MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 7593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019048	ATA	2	6	905281	905286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_019048	A	6	6	905286	905291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019048	TCAC	2	8	905309	905316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_019048	T	7	7	905354	905360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_019048	TCAGA	2	10	905451	905460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4006	NC_019048	CTT	2	6	905487	905492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_019048	T	7	7	905551	905557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_019048	ATC	2	6	905579	905584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_019048	TCCC	2	8	905595	905602	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4010	NC_019048	ATA	3	9	905603	905611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_019048	T	6	6	905617	905622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_019048	T	6	6	905661	905666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_019048	AAAC	2	8	905702	905709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_019048	AGCAT	2	10	905949	905958	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4015	NC_019048	TAT	2	6	905991	905996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019048	A	7	7	906002	906008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_019048	A	6	6	906044	906049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_019048	A	6	6	906052	906057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_019048	TAT	2	6	906108	906113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_019048	TTCTA	2	10	906114	906123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4021	NC_019048	CTC	2	6	906185	906190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_019048	TCA	2	6	906215	906220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_019048	TCT	2	6	906224	906229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_019048	ATA	2	6	906237	906242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_019048	CT	3	6	906261	906266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_019048	AAT	2	6	906306	906311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_019048	AAC	2	6	906400	906405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_019048	CTA	2	6	906408	906413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_019048	TAC	2	6	906440	906445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_019048	CTAC	2	8	906477	906484	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_019048	T	6	6	906489	906494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_019048	ATTA	2	8	906521	906528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_019048	CAA	2	6	907259	907264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_019048	ATT	2	6	907272	907277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_019048	T	6	6	907286	907291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_019048	AT	3	6	907295	907300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_019048	ATT	2	6	907314	907319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_019048	ATT	2	6	907324	907329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_019048	T	6	6	908490	908495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_019048	CTC	2	6	911761	911766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_019048	TTTC	2	8	913804	913811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_019048	A	6	6	913828	913833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_019048	CCT	2	6	913835	913840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_019048	AGG	2	6	913847	913852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_019048	TAGA	2	8	913871	913878	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019048	AACT	2	8	913880	913887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_019048	CT	3	6	913918	913923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_019048	TAA	2	6	913945	913950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_019048	CT	3	6	916618	916623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_019048	ATA	2	6	916630	916635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_019048	TTG	2	6	916637	916642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_019048	A	6	6	916663	916668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_019048	ATG	2	6	916728	916733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_019048	CT	3	6	916748	916753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_019048	AAAT	2	8	916809	916816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_019048	TTA	2	6	918026	918031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_019048	TGAT	2	8	919595	919602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_019048	TTA	2	6	919611	919616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_019048	A	6	6	919616	919621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_019048	TACAT	2	10	919655	919664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4061	NC_019048	AG	3	6	919687	919692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_019048	CCT	2	6	920060	920065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_019048	TCATTT	2	12	920098	920109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4064	NC_019048	TGT	2	6	921320	921325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_019048	TCA	2	6	921326	921331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_019048	TAT	2	6	921358	921363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_019048	A	6	6	921400	921405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_019048	AACC	2	8	921414	921421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_019048	T	6	6	921454	921459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_019048	ATTG	2	8	921460	921467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_019048	AT	3	6	921469	921474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_019048	T	7	7	922039	922045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_019048	TAT	3	9	922064	922072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_019048	TA	4	8	922085	922092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_019048	GTTA	2	8	922127	922134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019048	TAT	2	6	922144	922149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_019048	GATA	2	8	922192	922199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019048	ATA	2	6	922229	922234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_019048	ATT	2	6	922274	922279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_019048	TTAT	2	8	922361	922368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_019048	A	8	8	922371	922378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_019048	TTCT	2	8	922395	922402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_019048	T	6	6	922402	922407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_019048	AGT	3	9	922446	922454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_019048	AAG	2	6	922483	922488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_019048	CA	3	6	922492	922497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_019048	AGT	2	6	922576	922581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019048	TTC	2	6	922632	922637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_019048	ATTAA	2	10	922652	922661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_019048	AAAT	2	8	922662	922669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_019048	TAT	2	6	924277	924282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_019048	TAT	2	6	924309	924314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_019048	TAT	2	6	924383	924388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_019048	ATA	2	6	926076	926081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_019048	T	7	7	926116	926122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_019048	GA	3	6	926123	926128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019048	TAA	3	9	928075	928083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019048	TCC	2	6	930130	930135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_019048	AGG	2	6	930224	930229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_019048	TCAC	2	8	930256	930263	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_019048	T	6	6	930305	930310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019048	ACT	2	6	930328	930333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_019048	TGT	2	6	930364	930369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019048	CAT	2	6	930509	930514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_019048	TTC	2	6	930620	930625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_019048	CTT	2	6	930664	930669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_019048	TCTTT	2	10	930750	930759	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4108	NC_019048	A	6	6	930777	930782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_019048	AGA	2	6	930806	930811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019048	TG	3	6	930892	930897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_019048	ATTGCA	2	12	930928	930939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4112	NC_019048	TGC	2	6	931133	931138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_019048	ACG	2	6	931169	931174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_019048	GTC	2	6	931190	931195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_019048	AGA	2	6	931220	931225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_019048	AAAT	2	8	931295	931302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_019048	CCT	2	6	932160	932165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_019048	ATTT	2	8	932187	932194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019048	AAG	2	6	932249	932254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_019048	AT	3	6	932257	932262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_019048	TTTA	2	8	932265	932272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_019048	T	7	7	932282	932288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_019048	TTTAA	2	10	933552	933561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019048	GAA	2	6	934155	934160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_019048	CTTA	2	8	934176	934183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_019048	A	7	7	934202	934208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019048	A	7	7	935973	935979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_019048	AGA	2	6	936012	936017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_019048	T	6	6	936065	936070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_019048	ATCT	2	8	936073	936080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4131	NC_019048	TAT	2	6	936091	936096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_019048	ATA	2	6	936138	936143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_019048	ATA	2	6	936203	936208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_019048	AAAT	2	8	936257	936264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_019048	TAA	2	6	936270	936275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_019048	T	7	7	936287	936293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_019048	TAC	2	6	936308	936313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4139	NC_019048	ATA	2	6	936410	936415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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