702	AGT	2	6	137431	137436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019702	GTT	2	6	138797	138802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019702	CCT	2	6	138875	138880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_019702	CTT	2	6	139101	139106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019702	ATC	2	6	139141	139146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_019702	ATC	2	6	139369	139374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_019702	TAA	2	6	147680	147685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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