MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 1404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019673	CCGGG	2	10	1851	1860	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019673	GAAGA	2	10	2299	2308	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019673	TAGGT	2	10	20881	20890	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019673	GCCGG	2	10	36722	36731	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019673	GCCGG	2	10	36740	36749	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019673	CACCG	2	10	44728	44737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_019673	CGGCG	2	10	53707	53716	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019673	ACCCG	2	10	60936	60945	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_019673	CGGGC	2	10	65935	65944	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019673	CAGCG	2	10	82267	82276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019673	CTCGA	2	10	98248	98257	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019673	CGTTG	2	10	106754	106763	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019673	GCGGT	2	10	115312	115321	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019673	GCGGT	2	10	115333	115342	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019673	GCGGT	2	10	115346	115355	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019673	GCGGT	2	10	115359	115368	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019673	GCGGT	2	10	115372	115381	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019673	GCGGT	2	10	115385	115394	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019673	GTGGC	2	10	150862	150871	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019673	GCGCC	2	10	160737	160746	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_019673	CGGTG	2	10	162136	162145	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019673	CTCTC	2	10	174512	174521	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_019673	GCACC	2	10	181995	182004	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_019673	GCACC	2	10	182280	182289	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_019673	CAGGG	2	10	184257	184266	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019673	GGCCG	2	10	190346	190355	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019673	GATCG	2	10	190379	190388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019673	AGGGG	2	10	197758	197767	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019673	GGCAA	2	10	197845	197854	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019673	CGAAC	2	10	198719	198728	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019673	CGGCC	2	10	201478	201487	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_019673	CACGG	2	10	202843	202852	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019673	CCGGA	2	10	202914	202923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_019673	TCCCG	2	10	205973	205982	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_019673	TGGGC	2	10	206151	206160	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019673	CGTCC	2	10	207691	207700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_019673	TCGAG	2	10	212368	212377	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019673	GTCCG	2	10	214457	214466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019673	TTCAT	2	10	219424	219433	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019673	ACCCG	2	10	220981	220990	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_019673	GTTGT	2	10	222729	222738	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019673	ACCGG	2	10	235092	235101	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019673	GCCCG	2	10	239720	239729	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_019673	CCTCC	2	10	246831	246840	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_019673	CGGTT	2	10	261668	261677	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019673	GACCC	2	10	269498	269507	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_019673	GGTGG	2	10	272181	272190	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019673	GACCT	2	10	274303	274312	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019673	CGTCG	2	10	291348	291357	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_019673	GGGCC	2	10	291472	291481	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_019673	GTTGC	2	10	315351	315360	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019673	CCTGT	2	10	316780	316789	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019673	CCGGC	2	10	323365	323374	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_019673	GTGCG	2	10	338782	338791	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019673	TCGGG	2	10	341090	341099	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019673	GTCCG	2	10	348430	348439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019673	CGGTA	2	10	357674	357683	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019673	GGTCG	4	20	360707	360726	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019673	GTGTG	2	10	363962	363971	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019673	GCTGG	2	10	367475	367484	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019673	GCGTG	2	10	377694	377703	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019673	CCGGC	2	10	386571	386580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_019673	GGTGG	2	10	388973	388982	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019673	CACAC	2	10	407518	407527	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_019673	CGCGG	2	10	407553	407562	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019673	CGGGG	2	10	433838	433847	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019673	GAAAA	2	10	463544	463553	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019673	ACCCC	2	10	469410	469419	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
69	NC_019673	GGGAC	2	10	469658	469667	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019673	CGGGA	2	10	469669	469678	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019673	AGCGG	2	10	475829	475838	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019673	CCCGC	2	10	487882	487891	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
73	NC_019673	TCCGA	2	10	511359	511368	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_019673	GGGGT	2	10	513501	513510	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019673	GGTCG	2	10	519180	519189	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019673	TCGCC	2	10	519219	519228	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_019673	GCCGG	2	10	522546	522555	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_019673	GTGCG	2	10	524110	524119	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019673	TCTGG	2	10	526061	526070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019673	TGCGG	2	10	536118	536127	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019673	CGAAG	2	10	548225	548234	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019673	ACCCC	2	10	554649	554658	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
83	NC_019673	CACCC	2	10	559596	559605	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
