MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018294	CGTGG	2	10	5781	5790	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018294	CGGAG	2	10	5919	5928	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018294	ACCTT	2	10	7051	7060	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018294	GACCG	2	10	13443	13452	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018294	AAGGG	2	10	13468	13477	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018294	TTCTT	2	10	26435	26444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018294	CTCTT	2	10	31701	31710	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018294	CGCAG	2	10	48028	48037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018294	TCGGC	2	10	48486	48495	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018294	AGCTG	2	10	48513	48522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018294	AGGAG	2	10	49277	49286	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018294	CATGA	2	10	61958	61967	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018294	GCGAG	2	10	72074	72083	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018294	GCGAC	2	10	82267	82276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018294	GCGCC	2	10	85364	85373	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_018294	GCATT	2	10	105070	105079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018294	GTGGC	2	10	110775	110784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018294	GAGCC	2	10	111224	111233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018294	AATCC	2	10	117560	117569	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018294	GCAGC	2	10	133865	133874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018294	TTGTG	2	10	140907	140916	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018294	GGCGT	2	10	140971	140980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018294	GATAT	2	10	144954	144963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018294	TGTTA	2	10	152432	152441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018294	CCGCA	2	10	179626	179635	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_018294	CAATT	2	10	179646	179655	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018294	GAAGA	2	10	193896	193905	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018294	CGGCT	2	10	211591	211600	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018294	TCGGA	2	10	238388	238397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018294	ATCGA	2	10	238842	238851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018294	TAGCT	2	10	248021	248030	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018294	AGCAT	2	10	255173	255182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018294	GCTGA	2	10	255225	255234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018294	CGATG	2	10	272936	272945	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.