MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 10292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019702	TTA	2	6	239073	239078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019702	TA	3	6	240730	240735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_019702	ATT	2	6	240767	240772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019702	AT	3	6	241881	241886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019702	ATA	2	6	241896	241901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019702	ATT	2	6	241982	241987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019702	TCA	2	6	241990	241995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_019702	T	6	6	242026	242031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019702	ATT	2	6	242071	242076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019702	TTGGTT	2	12	242106	242117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019702	ATT	2	6	242158	242163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019702	A	6	6	243595	243600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019702	TAA	2	6	243636	243641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_019702	TCC	2	6	243723	243728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_019702	T	6	6	243750	243755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019702	TA	3	6	243768	243773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019702	AATT	2	8	245696	245703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_019702	ATAA	2	8	248633	248640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019702	A	6	6	248643	248648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_019702	AGGCT	2	10	249517	249526	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
521	NC_019702	GTT	2	6	250888	250893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_019702	TG	3	6	251174	251179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019702	ATT	2	6	251180	251185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_019702	TCT	2	6	251215	251220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_019702	T	6	6	251376	251381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_019702	TGA	2	6	254202	254207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019702	CT	3	6	254233	254238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_019702	GAA	2	6	254262	254267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_019702	TGA	2	6	257155	257160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019702	TTAA	2	8	257646	257653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_019702	TAG	2	6	258019	258024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019702	A	6	6	258072	258077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019702	TAC	2	6	258101	258106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_019702	A	6	6	259637	259642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019702	AT	3	6	259739	259744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019702	A	6	6	260803	260808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019702	TAT	2	6	260891	260896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_019702	ACT	2	6	260934	260939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_019702	GAAA	2	8	260940	260947	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019702	ATT	2	6	261017	261022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019702	TTGA	2	8	264258	264265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019702	A	6	6	264385	264390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019702	A	6	6	264405	264410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_019702	CGT	2	6	265272	265277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_019702	T	6	6	265338	265343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_019702	CAT	2	6	266076	266081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_019702	A	6	6	266723	266728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_019702	AG	3	6	266761	266766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019702	TAA	2	6	266778	266783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019702	GAT	2	6	266796	266801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019702	ATA	2	6	266865	266870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_019702	CCT	2	6	266887	266892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_019702	ATC	2	6	270376	270381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_019702	TAA	2	6	271464	271469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019702	ATTA	2	8	272411	272418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019702	A	7	7	273117	273123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019702	AGTT	2	8	273148	273155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019702	TGA	2	6	273161	273166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019702	ATT	2	6	276167	276172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019702	TTA	2	6	276260	276265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019702	CT	3	6	278941	278946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_019702	TAC	2	6	278951	278956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_019702	TTC	2	6	279068	279073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_019702	TAA	2	6	279123	279128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019702	TTC	2	6	279139	279144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_019702	TAA	2	6	279218	279223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_019702	CTA	2	6	281115	281120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_019702	ATTA	2	8	281171	281178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019702	TGA	2	6	284624	284629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019702	TTA	2	6	284743	284748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_019702	TA	3	6	284791	284796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_019702	TGT	2	6	286822	286827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_019702	A	6	6	288536	288541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_019702	CT	4	8	288997	289004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_019702	ATT	2	6	289051	289056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_019702	ATTA	2	8	289489	289496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_019702	T	6	6	290357	290362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_019702	TTTA	2	8	290370	290377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_019702	ATAA	2	8	290397	290404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_019702	TAAT	2	8	290415	290422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_019702	AAAG	2	8	290436	290443	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019702	T	6	6	290470	290475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019702	TTAG	2	8	290565	290572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019702	A	6	6	290626	290631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_019702	CTTT	2	8	292008	292015	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_019702	GTT	2	6	292024	292029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019702	TGG	2	6	293225	293230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019702	TGT	2	6	294686	294691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_019702	TTAG	2	8	295949	295956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019702	ATTCC	2	10	299078	299087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
591	NC_019702	AGCTT	2	10	299100	299109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
592	NC_019702	TAA	2	6	299167	299172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_019702	TAG	2	6	300907	300912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019702	TTA	2	6	300917	300922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_019702	TAAA	2	8	300939	300946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_019702	TAA	2	6	300976	300981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_019702	GTG	2	6	301307	301312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_019702	T	6	6	301761	301766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019702	TAC	2	6	304020	304025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_019702	ATTA	2	8	304123	304130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_019702	TCAAC	2	10	306288	306297	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
602	NC_019702	A	6	6	306342	306347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_019702	T	6	6	307414	307419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_019702	T	6	6	307465	307470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_019702	ATA	2	6	307509	307514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_019702	TAA	2	6	307559	307564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_019702	AAAAT	2	10	307573	307582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_019702	T	6	6	307693	307698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019702	ATT	2	6	308119	308124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_019702	TC	3	6	308191	308196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_019702	TTAAG	2	10	308228	308237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
612	NC_019702	CAAC	2	8	308277	308284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_019702	TGT	2	6	308302	308307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_019702	A	6	6	308776	308781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_019702	A	7	7	308788	308794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_019702	AACA	2	8	308811	308818	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_019702	TAAC	2	8	308848	308855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_019702	A	7	7	308892	308898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019702	TCC	2	6	308926	308931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_019702	AGT	2	6	308939	308944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019702	T	6	6	308991	308996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_019702	T	6	6	310509	310514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019702	T	8	8	310531	310538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019702	TATC	2	8	310561	310568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_019702	ATTAGA	2	12	312586	312597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_019702	TAT	2	6	318002	318007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019702	ATA	2	6	319325	319330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_019702	TGG	2	6	320442	320447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_019702	TCT	2	6	320477	320482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_019702	TAT	2	6	322303	322308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_019702	ATGAGG	2	12	322339	322350	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019702	ATTA	2	8	322381	322388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_019702	TAAA	2	8	322400	322407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_019702	ATAGA	2	10	322425	322434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
635	NC_019702	TTAG	2	8	322466	322473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_019702	T	6	6	322485	322490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_019702	AAG	2	6	322497	322502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_019702	A	6	6	322511	322516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_019702	AATT	2	8	322523	322530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_019702	TAA	2	6	322875	322880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_019702	TCC	2	6	322923	322928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_019702	T	6	6	322940	322945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_019702	ATT	2	6	322972	322977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_019702	ATT	2	6	322983	322988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_019702	TTC	2	6	322997	323002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_019702	T	7	7	323201	323207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_019702	T	9	9	323224	323232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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651	NC_019702	T	7	7	323277	323283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_019702	AAC	2	6	324556	324561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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671	NC_019702	A	6	6	329861	329866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_019702	ATT	2	6	364709	364714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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