MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 25715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019673	TTGC	2	8	2207014	2207021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_019673	GTC	2	6	2207073	2207078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_019673	GAT	2	6	2207163	2207168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_019673	GGTTC	2	10	2207192	2207201	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6005	NC_019673	TCG	2	6	2207231	2207236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_019673	TGG	2	6	2207371	2207376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_019673	TGG	2	6	2207404	2207409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_019673	CGA	2	6	2207416	2207421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_019673	TCG	2	6	2207449	2207454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_019673	GAA	2	6	2207525	2207530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_019673	GTC	2	6	2207596	2207601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_019673	CGC	2	6	2207685	2207690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_019673	CTGAC	2	10	2207738	2207747	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6014	NC_019673	TGC	2	6	2207757	2207762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_019673	TGT	2	6	2207783	2207788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_019673	GGT	2	6	2207801	2207806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_019673	GTG	2	6	2208183	2208188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_019673	TGG	2	6	2208229	2208234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_019673	CGG	2	6	2208262	2208267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_019673	CGGGC	2	10	2208274	2208283	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6021	NC_019673	CCTCGA	2	12	2208941	2208952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_019673	AAC	2	6	2208990	2208995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_019673	CAC	2	6	2208998	2209003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_019673	GAAA	2	8	2210237	2210244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_019673	TCG	2	6	2210245	2210250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_019673	GC	3	6	2210264	2210269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_019673	GTG	2	6	2210270	2210275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_019673	GGT	2	6	2210824	2210829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019673	CTG	2	6	2210914	2210919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_019673	GCG	2	6	2210923	2210928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_019673	TCA	2	6	2210929	2210934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_019673	CGT	2	6	2210942	2210947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_019673	TGC	2	6	2211007	2211012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_019673	GCG	2	6	2211042	2211047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_019673	GTC	2	6	2211351	2211356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_019673	CGC	2	6	2214087	2214092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_019673	CAC	2	6	2214199	2214204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_019673	CCA	2	6	2214923	2214928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_019673	GCG	2	6	2214940	2214945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_019673	GAA	2	6	2214998	2215003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_019673	GCA	2	6	2215019	2215024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_019673	CAG	2	6	2215026	2215031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_019673	CGCAG	2	10	2215053	2215062	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6044	NC_019673	CAG	2	6	2215105	2215110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_019673	GCA	2	6	2215190	2215195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_019673	CGA	2	6	2215211	2215216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_019673	AGC	2	6	2215258	2215263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_019673	ACC	2	6	2215264	2215269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_019673	GTCG	2	8	2216932	2216939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_019673	CGA	2	6	2216963	2216968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_019673	CGGA	2	8	2216994	2217001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_019673	GCA	2	6	2217026	2217031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_019673	CCG	2	6	2217095	2217100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_019673	GC	3	6	2217117	2217122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_019673	CGGA	2	8	2217136	2217143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_019673	GGT	2	6	2217181	2217186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_019673	GCGGG	2	10	2217198	2217207	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6058	NC_019673	TGC	2	6	2217219	2217224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_019673	CG	3	6	2217239	2217244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_019673	GGA	2	6	2218486	2218491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_019673	ACG	2	6	2218532	2218537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_019673	GAG	2	6	2218564	2218569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_019673	CTC	2	6	2218588	2218593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_019673	TCC	2	6	2218616	2218621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_019673	GACG	2	8	2218625	2218632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_019673	GGT	2	6	2218639	2218644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_019673	CGG	3	9	2222057	2222065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_019673	GGC	2	6	2222096	2222101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_019673	CGG	2	6	2222115	2222120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_019673	GGC	2	6	2222147	2222152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_019673	CGG	2	6	2222155	2222160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_019673	CGC	2	6	2223954	2223959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_019673	GTC	2	6	2223984	2223989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_019673	CGC	2	6	2223990	2223995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_019673	CCT	2	6	2224012	2224017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_019673	CCT	2	6	2224026	2224031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_019673	CCT	2	6	2224040	2224045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_019673	CCGC	2	8	2225276	2225283	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6079	