MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 7593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019048	CTTT	2	8	630787	630794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_019048	ATA	2	6	630797	630802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_019048	TAT	2	6	630806	630811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_019048	A	6	6	630836	630841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019048	TA	3	6	630863	630868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_019048	TTA	2	6	630880	630885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_019048	TGA	2	6	630892	630897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_019048	ACA	2	6	630925	630930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_019048	GA	3	6	630935	630940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_019048	CAA	2	6	630941	630946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_019048	GAA	2	6	630952	630957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_019048	AGC	2	6	631101	631106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_019048	TAA	2	6	631122	631127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_019048	TC	3	6	631155	631160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_019048	ATG	2	6	631295	631300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_019048	ATTT	2	8	631301	631308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_019048	A	6	6	631313	631318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_019048	TGT	2	6	631325	631330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_019048	AGG	2	6	631446	631451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_019048	TGG	2	6	631512	631517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_019048	AAG	2	6	631556	631561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019048	AAC	2	6	631589	631594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_019048	TGC	2	6	631602	631607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_019048	GGAT	2	8	631618	631625	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_019048	T	6	6	631659	631664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_019048	ATA	2	6	631681	631686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_019048	TTG	2	6	631807	631812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019048	T	7	7	631962	631968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_019048	AAG	2	6	634221	634226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_019048	AGA	2	6	634235	634240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019048	AAT	2	6	634275	634280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_019048	AGT	2	6	634670	634675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_019048	TAGA	2	8	634694	634701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019048	AAG	2	6	634702	634707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_019048	AAG	2	6	635192	635197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019048	AGG	2	6	636912	636917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_019048	TAG	2	6	637764	637769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_019048	CTT	2	6	637770	637775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_019048	T	8	8	637774	637781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019048	ATA	2	6	638103	638108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019048	T	6	6	638123	638128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019048	T	6	6	638152	638157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_019048	A	7	7	638161	638167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019048	TAG	3	9	638186	638194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_019048	TAC	2	6	638213	638218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_019048	T	6	6	638228	638233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_019048	GGAAA	2	10	638239	638248	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_019048	A	7	7	638246	638252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019048	T	6	6	638287	638292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_019048	TATT	2	8	638348	638355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019048	ATTT	2	8	639335	639342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019048	TTAA	2	8	639410	639417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019048	AAT	2	6	639425	639430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019048	AGA	2	6	640809	640814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019048	T	7	7	641113	641119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_019048	A	7	7	641156	641162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_019048	AGG	2	6	641201	641206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_019048	CAT	2	6	642028	642033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_019048	ATGT	2	8	642057	642064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_019048	GTTCA	2	10	642077	642086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3061	NC_019048	T	6	6	642097	642102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019048	ATACT	2	10	643455	643464	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3063	NC_019048	TAA	2	6	643530	643535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_019048	ATT	2	6	643566	643571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_019048	ATT	2	6	643618	643623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_019048	T	6	6	643682	643687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_019048	AAT	2	6	643702	643707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_019048	ATT	3	9	643796	643804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_019048	AGA	2	6	643819	643824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_019048	TTC	2	6	643866	643871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3072	NC_019048	GA	3	6	643963	643968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_019048	T	7	7	643998	644004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_019048	TCCC	2	8	644052	644059	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3075	NC_019048	TTTTA	2	10	644089	644098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_019048	GGGT	2	8	647604	647611	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_019048	AT	3	6	647616	647621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_019048	TCC	2	6	649119	649124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3081	NC_019048	AGAA	2	8	649271	649278	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_019048	AAT	2	6	650195	650200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_019048	ATT	2	6	650221	650226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_019048	TAA	2	6	651377	651382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_019048	GTTT	2	8	651383	651390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_019048	TAT	2	6	651397	651402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_019048	GAT	2	6	651413	651418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_019048	AAT	2	6	651471	651476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_019048	ATA	2	6	651478	651483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_019048	TAATG	2	10	651552	651561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_019048	A	6	6	652282	652287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_019048	A	6	6	653183	653188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_019048	A	7	7	653220	653226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_019048	GAAAT	2	10	653248	653257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_019048	TAA	2	6	653260	653265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_019048	A	6	6	653264	653269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_019048	TAA	2	6	654280	654285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_019048	TAA	2	6	654298	654303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_019048	CCA	2	6	654408	654413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_019048	ATT	2	6	654452	654457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_019048	TGAGAT	2	12	654460	654471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_019048	CAG	2	6	654496	654501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_019048	AGTA	2	8	654502	654509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_019048	GTA	2	6	654527	654532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_019048	AGC	2	6	654557	654562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_019048	ATC	3	9	654563	654571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_019048	CTTC	2	8	654607	654614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_019048	ATA	2	6	654615	654620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_019048	TCC	2	6	654647	654652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_019048	AGC	2	6	654686	654691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_019048	AAGT	2	8	654695	654702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019048	AAGT	2	8	654720	654727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_019048	AGT	2	6	654790	654795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_019048	GT	3	6	654921	654926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_019048	GCA	2	6	654989	654994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3117	NC_019048	TTA	2	6	655010	655015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_019048	CAT	2	6	655119	655124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_019048	TACT	2	8	655128	655135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_019048	TGTC	2	8	655268	655275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_019048	CTT	2	6	655293	655298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_019048	AGA	2	6	655307	655312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_019048	GCA	2	6	655391	655396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_019048	TAA	2	6	655630	655635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_019048	AAAG	3	12	655738	655749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_019048	AGT	2	6	655822	655827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_019048	T	8	8	655937	655944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_019048	A	6	6	655985	655990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_019048	AG	3	6	656007	656012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_019048	T	6	6	656053	656058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_019048	TAA	2	6	656080	656085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_019048	GTT	2	6	656088	656093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_019048	A	6	6	656137	656142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_019048	ATAA	2	8	656170	656177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_019048	TCTA	2	8	656194	656201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3136	NC_019048	TAG	2	6	656244	656249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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