MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMB

Total Repeats: 621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018701	GTCG	2	8	3727	3734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018701	GCTG	2	8	8141	8148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018701	GGTA	2	8	10120	10127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018701	GCGG	2	8	11340	11347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018701	AGCG	2	8	14316	14323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018701	ACTA	2	8	14434	14441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018701	AATC	2	8	14450	14457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018701	CGTC	2	8	15360	15367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018701	AAAG	2	8	15471	15478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018701	GGTC	2	8	18080	18087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018701	GGCC	2	8	18445	18452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018701	TCCC	2	8	18485	18492	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_018701	CGGG	2	8	18794	18801	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018701	TGCC	2	8	24039	24046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018701	GAGG	2	8	28486	28493	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018701	GTCG	2	8	28510	28517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018701	GCGG	2	8	28944	28951	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018701	CATT	2	8	34015	34022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018701	GCTG	2	8	34106	34113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018701	GCGG	2	8	38662	38669	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018701	ACGG	2	8	42551	42558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018701	TCAA	2	8	43567	43574	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018701	GAGG	2	8	48921	48928	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018701	CCTC	2	8	50006	50013	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_018701	TCCC	2	8	59033	59040	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_018701	GAAG	2	8	63815	63822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018701	GCCG	2	8	63829	63836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018701	CCCG	2	8	73336	73343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_018701	CCGC	2	8	79849	79856	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_018701	GGGC	2	8	82082	82089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018701	ACAG	2	8	82164	82171	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018701	GCAA	2	8	83286	83293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018701	CCGC	2	8	84595	84602	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_018701	CTAA	2	8	84611	84618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018701	GCTT	2	8	92254	92261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018701	CCGC	2	8	97952	97959	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_018701	CCGC	2	8	113069	113076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_018701	GCCG	2	8	118989	118996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018701	GACC	2	8	119155	119162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018701	TTAA	2	8	119243	119250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018701	CTTC	2	8	120630	120637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018701	TCCG	2	8	122151	122158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018701	CGGA	2	8	122171	122178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018701	CATG	2	8	126624	126631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018701	AAGT	2	8	130466	130473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018701	CTCC	2	8	133397	133404	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_018701	GCGG	2	8	139759	139766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018701	CGCA	2	8	139772	139779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018701	AGGG	2	8	143854	143861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018701	AAGC	2	8	144875	144882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018701	GCCC	2	8	150556	150563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018701	GCCG	2	8	155116	155123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018701	AAAG	2	8	159361	159368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018701	GCCG	2	8	159373	159380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018701	TTCA	2	8	171209	171216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018701	TACA	2	8	171256	171263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018701	TGAA	2	8	171291	171298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018701	CATC	2	8	173498	173505	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018701	GCAC	2	8	195377	195384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018701	CCTT	2	8	196142	196149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018701	CTGT	2	8	199229	199236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018701	GGCC	2	8	200517	200524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018701	TCGA	2	8	202070	202077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018701	GATC	2	8	204961	204968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018701	CGCA	2	8	205002	205009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018701	GGTC	2	8	206460	206467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018701	TGCC	2	8	206680	206687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018701	CAAG	2	8	207794	207801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018701	GCCC	2	8	210167	210174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_018701	CAGG	2	8	210186	210193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018701	TGCC	2	8	212297	212304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018701	CGGA	2	8	217214	217221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018701	AGCC	2	8	217426	217433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018701	GAAA	2	8	217509	217516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018701	GCGG	2	8	218661	218668	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018701	AACA	2	8	221478	221485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018701	ATGA	2	8	224606	224613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018701	CGGA	2	8	228723	228730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018701	GGCC	2	8	232671	232678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018701	GGGT	2	8	240681	240688	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018701	CGGC	2	8	242261	242268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018701	CCGC	2	8	253246	253253	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_018701	CGGC	2	8	255012	255019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018701	GATG	2	8	257936	257943	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018701	GCGG	3	12	263733	263744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018701	CCGC	2	8	263758	263765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_018701	CCAA	2	8	266802	266809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018701	ACCG	2	8	269762	269769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018701	ACCA	2	8	270041	270048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018701	GCGG	2	8	278994	279001	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018701	GGAA	2	8	279592	279599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018701	GACA	2	8	279659	279666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018701	AAGA	2	8	280675	280682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018701	CGGC	2	8	285629	285636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018701	GGAC	2	8	287579	287586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018701	GCGG	2	8	288928	288935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018701	TGGA	2	8	290122	290129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018701	CCGG	3	12	293033	293044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018701	ACGC	2	8	295053	295060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018701	CGTC	2	8	300819	300826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018701	CGGT	2	8	301087	301094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018701	CTTC	2	8	301232	301239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018701	AGGC	2	8	302342	302349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018701	CCAG	2	8	307610	