MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018299	GGGTT	2	10	4037	4046	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018299	TCCGG	2	10	38434	38443	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018299	CCGCT	2	10	49980	49989	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_018299	TGAGA	2	10	50637	50646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018299	CGTCC	2	10	85675	85684	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_018299	GGGCT	2	10	102934	102943	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018299	CCGCG	2	10	143260	143269	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_018299	ATCGG	2	10	179330	179339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018299	TGCAA	2	10	184553	184562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018299	CCACC	2	10	197965	197974	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_018299	CCCAT	2	10	199348	199357	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_018299	ATCCG	2	10	199460	199469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_018299	CGTCC	2	10	203401	203410	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_018299	CTCAC	2	10	203481	203490	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_018299	TTCGC	2	10	213635	213644	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_018299	TGTCC	2	10	224984	224993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018299	AGCGA	2	10	225298	225307	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018299	TCACC	2	10	231664	231673	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_018299	CCGAC	2	10	243907	243916	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_018299	GCGCA	2	10	246197	246206	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018299	CCGAC	2	10	248024	248033	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.