MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019680	TCA	2	6	838749	838754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_019680	TTC	2	6	838788	838793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_019680	GCA	2	6	838797	838802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_019680	GC	3	6	838861	838866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2005	NC_019680	TGG	2	6	838869	838874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_019680	ACGG	2	8	838929	838936	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2007	NC_019680	TCTG	2	8	839081	839088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2008	NC_019680	GA	3	6	839128	839133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_019680	T	8	8	839261	839268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_019680	GCT	2	6	839329	839334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_019680	GGT	2	6	839357	839362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_019680	GAC	2	6	839405	839410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_019680	AC	3	6	839469	839474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2014	NC_019680	CGA	2	6	839482	839487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_019680	TGC	2	6	839501	839506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_019680	CTT	2	6	839578	839583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_019680	TCT	2	6	839601	839606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_019680	GAG	2	6	841324	841329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_019680	TC	3	6	841800	841805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2020	NC_019680	GCA	2	6	841830	841835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_019680	T	6	6	843915	843920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_019680	AC	3	6	844927	844932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2023	NC_019680	GAA	2	6	845063	845068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_019680	GGC	2	6	845138	845143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_019680	GAA	2	6	845152	845157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2032	NC_019680	GAG	3	9	849075	849083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_019680	CCCGG	2	10	849087	849096	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2035	NC_019680	CTTTT	2	10	849157	849166	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2037	NC_019680	C	6	6	852820	852825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2038	NC_019680	GTC	2	6	852865	852870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_019680	AAT	2	6	852890	852895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_019680	CT	3	6	852916	852921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2041	NC_019680	ATCA	2	8	852945	852952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_019680	G	6	6	853001	853006	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_019680	TTG	2	6	853010	853015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_019680	AATC	2	8	853019	853026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2053	NC_019680	GAC	2	6	856722	856727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_019680	ACC	2	6	857630	857635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2056	NC_019680	GCC	3	9	857738	857746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_019680	TAC	2	6	857765	857770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2059	NC_019680	GCTT	2	8	857871	857878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2063	NC_019680	TCT	2	6	857938	857943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_019680	T	6	6	857943	857948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_019680	TTC	2	6	857952	857957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2072	NC_019680	ATC	2	6	858194	858199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2075	NC_019680	TAT	2	6	858391	858396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2112	NC_019680	CT	3	6	861972	861977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2113	NC_019680	TC	3	6	862439	862444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2114	NC_019680	GA	3	6	862705	862710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2119	NC_019680	AATC	2	8	864758	864765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2120	NC_019680	GCA	2	6	864871	864876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_019680	TAAC	2	8	865571	865578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2122	NC_019680	ACC	3	9	865585	865593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2123	NC_019680	ATT	2	6	865600	865605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_019680	TTCA	2	8	865860	865867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2125	NC_019680	ATT	2	6	866082	866087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_019680	TCTCT	2	10	867506	867515	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2132	NC_019680	TCC	2	6	874811	874816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2133	NC_019680	CAA	2	6	875095	875100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_019680	CCCT	2	8	875720	875727	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2136	NC_019680	AAC	2	6	877434	877439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2409	NC_019680	CCTT	2	8	995403	995410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2410	NC_019680	CTG	2	6	995415	995420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2412	NC_019680	T	6	6	995575	995580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2414	NC_019680	CT	3	6	997238	997243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2415	NC_019680	CAG	2	6	997687	997692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2442	NC_019680	TTGA	2	8	1004701	1004708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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