MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019680	G	6	6	441833	441838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019680	GC	3	6	441878	441883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_019680	GCTC	2	8	445103	445110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_019680	TAC	2	6	445136	445141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_019680	GTG	2	6	445155	445160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019680	AAT	2	6	446388	446393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019680	TTA	2	6	446400	446405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019680	AT	3	6	446427	446432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019680	GACT	2	8	446479	446486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_019680	AGC	2	6	446493	446498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_019680	TACTG	2	10	446886	446895	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_019680	TAG	2	6	446941	446946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019680	TAA	2	6	447022	447027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019680	A	6	6	447054	447059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019680	A	7	7	447111	447117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019680	TCT	2	6	447129	447134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_019680	GAT	2	6	447139	447144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019680	CAC	2	6	448858	448863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_019680	G	7	7	448907	448913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019680	CCT	2	6	448962	448967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_019680	ACA	2	6	449012	449017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_019680	T	6	6	450836	450841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019680	GGGGT	2	10	450902	450911	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019680	ACC	2	6	451352	451357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_019680	TC	3	6	452301	452306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_019680	T	6	6	455012	455017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019680	ATT	2	6	455173	455178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019680	CCCGAA	2	12	455201	455212	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_019680	AGT	2	6	455237	455242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019680	GTA	2	6	455252	455257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019680	T	6	6	455280	455285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019680	AGGGTG	2	12	455320	455331	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019680	CTGG	2	8	455381	455388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_019680	ATA	2	6	457384	457389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019680	TTA	2	6	457522	457527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019680	TCC	2	6	457528	457533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_019680	TGG	2	6	457606	457611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019680	ATT	2	6	457612	457617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019680	AAT	2	6	457817	457822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019680	ATCA	2	8	457856	457863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_019680	TGT	2	6	457901	457906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019680	GGA	2	6	457960	457965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019680	AGTC	2	8	457977	457984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_019680	GCG	2	6	458102	458107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_019680	GGT	2	6	458129	458134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019680	ATCAA	2	10	458156	458165	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1049	NC_019680	A	6	6	458236	458241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019680	AAT	2	6	458257	458262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019680	GGA	2	6	458266	458271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019680	TTG	2	6	463268	463273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019680	GT	3	6	463276	463281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019680	GCA	2	6	463284	463289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_019680	CAAAG	2	10	463309	463318	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1057	NC_019680	AC	3	6	463524	463529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_019680	TGT	2	6	464191	464196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019680	T	6	6	464205	464210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019680	TCTT	2	8	464229	464236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_019680	GGA	2	6	464259	464264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019680	AGG	2	6	464706	464711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019680	ATGGA	2	10	464729	464738	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019680	TA	3	6	465934	465939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019680	GAA	2	6	465976	465981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019680	T	6	6	466025	466030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019680	ATT	2	6	466071	466076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_019680	TCTT	2	8	466182	466189	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_019680	TTTC	2	8	466200	466207	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_019680	A	6	6	468386	468391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1074	NC_019680	GCC	2	6	471690	471695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_019680	ATT	2	6	471849	471854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_019680	TCA	2	6	472057	472062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_019680	GTCTG	2	10	474535	474544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1082	NC_019680	GGGC	2	8	474606	474613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_019680	CAA	2	6	477091	477096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_019680	GA	3	6	478229	478234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_019680	T	7	7	478591	478597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_019680	GAT	2	6	485175	485180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019680	GCCTG	2	10	485791	485800	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1100	NC_019680	GAC	2	6	485819	485824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1105	NC_019680	GGA	2	6	490179	490184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019680	GAGG	2	8	490188	490195	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019680	CTATCT	2	12	492761	492772	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_019680	T	6	6	493871	493876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019680	CAC	2	6	493914	493919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_019680	GCCG	2	8	493988	493995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_019680	TCA	2	6	494003	494008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1113	NC_019680	TAC	2	6	496917	496922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_019680	ACAT	2	8	496949	496956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_019680	ACT	2	6	497093	497098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_019680	CATTA	2	10	497531	497540	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_019680	TCC	2	6	497593	497598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_019680	AGC	2	6	497599	497604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_019680	TCA	2	6	497677	497682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_019680	GTT	2	6	497685	497690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_019680	GAT	2	6	497805	497810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_019680	GAT	2	6	497894	497899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019680	GTT	2	6	497904	497909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019680	GA	3	6	499091	499096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019680	GCC	2	6	499116	499121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_019680	TTCA	2	8	500882	500889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_019680	GAAG	2	8	500899	500906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_019680	AGTC	2	8	501217	501224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_019680	ATC	2	6	501229	501234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_019680	GA	3	6	501340	501345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019680	ATA	2	6	501395	501400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019680	GAG	2	6	501445	501450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019680	CAT	2	6	501466	501471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_019680	AATT	2	8	501473	501480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019680	TCA	2	6	501507	501512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_019680	A	6	6	502435	502440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_019680	GCAG	2	8	549585	549592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1391	NC_019680	ATC	3	9	600692	600700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1402	NC_019680	ATT	2	6	605398	605403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_019680	GTG	2	6	605547	605552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_019680	AAC	2	6	610009	610014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_019680	A	6	6	610083	610088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_019680	TGA	3	9	610099	610107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_019680	GAT	2	6	612307	612312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_019680	AACTG	2	10	612329	612338	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1415	NC_019680	T	6	6	612390	612395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_019680	CAGC	2	8	612396	612403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1417	NC_019680	AACC	2	8	612405	612412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1420	NC_019680	ACCCC	2	10	614208	614217	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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1426	NC_019680	TCC	2	6	617739	617744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1433	NC_019680	TGG	2	6	625800	625805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_019680	TGAA	2	8	631063	631070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_019680	GGT	3	9	633837	633845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_019680	TTA	2	6	633890	633895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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