MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 25715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019673	CGC	2	6	1286047	1286052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_019673	TGC	2	6	1287136	1287141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_019673	ACTTT	2	10	1287166	1287175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3504	NC_019673	GTG	2	6	1287192	1287197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_019673	GAG	2	6	1287263	1287268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_019673	AGC	2	6	1287278	1287283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_019673	GGC	2	6	1287322	1287327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_019673	CCA	2	6	1287396	1287401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_019673	GGC	2	6	1287444	1287449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_019673	TGGGC	2	10	1287546	1287555	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3511	NC_019673	CGCTT	2	10	1287556	1287565	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3512	NC_019673	CTT	2	6	1287578	1287583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_019673	AAGC	2	8	1287629	1287636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_019673	GAT	2	6	1287671	1287676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_019673	TAG	2	6	1287752	1287757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_019673	ATG	2	6	1287773	1287778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_019673	CGT	2	6	1287806	1287811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_019673	CGG	2	6	1287840	1287845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_019673	TCC	2	6	1287903	1287908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_019673	CGG	2	6	1287935	1287940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_019673	GC	3	6	1287964	1287969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_019673	CGC	2	6	1287975	1287980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_019673	GGC	2	6	1287983	1287988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_019673	GGGC	2	8	1287992	1287999	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_019673	C	6	6	1288054	1288059	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3526	NC_019673	GCC	2	6	1288067	1288072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_019673	AAGAA	2	10	1288079	1288088	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_019673	GC	3	6	1290302	1290307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_019673	TAT	2	6	1290343	1290348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_019673	GCT	2	6	1290357	1290362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_019673	AGCT	2	8	1291623	1291630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_019673	CTA	2	6	1291672	1291677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_019673	TGG	2	6	1291685	1291690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_019673	TGG	2	6	1291697	1291702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_019673	GCC	2	6	1291710	1291715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_019673	TGG	2	6	1291722	1291727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_019673	GCT	2	6	1292173	1292178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_019673	GGTG	2	8	1292223	1292230	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_019673	GTT	2	6	1292237	1292242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_019673	GGTC	2	8	1292255	1292262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_019673	GTG	2	6	1292268	1292273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_019673	GCC	3	9	1292278	1292286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_019673	AGG	2	6	1292295	1292300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_019673	GCAA	2	8	1297198	1297205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_019673	GCC	2	6	1297240	1297245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_019673	GCT	2	6	1297282	1297287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_019673	GCG	2	6	1297303	1297308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_019673	GTG	2	6	1297322	1297327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_019673	TCCG	2	8	1297329	1297336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_019673	GAA	2	6	1297341	1297346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_019673	CGGG	2	8	1297408	1297415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_019673	CGT	2	6	1297452	1297457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_019673	GTGA	2	8	1300455	1300462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_019673	CCA	2	6	1300523	1300528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_019673	CGG	2	6	1300542	1300547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_019673	CCG	2	6	1300569	1300574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_019673	CG	3	6	1301203	1301208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_019673	GTC	2	6	1301215	1301220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_019673	CGG	2	6	1301225	1301230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_019673	CCG	2	6	1301234	1301239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_019673	GTC	2	6	1302811	1302816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_019673	GCCG	2	8	1302817	1302824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_019673	TCG	2	6	1302855	1302860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_019673	CGTC	2	8	1305788	1305795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_019673	GCC	2	6	1310151	1310156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_019673	GTC	2	6	1310184	1310189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_019673	ACC	3	9	1310227	1310235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_019673	TCG	2	6	1310265	1310270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_019673	CCG	2	6	1310346	1310351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_019673	G	6	6	1310375	1310380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_019673	GGA	3	9	1312672	1312680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_019673	CGA	2	6	1312681	1312686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_019673	GTC	2	6	1312692	1312697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_019673	GGCC	2	8	1312705	1312712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_019673	CGG	2	6	1312754	1312759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_019673	GCT	2	6	1312822	1312827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_019673	GCG	2	6	1312832	1312837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_019673	GCCG	2	8	1312850	1312857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_019673	GCGAC	2	10	1312894	1312903	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3580	NC_019673	CGC	3	9	1312911	1312919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3582	NC_019673	CCG	2	6	1312971	1312976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_019673	AC	3	6	1313019	1313024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_019673	TCA	2	6	1313039	1313044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3586	NC_019673	GCA	2	6	1316089	1316094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_019673	CGC	2	6	1316111	1316116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_019673	TCC	2	6	1316252	1316257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_019673	CAA	2	6	1316278	1316283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_019673	CGA	2	6	1316297	1316302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_019673	TCA	2	6	1316337	1316342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_019673	AGC	2	6	1316349	1316354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_019673	CCA	2	6	1316359	1316364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_019673	GCC	3	9	1316365	1316373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_019673	CTAC	2	8	1316427	1316434	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_019673	CG	3	6	1316476	1316481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_019673	CCG	2	6	1316490	1316495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_019673	GGC	2	6	1316515	1316520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_019673	CGG	2	6	1316530	1316535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_019673	TTC	2	6	1316542	1316547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_019673	GTC	2	6	1316628	1316633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_019673	TCA	2	6	1317005	1317010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_019673	CGA	2	6	1318259	1318264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_019673	CGCC	2	8	1318275	1318282	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3605	NC_019673	ACG	2	6	1318782	1318787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_019673	AAC	2	6	1318820	1318825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_019673	GAG	2	6	1318857	1318862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_019673	ACC	2	6	1319496	1319501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_019673	CCA	2	6	1320461	1320466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_019673	CCG	2	6	1320588	1320593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_019673	CGC	2	6	1321617	1321622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_019673	C	6	6	1321635	1321640	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3613	NC_019673	ACGCC	2	10	1321641	1321650	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3614	NC_019673	CCA	2	6	1321682	1321687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_019673	ACC	2	6	1321707	1321712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_019673	GCC	2	6	1321738	1321743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_019673	GGC	2	6	1321803	1321808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_019673	CGC	2	6	1321815	1321820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_019673	GAG	2	6	1322881	1322886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_019673	ACCC	2	8	1323220	1323227	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3621	NC_019673	ACCCCG	2	12	1323231	1323242	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_019673	TGG	3	9	1326849	1326857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_019673	GCT	2	6	1326859	1326864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_019673	CCG	2	6	1327306	1327311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_019673	CGC	2	6	1327326	1327331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_019673	TC	3	6	1327353	1327358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_019673	GGT	2	6	1327365	1327370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_019673	GCGG	2	8	1328114	1328121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3630	NC_019673	ATG	2	6	1332570	1332575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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