MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018646	TCGTG	2	10	17469	17478	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018646	GTTAA	2	10	18224	18233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018646	GGGAG	2	10	18743	18752	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018646	AGGGA	2	10	20954	20963	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018646	TCGTG	2	10	23302	23311	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018646	GTTAA	2	10	24057	24066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018646	GGGAG	2	10	24576	24585	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018646	AGGGA	2	10	26787	26796	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018646	AGCGA	2	10	40332	40341	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018646	CTTTT	2	10	46147	46156	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018646	TCCTC	2	10	57525	57534	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_018646	AAATA	2	10	76377	76386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018646	AAGGA	2	10	81933	81942	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018646	TCGTG	2	10	91995	92004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018646	GTTAA	2	10	92750	92759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018646	GGGAG	2	10	93269	93278	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018646	AGGGA	2	10	95480	95489	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018646	CTTTA	2	10	95992	96001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018646	AGATA	2	10	97447	97456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018646	GAAGC	2	10	98125	98134	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018646	ATTTT	2	10	100063	100072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018646	TTTAA	2	10	100155	100164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018646	TATAA	2	10	104551	104560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018646	TAAAC	2	10	116725	116734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018646	ATTTA	2	10	119067	119076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018646	ATTTT	2	10	120721	120730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018646	CTTTT	2	10	120765	120774	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018646	ATAGA	2	10	143991	144000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018646	ATAAA	2	10	146062	146071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018646	ACTTG	2	10	148548	148557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018646	GTTAA	2	10	156453	156462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018646	AATAT	2	10	164292	164301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018646	AATAG	2	10	172253	172262	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018646	TCGTG	2	10	179717	179726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018646	GTTAA	2	10	180472	180481	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018646	GGGAG	2	10	180991	181000	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018646	AGGGA	2	10	183202	183211	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018646	TGTTA	2	10	183736	183745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018646	TTATT	2	10	188112	188121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018646	ATTTT	2	10	200647	200656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018646	ACTAT	2	10	205813	205822	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018646	AGAAC	2	10	209471	209480	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018646	TAAAA	2	10	226683	226692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018646	TCTAA	2	10	242309	242318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018646	ATAAA	2	10	242727	242736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018646	AAGAA	2	10	247783	247792	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018646	TTTAT	2	10	252369	252378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018646	TTTAT	2	10	255676	255685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018646	AGATG	2	10	256051	256060	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018646	TCGTG	2	10	263358	263367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018646	GTTAA	2	10	264113	264122	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018646	GGGAG	2	10	264632	264641	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018646	AGGGA	2	10	266843	266852	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018646	CTTTA	2	10	267358	267367	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018646	TTAAT	2	10	269932	269941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018646	TTTTG	2	10	273346	273355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018646	TAGAG	2	10	279316	279325	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018646	GTAGA	2	10	279351	279360	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018646	AAGTG	2	10	284169	284178	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018646	ATAAA	2	10	302714	302723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018646	ATCAT	2	10	328151	328160	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018646	ATTCT	2	10	352020	352029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018646	TCGTG	2	10	362265	362274	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018646	GTTAA	2	10	363020	363029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018646	GGGAG	2	10	363539	363548	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018646	AGGGA	2	10	365752	365761	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018646	TTTCA	2	10	386410	386419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018646	TTAAT	2	10	388158	388167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018646	TTTTA	2	10	398140	398149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018646	TAGAA	2	10	408201	408210	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018646	ATTTT	2	10	423363	423372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018646	TCGTG	2	10	431410	431419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018646	GTTAA	2	10	432165	432174	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018646	GGGAG	2	10	432684	432693	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018646	AGGGA	2	10	434895	434904	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018646	CTTTA	2	10	435407	435416	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018646	TTAAA	2	10	440129	440138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018646	TACGG	2	10	441373	441382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018646	CAAAG	2	10	443052	443061	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018646	AGTGG	2	10	443091	443100	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018646	TACCT	2	10	443821	443830	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_018646	AGTTG	2	10	445079	445088	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018646	ATGCT	2	10	454911	454920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018646	TAACC	2	10	457604	457613	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_018646	TCAAG	2	10	457652	457661	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018646	TCAAG	2	10	458612	458621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018646	AGATT	2	10	461694	461703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018646	ATAAA	2	10	474471	474480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018646	ATTTA	2	10	484879	484888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018646	TAGTA	2	10	489837	489846	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018646	TGTTA	2	10	491303	491312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018646	TTAGT	2	10	493441	493450	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018646	TCTTT	2	10	506948	506957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018646	ACCTT	2	10	508372	508381	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018646	TTTTG	2	10	518236	518245	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018646	TAGAA	2	10	524007	524016	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018646	ATATT	2	10	529862	529871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018646	AGATA	2	10	537399	537408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018646	GAAGC	2	10	538078	538087	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018646	ATATA	2	10	542338	542347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018646	ATAGG	2	10	549632	549641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018646	AGTGC	2	10	557733	557742	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018646	TAGAA	2	10	559764	559773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018646	ATAAA	2	10	567444	567453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018646	ACCTT	2	10	571693	571702	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018646	AAGCC	2	10	573303	573312	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_018646	AGATA	2	10	574733	574742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018646	GAAGC	2	10	575412	575421	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018646	TTATC	3	15	576076	576090	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018646	TGTTT	2	10	576129	576138	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018646	TTAGG	2	10	594463	594472	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018646	TAATA	2	10	598063	598072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018646	AATAA	2	10	605371	605380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018646	CTTTT	2	10	605601	605610	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018646	TTGAT	2	10	614711	614720	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018646	TACAA	2	10	622610	622619	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018646	TGGCA	2	10	653427	653436	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018646	GAAAG	2	10	662283	662292	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018646	GAGTT	2	10	664427	664436	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018646	CATTT	2	10	668592	668601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018646	AATTA	2	10	668998	669007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018646	TCAAA	2	10	669350	669359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018646	TTCTA	2	10	671176	671185	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018646	ACTAT	2	10	671440	671449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018646	ATTTT	2	10	677345	677354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018646	TGATA	2	10	688831	688840	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018646	ATAAA	2	10	695997	696006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018646	TAAAT	2	10	706491	706500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018646	ATTAA	2	10	706511	706520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018646	ATATG	2	10	706562	706571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018646	ACCTT	2	10	727790	727799	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_018646	TAGCT	2	10	730286	730295	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018646	TTGCT	2	10	734482	734491	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018646	AGATA	2	10	754207	754216	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018646	GAAGC	2	10	754885	754894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018646	CATAT	2	10	766266	766275	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018646	GAAAA	2	10	766418	766427	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018646	GTTCA	2	10	770030	770039	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018646	ATACT	2	10	771408	771417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018646	TTTTA	2	10	772109	772118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018646	GAAAT	2	10	781268	781277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018646	TACTT	2	10	787129	787138	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018646	TTAGA	2	10	794720	794729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018646	CTTCT	2	10	801280	801289	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_018646	ATATC	2	10	823976	823985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018646	ATATA	2	10	830245	830254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018646	TAAAA	2	10	846311	846320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018646	CTTAA	2	10	850495	850504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_018646	GCTGT	2	10	941379	941388	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.