84	NC_019673	GCGCG	2	10	566785	566794	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_019673	GCGCC	2	10	582294	582303	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_019673	GATCG	2	10	596124	596133	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_019673	CCGTC	2	10	608457	608466	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_019673	ACTCC	2	10	611033	611042	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_019673	GGTGA	2	10	614364	614373	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019673	CGAGG	2	10	615612	615621	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_019673	CCGGA	2	10	626335	626344	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_019673	ACCTG	2	10	635283	635292	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_019673	GGCCG	2	10	636693	636702	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_019673	CGGGT	2	10	640593	640602	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019673	AGCGC	2	10	645342	645351	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019673	GCCCC	2	10	680112	680121	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
97	NC_019673	CCGGA	2	10	680151	680160	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019673	TGGAC	2	10	693259	693268	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019673	GCCCC	2	10	694780	694789	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_019673	CCGAC	2	10	697837	697846	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_019673	GGCGG	2	10	729428	729437	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019673	CGGTG	2	10	749623	749632	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019673	CGCTG	2	10	765279	765288	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_019673	TGGCG	2	10	775127	775136	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019673	GCCGC	2	10	781506	781515	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_019673	CGAGC	2	10	781525	781534	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_019673	ACCGG	2	10	788914	788923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019673	CGGAA	2	10	791324	791333	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019673	CAGGG	2	10	796002	796011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019673	GCCCG	2	10	796752	796761	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_019673	CTGCC	2	10	809124	809133	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_019673	GTGGC	2	10	809266	809275	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019673	GGTTC	2	10	830916	830925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019673	CGGCG	2	10	834471	834480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_019673	CCGCG	2	10	837510	837519	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_019673	TCGGG	2	10	844095	844104	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019673	CGCGG	2	10	844732	844741	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_019673	GCGGT	2	10	844759	844768	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019673	GCGGG	2	10	844799	844808	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019673	GGCTG	2	10	848035	848044	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019673	GTGGC	2	10	852602	852611	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019673	ACCGG	2	10	852911	852920	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_019673	CGCGG	2	10	871007	871016	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019673	CCCAC	2	10	875488	875497	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_019673	TCGGT	2	10	878498	878507	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019673	CGTGG	2	10	890209	890218	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019673	GGCAG	2	10	890350	890359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019673	GGGTG	2	10	903397	903406	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019673	GGGGC	2	10	909629	909638	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019673	GTCGG	2	10	914477	914486	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019673	GCCGC	2	10	926342	926351	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_019673	GCGAC	2	10	934882	934891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019673	CACCG	2	10	942091	942100	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_019673	GGCAG	2	10	949926	949935	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019673	GGCAG	2	10	949943	949952	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019673	CCGGG	2	10	952159	952168	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_019673	CCGGC	2	10	952397	952406	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_019673	AGCGG	2	10	954982	954991	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019673	GGGTG	2	10	963471	963480	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019673	CAGGG	2	10	981123	981132	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019673	CACCC	2	10	998419	998428	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
142	NC_019673	CCGCG	2	10	998824	998833	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_019673	CCGCG	2	10	998911	998920	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_019673	GTGAT	2	10	999030	999039	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019673	ACCTG	2	10	1006446	1006455	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_019673	TCGTG	2	10	1013121	1013130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019673	CGTCA	2	10	1013457	1013466	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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284	NC_019673	GTCGG	2	10	1825857	1825866	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_019673	CCGTG	2	10	1831226	1831235	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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403	NC_019673	GTACG	2	10	2628879	2628888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_019673	TCGCC	2	10	2745075	2745084	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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420	NC_019673	CCGGT	2	10	2770603	2770612	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
421	NC_019673	ACGGC	2	10	2770833	2770842	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
422	NC_019673	CTCCC	2	10	2772846	2772855	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
423	NC_019673	GGCAC	2	10	2780134	2780143	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
424	NC_019673	GGCCC	2	10	2795373	2795382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
425	NC_019673	TAAGA	2	10	2800803	2800812	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_019673	CGCCC	2	10	3041126	3041135	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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471	NC_019673	GCCCC	2	10	3071445	3071454	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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473	NC_019673	GGTCA	2	10	3073241	3073250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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488	NC_019673	CGCGC	2	10	3205576	3205585	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
489	NC_019673	CCGGC	2	10	3214973	3214982	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
490	NC_019673	TCGGT	2	10	3221909	3221918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
491	NC_019673	CTCGG	2	10	3247134	3247143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
492	NC_019673	ACCCC	3	15	3268250	3268264	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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496	NC_019673	TTTCC	2	10	3283848	3283857	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
497	NC_019673	GTCCG	2	10	3286968	3286977	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
498	NC_019673	CGGAC	2	10	3302288	3302297	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
499	NC_019673	GCCGC	2	10	3305986	3305995	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
500	NC_019673	CGGCT	5	25	3306084	3306108	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

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