MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018682	TAACGA	2	12	190311	190322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
502	NC_018682	A	7	7	191413	191419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018682	CAC	2	6	191439	191444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_018682	CAC	2	6	191483	191488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_018682	TCAA	2	8	191490	191497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_018682	GCA	2	6	193158	193163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_018682	CAG	2	6	193173	193178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_018682	TCG	2	6	197340	197345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_018682	CCT	2	6	197454	197459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_018682	ACC	2	6	197475	197480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_018682	AG	3	6	197482	197487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018682	CGC	2	6	201466	201471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_018682	GCA	2	6	201484	201489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018682	TGTC	2	8	201520	201527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_018682	TCG	2	6	201634	201639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_018682	TC	3	6	201655	201660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_018682	GTT	2	6	201671	201676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018682	CGAT	2	8	201689	201696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_018682	CTT	2	6	201732	201737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_018682	CAT	2	6	202287	202292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_018682	A	7	7	202393	202399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018682	CCG	2	6	202411	202416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_018682	AGGG	2	8	202442	202449	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018682	GA	3	6	204611	204616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018682	AG	3	6	204618	204623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018682	GCA	2	6	205814	205819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_018682	GCG	2	6	206830	206835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_018682	ATTGAG	2	12	206928	206939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018682	GAC	2	6	206967	206972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018682	ATGC	2	8	209073	209080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_018682	CGG	2	6	209130	209135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_018682	GC	3	6	209155	209160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_018682	A	7	7	210319	210325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018682	GAG	2	6	211076	211081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018682	GCC	2	6	211301	211306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_018682	CGC	2	6	211370	211375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_018682	CGG	2	6	211440	211445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_018682	GC	3	6	211452	211457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_018682	CGGC	2	8	212479	212486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_018682	GCC	2	6	212493	212498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_018682	TTCGG	2	10	212559	212568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
542	NC_018682	GCAGC	2	10	213591	213600	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
543	NC_018682	A	6	6	213622	213627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018682	A	6	6	213644	213649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018682	ACGC	2	8	213658	213665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_018682	TCC	2	6	213687	213692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_018682	GCA	2	6	213703	213708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_018682	T	7	7	213773	213779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018682	TTC	2	6	213793	213798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_018682	GCG	2	6	213811	213816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_018682	CGC	2	6	213825	213830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_018682	CCT	2	6	214126	214131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_018682	GCT	2	6	214164	214169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_018682	AGG	2	6	214205	214210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018682	AAG	3	9	214215	214223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018682	C	6	6	214259	214264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
557	NC_018682	CCG	2	6	214280	214285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_018682	CTC	2	6	216078	216083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_018682	AC	3	6	216093	216098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_018682	CGC	2	6	216099	216104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_018682	CGG	3	9	216115	216123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_018682	TTCC	2	8	216819	216826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_018682	CAA	2	6	216840	216845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018682	CGC	2	6	216849	216854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_018682	GCG	2	6	217006	217011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_018682	GGC	2	6	217026	217031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_018682	AC	4	8	217051	217058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_018682	GAC	2	6	217155	217160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_018682	GGACC	2	10	217202	217211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
570	NC_018682	TGC	2	6	217235	217240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_018682	CCGCG	2	10	217278	217287	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
572	NC_018682	GGC	2	6	217289	217294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_018682	GCC	3	9	217300	217308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_018682	GTC	2	6	217385	217390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_018682	CCG	2	6	217415	217420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_018682	CGG	2	6	218091	218096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_018682	GTG	2	6	218249	218254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018682	TCC	2	6	218275	218280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_018682	TCCGC	2	10	218316	218325	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
580	NC_018682	CTC	2	6	218365	218370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_018682	GGA	2	6	218376	218381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018682	TTCC	2	8	219708	219715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_018682	TTG	2	6	219720	219725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018682	TTC	2	6	219814	219819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_018682	CGC	2	6	219833	219838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_018682	TCC	2	6	219862	219867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_018682	GCC	2	6	219870	219875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_018682	CATTT	2	10	219879	219888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
589	NC_018682	GGGC	2	8	219950	219957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
590	NC_018682	AAC	2	6	219961	219966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_018682	CTC	2	6	220325	220330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_018682	CTG	2	6	220374	220379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018682	GTG	2	6	220423	220428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018682	CGC	2	6	220486	220491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_018682	CTC	2	6	220528	220533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_018682	GAC	2	6	220572	220577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_018682	AGCGAT	2	12	220848	220859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
598	NC_018682	TGC	2	6	220905	220910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_018682	GTC	2	6	220917	220922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_018682	ACG	2	6	220923	220928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_018682	GCC	3	9	220935	220943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_018682	CCG	2	6	220954	220959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_018682	CTC	2	6	220968	220973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_018682	GCC	2	6	220992	220997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_018682	TCC	2	6	221001	221006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_018682	CTG	2	6	221010	221015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_018682	TCCT	2	8	221032	221039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_018682	GCC	2	6	221049	221054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_018682	AGG	2	6	221081	221086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018682	CAT	2	6	221398	221403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_018682	GCAG	2	8	221439	221446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
612	NC_018682	TCGA	2	8	221468	221475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
613	NC_018682	ATA	2	6	221482	221487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018682	GA	3	6	221541	221546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018682	GGT	2	6	221572	221577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018682	TGA	2	6	221628	221633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018682	GGT	2	6	221643	221648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018682	TGA	2	6	221728	221733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018682	TC	3	6	221766	221771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_018682	TCA	2	6	221797	221802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_018682	TGC	2	6	221810	221815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_018682	CGAG	2	8	221816	221823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
623	NC_018682	CG	3	6	221829	221834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_018682	C	6	6	221901	221906	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
625	NC_018682	CGC	2	6	221934	221939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_018682	CGG	2	6	221970	221975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_018682	GT	3	6	221987	221992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018682	CGA	2	6	222044	222049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_018682	CGC	2	6	222071	222076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_018682	AGG	2	6	222130	222135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018682	CGA	2	6	222220	222225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018682	CGG	2	6	222274	222279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_018682	GTT	2	6	222308	222313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018682	CTG	2	6	224762	224767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_018682	CTT	2	6	224830	224835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_018682	GCC	2	6	224891	224896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_018682	CCG	2	6	224979	224984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_018682	TCG	2	6	225014	225019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_018682	T	6	6	225037	225042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_018682	TCCG	2	8	225046	225053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
641	NC_018682	GAG	2	6	230346	230351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_018682	ACC	2	6	231027	231032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_018682	AT	3	6	231734	231739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_018682	CTT	2	6	231809	231814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_018682	GCC	2	6	231819	231824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
646	NC_018682	AGT	2	6	231917	231922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_018682	TGC	2	6	231934	231939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_018682	TA	3	6	231953	231958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_018682	T	6	6	231959	231964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_018682	AC	3	6	234059	234064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
651	NC_018682	CCTTC	2	10	234107	234116	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
652	NC_018682	AGA	2	6	234233	234238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_018682	CT	3	6	235273	235278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
654	NC_018682	TCT	2	6	235283	235288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_018682	G	6	6	235295	235300	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
656	NC_018682	TGG	2	6	235308	235313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
657	NC_018682	AGCTG	2	10	235466	235475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
658	NC_018682	TCC	2	6	236889	236894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
659	NC_018682	CGT	2	6	245742	245747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
660	NC_018682	CGG	2	6	245755	245760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_018682	AAGCC	2	10	245808	245817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
662	NC_018682	TG	4	8	245833	245840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
663	NC_018682	TGG	2	6	245903	245908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
664	NC_018682	CCG	2	6	245966	245971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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