MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018683	TCCCGA	2	12	31767	31778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018683	CGCGCT	2	12	35503	35514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018683	TTGCCG	2	12	44311	44322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018683	ATCGAT	2	12	93757	93768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018683	CACCCG	2	12	94961	94972	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018683	GAGGAA	2	12	107311	107322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018683	TTTCGT	2	12	119775	119786	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018683	TGCCAT	2	12	134080	134091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018683	CTCCGC	2	12	161596	161607	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018683	GTGCCG	2	12	215323	215334	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018683	TGCGTT	2	12	246275	246286	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018683	CGATCG	2	12	285966	285977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018683	AAGACG	2	12	354257	354268	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018683	GTGCAT	2	12	375293	375304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018683	GCAGCC	2	12	378733	378744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018683	ACATCG	2	12	385372	385383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018683	ACGGAA	2	12	404104	404115	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018683	GGCATC	2	12	450825	450836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018683	GAAGGG	2	12	471727	471738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018683	TCTTGC	2	12	479577	479588	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018683	TTCGGC	2	12	536868	536879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018683	TCAGCT	2	12	536902	536913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018683	CACCCG	2	12	538733	538744	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018683	GTCCCA	2	12	602077	602088	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018683	GCCGAC	2	12	602462	602473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018683	GTCCCA	2	12	622128	622139	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018683	GCCGAC	2	12	622511	622522	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018683	CGACAC	2	12	656063	656074	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018683	AGCGCG	2	12	656875	656886	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018683	TAACGT	2	12	677067	677078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018683	GGGGCA	2	12	691468	691479	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018683	GTCGAC	2	12	706389	706400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018683	CAGTCG	4	24	730469	730492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018683	CCACTC	2	12	740212	740223	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018683	CGAGGA	2	12	741929	741940	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018683	TTGCAT	2	12	753247	753258	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018683	CGGCGC	2	12	753448	753459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018683	TAAAGC	2	12	829165	829176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018683	TCAGCG	2	12	857794	857805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018683	TTGCGC	2	12	861509	861520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018683	CTTCGA	2	12	875701	875712	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018683	CGCTGA	2	12	885422	885433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018683	GGCCGG	2	12	949163	949174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018683	TGATCA	2	12	959801	959812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018683	CCCTGC	2	12	973009	973020	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018683	GCCGCA	2	12	1007636	1007647	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018683	GCTCCA	2	12	1010031	1010042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018683	CCTTGG	2	12	1032543	1032554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018683	CCGGAT	2	12	1046867	1046878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018683	TCTGGC	2	12	1102970	1102981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018683	TTCGTC	2	12	1115110	1115121	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018683	TCCTGT	2	12	1126627	1126638	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018683	GCGCCC	2	12	1127585	1127596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018683	GACAGC	2	12	1133180	1133191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018683	TCACCA	2	12	1152600	1152611	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018683	GCGCGA	2	12	1158706	1158717	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018683	CCGCTG	2	12	1179504	1179515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018683	CGAAAC	2	12	1237751	1237762	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018683	TTGCTT	2	12	1244311	1244322	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018683	TCCTTG	2	12	1251596	1251607	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018683	CTGGCA	2	12	1281529	1281540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018683	GACGAA	2	12	1284936	1284947	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018683	CGGGCC	2	12	1289817	1289828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018683	GATCGA	2	12	1308343	1308354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018683	CGTCCG	2	12	1314684	1314695	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018683	GCGACG	2	12	1316671	1316682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018683	GCATCG	2	12	1400799	1400810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018683	AAAATG	2	12	1435721	1435732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018683	CCCCCT	2	12	1506291	1506302	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.