MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 7593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019048	TGA	2	6	192674	192679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019048	AGT	2	6	192699	192704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019048	TAA	2	6	192714	192719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019048	ATT	2	6	192724	192729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019048	TA	3	6	192768	192773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019048	TCCTTT	2	12	193009	193020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_019048	CT	3	6	193107	193112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_019048	TTAT	2	8	193127	193134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019048	A	6	6	193203	193208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019048	TAA	2	6	193211	193216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019048	TAT	2	6	193243	193248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019048	TTA	2	6	193290	193295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019048	TG	3	6	193318	193323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019048	TTA	2	6	193386	193391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019048	TAT	2	6	193406	193411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019048	AAT	2	6	193426	193431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019048	GGTT	2	8	193484	193491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019048	ATT	2	6	193511	193516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019048	TAT	2	6	193636	193641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019048	GAA	2	6	193643	193648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019048	TAT	2	6	193663	193668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019048	ATTC	2	8	193736	193743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_019048	TAT	2	6	193765	193770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019048	TAT	2	6	193805	193810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_019048	TTA	2	6	193848	193853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019048	ATG	2	6	193889	193894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019048	A	6	6	193902	193907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019048	TTAA	2	8	195868	195875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019048	AGAAC	2	10	195882	195891	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_019048	TAC	2	6	195933	195938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_019048	AGA	2	6	195940	195945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019048	T	6	6	196256	196261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019048	TAT	2	6	196312	196317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019048	GTT	2	6	196332	196337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019048	T	8	8	196336	196343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019048	TTC	2	6	196362	196367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019048	G	6	6	196391	196396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019048	TAA	2	6	196404	196409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019048	AAG	2	6	197726	197731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019048	AT	3	6	198472	198477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019048	TTC	2	6	198488	198493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_019048	AAT	3	9	198504	198512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019048	GAG	2	6	198516	198521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019048	T	7	7	198986	198992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019048	GAG	2	6	199704	199709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019048	TGT	2	6	202209	202214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019048	CTT	2	6	202240	202245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_019048	T	7	7	202244	202250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019048	TAA	2	6	202331	202336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019048	AAGG	2	8	202337	202344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019048	ATG	2	6	203580	203585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019048	TTA	2	6	203657	203662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019048	TAAT	2	8	203684	203691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019048	T	6	6	203715	203720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019048	A	6	6	203733	203738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019048	ATT	2	6	203751	203756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019048	A	6	6	203765	203770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019048	T	6	6	205497	205502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019048	CTA	2	6	208754	208759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_019048	TAG	2	6	208767	208772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019048	T	6	6	208776	208781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019048	AG	3	6	208786	208791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019048	TAT	2	6	208864	208869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019048	ATTT	2	8	208876	208883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019048	T	6	6	208897	208902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019048	ATG	2	6	209043	209048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019048	AGT	2	6	209138	209143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019048	AAGGTA	2	12	209150	209161	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019048	GAG	2	6	209165	209170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019048	ATT	2	6	209219	209224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019048	ATG	2	6	209229	209234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019048	GT	3	6	209279	209284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019048	GGC	2	6	209292	209297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019048	A	7	7	209312	209318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019048	GT	3	6	209336	209341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019048	GCTG	2	8	209349	209356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_019048	ATT	2	6	209371	209376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_019048	ATT	2	6	209383	209388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019048	TGG	2	6	209391	209396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_019048	GTT	2	6	209458	209463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019048	TAG	2	6	209513	209518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019048	T	6	6	209550	209555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019048	ATTTC	2	10	209577	209586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_019048	ACT	2	6	209629	209634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_019048	CAG	3	9	209711	209719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_019048	A	6	6	209765	209770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019048	CTTA	2	8	209822	209829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_019048	TCT	2	6	209834	209839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_019048	GTT	2	6	209860	209865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019048	TAT	2	6	209904	209909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019048	TTGG	2	8	209936	209943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019048	TTA	2	6	210044	210049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019048	CAC	2	6	210058	210063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_019048	ACTCA	2	10	210082	210091	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1095	NC_019048	GAT	2	6	210129	210134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_019048	ATG	2	6	210194	210199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_019048	GCT	2	6	210226	210231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_019048	TTG	2	6	210299	210304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019048	AT	3	6	210414	210419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019048	A	6	6	210484	210489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019048	GTC	2	6	210583	210588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_019048	GTA	2	6	210607	210612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019048	ATT	2	6	210777	210782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019048	AGA	2	6	210927	210932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019048	AAG	2	6	210971	210976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019048	AGA	2	6	210987	210992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_019048	A	6	6	211078	211083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019048	GAA	2	6	211113	211118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019048	ATT	2	6	211152	211157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019048	A	6	6	211169	211174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019048	TGA	2	6	211214	211219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019048	CAG	2	6	211250	211255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_019048	GA	3	6	216906	216911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019048	GGT	2	6	216921	216926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019048	GGT	2	6	217958	217963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019048	AT	3	6	219308	219313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019048	ACA	2	6	219588	219593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_019048	T	6	6	219628	219633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019048	GAG	2	6	219665	219670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_019048	TTA	2	6	219708	219713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_019048	ATTT	2	8	219738	219745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019048	TAA	2	6	219778	219783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019048	AATG	2	8	219806	219813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019048	ATA	2	6	219814	219819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019048	A	6	6	219945	219950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_019048	AAT	2	6	219958	219963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_019048	AG	3	6	225358	225363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019048	CT	3	6	225372	225377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_019048	T	6	6	225377	225382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019048	TTG	2	6	225399	225404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019048	ATA	2	6	225449	225454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019048	AGCC	2	8	226741	226748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_019048	T	7	7	226754	226760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019048	ATA	2	6	226764	226769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_019048	A	6	6	261851	261856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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