NC_019673	GTC	2	6	2225286	2225291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_019673	CCGC	2	8	2226895	2226902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6081	NC_019673	ACCG	2	8	2226910	2226917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_019673	GGCG	2	8	2228168	2228175	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_019673	GCC	2	6	2228182	2228187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_019673	GCG	2	6	2228203	2228208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_019673	GC	3	6	2228214	2228219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6086	NC_019673	CGGG	2	8	2228273	2228280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_019673	CGA	2	6	2228282	2228287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_019673	GGAG	2	8	2228288	2228295	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_019673	CCG	2	6	2229834	2229839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_019673	ACG	2	6	2229843	2229848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6092	NC_019673	GTG	2	6	2231782	2231787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_019673	GTG	2	6	2233530	2233535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_019673	GGGT	2	8	2234428	2234435	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_019673	GCA	2	6	2234475	2234480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_019673	GC	3	6	2234510	2234515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_019673	CCCG	2	8	2234517	2234524	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6098	NC_019673	CGC	2	6	2234567	2234572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_019673	AGGA	2	8	2235802	2235809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_019673	CGA	2	6	2238054	2238059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_019673	CAGC	2	8	2238066	2238073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_019673	CCCGG	2	10	2239596	2239605	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6103	NC_019673	CGC	2	6	2241432	2241437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_019673	CCCGG	2	10	2241458	2241467	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6105	NC_019673	GTC	2	6	2241502	2241507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_019673	CGC	2	6	2241607	2241612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_019673	CAA	2	6	2241666	2241671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_019673	GGT	2	6	2241747	2241752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_019673	CA	3	6	2241787	2241792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_019673	GCG	2	6	2241980	2241985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_019673	CTC	2	6	2244555	2244560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_019673	CGG	2	6	2244611	2244616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_019673	CCG	2	6	2244656	2244661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_019673	CGC	2	6	2244668	2244673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_019673	AAT	2	6	2245155	2245160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_019673	AAG	2	6	2245196	2245201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_019673	CCT	2	6	2245206	2245211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_019673	CAC	2	6	2245311	2245316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_019673	GTGCC	2	10	2251147	2251156	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6120	NC_019673	CGC	2	6	2251164	2251169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_019673	GC	3	6	2251175	2251180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_019673	GCG	2	6	2251220	2251225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_019673	GC	3	6	2252196	2252201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_019673	CG	3	6	2252218	2252223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_019673	GCCC	2	8	2252917	2252924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6126	NC_019673	GGC	2	6	2253033	2253038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_019673	GCA	2	6	2253044	2253049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_019673	CAC	2	6	2253082	2253087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_019673	GC	4	8	2253125	2253132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_019673	GAC	2	6	2253152	2253157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_019673	CGG	3	9	2253228	2253236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_019673	GTG	2	6	2253257	2253262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6138	NC_019673	CTG	2	6	2253503	2253508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6141	NC_019673	GTC	2	6	2253653	2253658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6242	NC_019673	CCCGA	2	10	2282240	2282249	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6247	NC_019673	CGAC	2	8	2284151	2284158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6248	NC_019673	CCGGG	2	10	2284159	2284168	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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6250	NC_019673	TGT	2	6	2284247	2284252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6252	NC_019673	CAG	2	6	2284308	2284313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_019673	GC	3	6	2284335	2284340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_019673	GAG	2	6	2284375	2284380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_019673	GGTC	2	8	2284424	2284431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6256	NC_019673	CAT	2	6	2284464	2284469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6258	NC_019673	GCA	2	6	2284707	2284712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_019673	CCCG	2	8	2284746	2284753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6260	NC_019673	ACC	2	6	2284853	2284858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6261	NC_019673	CCGG	2	8	2284889	2284896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6262	NC_019673	AGGAG	2	10	2284963	2284972	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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6264	NC_019673	CCGG	2	8	2285070	2285077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6265	NC_019673	ATC	2	6	2285095	2285100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6389	NC_019673	CGATGT	2	12	2328615	2328626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6390	NC_019673	CCG	3	9	2328697	2328705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6391	NC_019673	CGT	2	6	2328821	2328826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6500	NC_019673	CTC	2	6	2373656	2373661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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