307617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018701	GCAT	2	8	307703	307710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018701	TTGC	2	8	318964	318971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018701	CGGA	2	8	319205	319212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018701	GCCT	2	8	321670	321677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018701	GGCA	2	8	321720	321727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018701	GCTC	2	8	329229	329236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018701	CGCC	2	8	329667	329674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_018701	TGCG	2	8	331033	331040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018701	ATTC	2	8	332802	332809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018701	CGGG	2	8	333125	333132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018701	CGAA	2	8	333499	333506	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018701	CGGC	2	8	335093	335100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018701	GAGC	2	8	335101	335108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018701	GTCG	2	8	335226	335233	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018701	CGAT	2	8	335611	335618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018701	CGCT	2	8	336877	336884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018701	TGCG	2	8	337514	337521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018701	TCGA	2	8	338127	338134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018701	TAAG	2	8	338535	338542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018701	GCCG	2	8	340036	340043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018701	CCGA	2	8	344677	344684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018701	GAAC	2	8	347176	347183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018701	GTCG	2	8	352280	352287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018701	CGAT	2	8	353605	353612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018701	TGCC	2	8	359030	359037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018701	CTGG	2	8	362548	362555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018701	CGGG	2	8	364772	364779	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018701	CCAG	2	8	373451	373458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018701	GCGG	2	8	378463	378470	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018701	TCGT	2	8	378473	378480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018701	CCAG	2	8	382636	382643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018701	CGGA	2	8	382919	382926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018701	CTGA	2	8	386731	386738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018701	TCCA	2	8	387262	387269	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018701	AGAT	2	8	387273	387280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018701	GCAG	2	8	387357	387364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018701	GCTT	2	8	387439	387446	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018701	ATGA	2	8	387574	387581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018701	CGGC	2	8	387901	387908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018701	GACG	2	8	388130	388137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018701	GGCG	2	8	388381	388388	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018701	TCAC	2	8	388591	388598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018701	ACGA	2	8	390459	390466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018701	GCCG	2	8	390496	390503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018701	AGTG	2	8	391517	391524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018701	CGGC	2	8	392214	392221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018701	GGCG	2	8	394619	394626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018701	GGCC	2	8	395060	395067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018701	CTGC	2	8	395672	395679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_018701	CAGC	2	8	397353	397360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_018701	GCAA	2	8	397672	397679	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_018701	TGAT	2	8	398550	398557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018701	GCCG	2	8	399113	399120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_018701	GTCT	2	8	401650	401657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_018701	CGTC	2	8	403562	403569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_018701	CGCA	2	8	406954	406961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_018701	GGCC	2	8	410997	411004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_018701	TCCC	2	8	412364	412371	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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165	NC_018701	TTGG	2	8	413427	413434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018701	ATCT	2	8	429957	429964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_018701	CCGC	2	8	430955	430962	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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172	NC_018701	GGCT	2	8	435513	435520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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174	NC_018701	CGGA	2	8	438941	438948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_018701	GGGC	2	8	440685	440692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_018701	GGCT	2	8	477533	477540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_018701	TCCC	2	8	491268	491275	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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232	NC_018701	CAGC	2	8	603369	603376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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238	NC_018701	GCCC	2	8	615063	615070	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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262	NC_018701	GCGG	2	8	681641	681648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
263	NC_018701	AGGC	2	8	689652	689659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_018701	GGCT	2	8	721419	721426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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280	NC_018701	TGCA	2	8	756929	756936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
281	NC_018701	TCCG	2	8	759195	759202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
282	NC_018701	TCGA	2	8	759239	759246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_018701	TCTA	2	8	766007	766014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_018701	ATCC	2	8	801532	801539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
296	NC_018701	GGCG	2	8	804117	804124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_018701	TCGG	2	8	1174524	1174531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
472	NC_018701	CGGT	2	8	1175418	1175425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
473	NC_018701	GCCG	2	8	1175825	1175832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
474	NC_018701	CGCT	2	8	1177336	1177343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
475	NC_018701	CGAT	2	8	1177568	1177575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_018701	ATTG	2	8	1183875	1183882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_018701	TCGA	2	8	1192175	1192182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_018701	CTCA	2	8	1192189	1192196	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
488	NC_018701	GGTC	2	8	1193697	1193704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_018701	ATTG	2	8	1193871	1193878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
490	NC_018701	CGCC	2	8	1194460	1194467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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494	NC_018701	GCCA	2	8	1201555	1201562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_018701	TTCG	2	8	1204434	1204441	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_018701	TCAT	2	8	1204466	1204473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
497	NC_018701	CCGC	2	8	1223222	1223229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
498	NC_018701	CACG	2	8	1223407	1223414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_018701	GAAG	2	8	1224664	1224671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
500	NC_018701	CCGC	2	8	1225447	1225454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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