MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018193	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018193	CGA	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018193	TGC	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018193	CAA	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018193	AGG	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018193	CCG	2	6	1456	1461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018193	CCG	2	6	1471	1476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018193	GAG	2	6	1493	1498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018193	CAG	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018193	GCG	2	6	1577	1582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018193	GAA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018193	AGC	2	6	1723	1728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018193	TCG	2	6	1755	1760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018193	CTC	2	6	2720	2725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018193	CCG	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018193	CAT	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018193	TGC	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018193	CAT	2	6	3175	3180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018193	GGT	2	6	3216	3221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018193	GCG	2	6	3325	3330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018193	CTT	2	6	3889	3894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018193	TGA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018193	GAG	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018193	GGC	2	6	4049	4054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018193	GCC	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018193	GAT	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018193	GGA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018193	GTC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018193	CGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018193	GGT	2	6	6115	6120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018193	AGG	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018193	TTG	2	6	6182	6187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018193	GCT	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018193	ACC	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018193	CGG	2	6	8969	8974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018193	GAA	2	6	9034	9039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018193	ACG	2	6	9058	9063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018193	GCG	2	6	9879	9884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018193	TCG	2	6	9926	9931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018193	GCG	2	6	10225	10230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018193	GCC	3	9	10297	10305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018193	CAC	2	6	10334	10339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018193	ATC	2	6	11302	11307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.