MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 10292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_019702	ATT	2	6	3412740	3412745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_019702	GT	3	6	3412758	3412763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_019702	CTACGC	2	12	3412886	3412897	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_019702	CTT	2	6	3412944	3412949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_019702	A	7	7	3412971	3412977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_019702	TGTT	2	8	3412980	3412987	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_019702	TAA	2	6	3413411	3413416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_019702	TTGAT	2	10	3413420	3413429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_019702	TGAT	2	8	3413440	3413447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_019702	TTTG	2	8	3413466	3413473	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_019702	AAG	2	6	3413538	3413543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_019702	ATAA	2	8	3414187	3414194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_019702	TAACT	2	10	3416051	3416060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10014	NC_019702	A	7	7	3416062	3416068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_019702	CTA	2	6	3416129	3416134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_019702	TGC	3	9	3416137	3416145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_019702	T	6	6	3416182	3416187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_019702	AT	3	6	3416188	3416193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_019702	TAA	2	6	3416203	3416208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_019702	ATA	3	9	3417250	3417258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_019702	GGT	2	6	3417262	3417267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_019702	GTTTA	2	10	3417284	3417293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_019702	TTC	2	6	3417297	3417302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_019702	ATTA	2	8	3417375	3417382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_019702	GTTA	2	8	3417402	3417409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_019702	TAC	2	6	3417414	3417419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10029	NC_019702	TAA	2	6	3419228	3419233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_019702	AT	3	6	3419247	3419252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_019702	AAT	2	6	3419256	3419261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_019702	TGC	2	6	3419277	3419282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_019702	AATT	2	8	3419317	3419324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_019702	TAAT	2	8	3419393	3419400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_019702	T	8	8	3419982	3419989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_019702	AAT	2	6	3423961	3423966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_019702	ATT	2	6	3423977	3423982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_019702	TA	3	6	3424098	3424103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_019702	TGA	2	6	3424124	3424129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10041	NC_019702	GTA	2	6	3424304	3424309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_019702	CTT	2	6	3424338	3424343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10044	NC_019702	TTA	2	6	3424542	3424547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_019702	TTC	2	6	3424561	3424566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_019702	GGT	2	6	3424692	3424697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_019702	AAT	2	6	3424743	3424748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_019702	AGCTC	2	10	3424756	3424765	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10049	NC_019702	CTT	2	6	3424823	3424828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_019702	TGG	2	6	3424868	3424873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10053	NC_019702	GATA	2	8	3424970	3424977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10055	NC_019702	A	6	6	3425072	3425077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_019702	AATTA	2	10	3425152	3425161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_019702	CTG	2	6	3425171	3425176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_019702	A	7	7	3425280	3425286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_019702	TGA	2	6	3425307	3425312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10061	NC_019702	T	6	6	3425397	3425402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_019702	A	6	6	3425480	3425485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_019702	CTTT	2	8	3425572	3425579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_019702	TAA	2	6	3425615	3425620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10102	NC_019702	ATC	2	6	3431634	3431639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10127	NC_019702	A	7	7	3439786	3439792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_019702	TTAT	2	8	3439822	3439829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10261	NC_019702	TAA	3	9	3499728	3499736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_019702	TAA	2	6	3500964	3500969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10263	NC_019702	TCA	2	6	3500974	3500979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10264	NC_019702	TCTTA	2	10	3501012	3501021	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10265	NC_019702	TAG	2	6	3501023	3501028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10266	NC_019702	CGA	2	6	3501065	3501070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10267	NC_019702	CCT	2	6	3501500	3501505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10268	NC_019702	AAT	2	6	3501514	3501519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10269	NC_019702	TCT	2	6	3502582	3502587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10270	NC_019702	CAT	2	6	3502604	3502609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10271	NC_019702	ATAC	2	8	3503957	3503964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10272	NC_019702	TA	3	6	3503986	3503991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10273	NC_019702	ATTTAA	2	12	3504013	3504024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10274	NC_019702	AAT	2	6	3504094	3504099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10275	NC_019702	TGTT	2	8	3504220	3504227	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10276	NC_019702	CTAT	2	8	3504269	3504276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10277	NC_019702	GAT	2	6	3504278	3504283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10278	NC_019702	TCAA	2	8	3504316	3504323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10279	NC_019702	ATC	2	6	3504336	3504341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10280	NC_019702	AAG	2	6	3504374	3504379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10281	NC_019702	TCA	2	6	3504427	3504432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10282	NC_019702	GA	3	6	3505320	3505325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10283	NC_019702	AAT	2	6	3505396	3505401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10284	NC_019702	ATTTA	2	10	3505421	3505430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10285	NC_019702	T	6	6	3505434	3505439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10286	NC_019702	GTAAG	2	10	3505497	3505506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10287	NC_019702	AGTAC	2	10	3507500	3507509	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10288	NC_019702	TTAA	2	8	3507523	3507530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10289	NC_019702	TAA	2	6	3508954	3508959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10290	NC_019702	TTA	2	6	3508973	3508978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10291	NC_019702	AGT	2	6	3510124	3510129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10292	NC_019702	AGT	2	6	3510164	3510169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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