MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 7593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019048	TAT	2	6	1213341	1213346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_019048	A	6	6	1213374	1213379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019048	TAT	2	6	1214225	1214230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019048	ATC	2	6	1214248	1214253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_019048	T	7	7	1214271	1214277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019048	TAA	2	6	1214332	1214337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_019048	A	6	6	1214387	1214392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_019048	TAA	2	6	1214406	1214411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_019048	AACT	2	8	1214414	1214421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_019048	ATA	2	6	1214460	1214465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_019048	ATA	2	6	1214494	1214499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_019048	ATA	2	6	1215454	1215459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_019048	CTTT	2	8	1215478	1215485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_019048	TAT	2	6	1215513	1215518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_019048	ATTT	2	8	1215549	1215556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019048	T	6	6	1215695	1215700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019048	AAC	2	6	1215713	1215718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_019048	CCTT	2	8	1215732	1215739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_019048	TGC	2	6	1215860	1215865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_019048	TCTA	2	8	1215902	1215909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_019048	TTA	2	6	1215934	1215939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019048	CTG	2	6	1215961	1215966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_019048	TTA	2	6	1215973	1215978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_019048	ATC	2	6	1216089	1216094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_019048	TGG	2	6	1216097	1216102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_019048	TA	3	6	1216162	1216167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_019048	AG	3	6	1216187	1216192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_019048	A	7	7	1216260	1216266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_019048	TGA	2	6	1216341	1216346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019048	GTA	2	6	1216349	1216354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019048	CTA	2	6	1216481	1216486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_019048	TAA	2	6	1216491	1216496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019048	TTA	2	6	1216580	1216585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_019048	TTG	2	6	1216674	1216679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5036	NC_019048	T	6	6	1216728	1216733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_019048	TA	3	6	1217764	1217769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_019048	ACA	2	6	1217780	1217785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_019048	A	6	6	1217790	1217795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019048	ATT	2	6	1217829	1217834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_019048	CTT	2	6	1217835	1217840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_019048	AC	3	6	1217845	1217850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_019048	AGG	2	6	1217874	1217879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_019048	TTTTA	2	10	1218192	1218201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_019048	CTAT	2	8	1218214	1218221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5048	NC_019048	CAA	2	6	1218250	1218255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_019048	A	6	6	1218272	1218277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_019048	T	6	6	1218296	1218301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_019048	ACT	2	6	1218306	1218311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5053	NC_019048	AATT	2	8	1219781	1219788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_019048	AAT	2	6	1219789	1219794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_019048	T	6	6	1219798	1219803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_019048	T	7	7	1219818	1219824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019048	ATA	2	6	1219854	1219859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_019048	TAT	2	6	1219863	1219868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_019048	T	6	6	1219912	1219917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_019048	TAT	2	6	1219984	1219989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_019048	AATATA	2	12	1219994	1220005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019048	AAAT	2	8	1220066	1220073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_019048	ACA	2	6	1220091	1220096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5065	NC_019048	ATA	2	6	1222400	1222405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5074	NC_019048	T	7	7	1225227	1225233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_019048	A	8	8	1225234	1225241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_019048	GACTT	2	10	1225242	1225251	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_019048	T	7	7	1225250	1225256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_019048	TTTCT	2	10	1228908	1228917	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5083	NC_019048	A	6	6	1228970	1228975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_019048	A	7	7	1229005	1229011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_019048	ATCA	2	8	1229262	1229269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5092	NC_019048	TGGT	2	8	1229486	1229493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_019048	A	7	7	1229682	1229688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_019048	AG	3	6	1229700	1229705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_019048	GAA	2	6	1229734	1229739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_019048	A	6	6	1229755	1229760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019048	TATTGT	2	12	1229781	1229792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5104	NC_019048	ATT	2	6	1229875	1229880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_019048	GAA	2	6	1229986	1229991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_019048	CTT	2	6	1230048	1230053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_019048	CAT	2	6	1230058	1230063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_019048	CT	3	6	1230101	1230106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_019048	TCA	2	6	1230169	1230174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_019048	A	6	6	1230178	1230183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_019048	TA	3	6	1231089	1231094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_019048	ATTT	2	8	1231120	1231127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_019048	TA	3	6	1234200	1234205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_019048	AAAT	2	8	1234206	1234213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_019048	T	6	6	1234286	1234291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_019048	CTT	2	6	1234315	1234320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5133	NC_019048	CTT	2	6	1234399	1234404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_019048	TCA	2	6	1234416	1234421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5255	NC_019048	TCT	2	6	1252313	1252318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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