MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 10292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019702	AAATA	2	10	453150	453159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019702	GAA	2	6	453166	453171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019702	GTT	2	6	455520	455525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019702	ATT	2	6	455539	455544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019702	ATTT	2	8	457300	457307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019702	ATG	2	6	457394	457399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019702	AAATT	2	10	457445	457454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019702	TTA	2	6	457472	457477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019702	TA	3	6	460170	460175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019702	CT	3	6	461809	461814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_019702	ATC	2	6	461828	461833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_019702	TAT	2	6	462201	462206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019702	A	6	6	462315	462320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019702	T	6	6	463113	463118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019702	CTA	2	6	463674	463679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_019702	TAAAT	2	10	464516	464525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019702	CAAA	2	8	464577	464584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_019702	AGG	2	6	464603	464608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019702	AAC	2	6	464621	464626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_019702	TTA	2	6	466823	466828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019702	TG	3	6	467909	467914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019702	TAA	2	6	469417	469422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019702	TTAATC	2	12	469466	469477	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1024	NC_019702	AATA	2	8	473696	473703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_019702	AAAT	2	8	473796	473803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019702	TA	3	6	475495	475500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019702	TTTTA	2	10	475516	475525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019702	TTG	2	6	475544	475549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019702	ATT	2	6	475625	475630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019702	TGC	2	6	475681	475686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_019702	T	6	6	475701	475706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019702	A	6	6	475724	475729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019702	GTT	2	6	476297	476302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019702	TAAT	2	8	479199	479206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019702	AAAC	2	8	479257	479264	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_019702	ATT	2	6	479299	479304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_019702	TCC	2	6	480502	480507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_019702	T	6	6	480520	480525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019702	ACTA	2	8	480625	480632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_019702	AAT	2	6	480677	480682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019702	TA	3	6	482430	482435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019702	AGT	2	6	485695	485700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019702	CTA	2	6	487778	487783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_019702	ATT	2	6	488515	488520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019702	AGTTT	2	10	488527	488536	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019702	CTAT	2	8	491776	491783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_019702	TAG	2	6	491804	491809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019702	TTA	2	6	494755	494760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019702	TAAT	2	8	494784	494791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019702	CTT	2	6	494860	494865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_019702	TTAC	2	8	495098	495105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_019702	TAATT	2	10	495125	495134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019702	TCAC	2	8	496998	497005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_019702	TAC	3	9	497974	497982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_019702	AG	3	6	498029	498034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019702	ATC	2	6	499677	499682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_019702	GAA	2	6	499741	499746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019702	TTG	2	6	499949	499954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019702	TTCAAG	2	12	500012	500023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1060	NC_019702	AAAT	2	8	500100	500107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019702	A	6	6	500123	500128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019702	TAG	2	6	500132	500137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019702	ATG	2	6	500153	500158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019702	TGA	2	6	502370	502375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019702	ATT	2	6	505501	505506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019702	ATG	2	6	505528	505533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019702	ATTT	2	8	505610	505617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019702	ATTT	2	8	505633	505640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019702	CTG	2	6	507928	507933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_019702	CAT	2	6	509592	509597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_019702	ATA	2	6	509609	509614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019702	ATT	2	6	511298	511303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019702	TTTA	2	8	513812	513819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_019702	TTAGT	2	10	513830	513839	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019702	GCA	2	6	513853	513858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_019702	AG	3	6	514009	514014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_019702	GAA	2	6	514356	514361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019702	GAG	2	6	514421	514426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019702	TTA	2	6	516943	516948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_019702	AAT	2	6	518942	518947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019702	GTA	2	6	520064	520069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019702	ATC	2	6	521367	521372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_019702	AAT	2	6	521493	521498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019702	ATA	2	6	521508	521513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019702	TTA	2	6	521535	521540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019702	CAA	2	6	521546	521551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1098	NC_019702	TGA	2	6	524319	524324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019702	T	6	6	524335	524340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019702	CTT	2	6	524354	524359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_019702	CAA	2	6	524360	524365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019702	CGG	2	6	524380	524385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_019702	CTA	2	6	525640	525645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_019702	TTAT	2	8	525661	525668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019702	ATTTA	2	10	526967	526976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019702	AAT	2	6	532719	532724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019702	TC	3	6	533980	533985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_019702	TAA	2	6	533990	533995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019702	TAA	2	6	534003	534008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019702	A	6	6	535407	535412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019702	A	7	7	535417	535423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019702	AAATA	2	10	535959	535968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019702	ATA	2	6	537075	537080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019702	TGT	2	6	537107	537112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019702	TAT	2	6	537120	537125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019702	T	7	7	537166	537172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019702	ACAA	2	8	537287	537294	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_019702	CAG	2	6	537328	537333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_019702	ACC	2	6	537353	537358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_019702	ATC	2	6	537363	537368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019702	TGCATC	2	12	537449	537460	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_019702	TTGA	2	8	537490	537497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019702	TCC	2	6	537558	537563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_019702	CAT	2	6	537566	537571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1128	NC_019702	CAG	2	6	537751	537756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_019702	GCA	2	6	537855	537860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_019702	GAA	2	6	537876	537881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019702	TCA	2	6	537903	537908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_019702	CAG	2	6	537916	537921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_019702	CAG	2	6	537928	537933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_019702	A	6	6	537974	537979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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