MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018191	CG	3	6	3657	3662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018191	GC	3	6	4143	4148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018191	CA	3	6	12934	12939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018191	GC	3	6	14305	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018191	GC	3	6	14776	14781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018191	CG	3	6	22452	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018191	GA	3	6	26392	26397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018191	GC	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018191	GC	3	6	27159	27164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018191	GC	4	8	27426	27433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018191	CG	3	6	27727	27732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018191	GC	3	6	29209	29214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018191	AC	3	6	33876	33881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018191	CT	3	6	33950	33955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018191	CG	3	6	35135	35140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018191	CG	3	6	35231	35236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018191	CG	3	6	35323	35328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018191	TG	3	6	35348	35353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018191	TC	3	6	38552	38557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018191	TC	3	6	38611	38616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018191	GT	3	6	41220	41225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018191	CG	3	6	42997	43002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018191	CG	3	6	48246	48251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018191	TG	3	6	49987	49992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018191	CG	3	6	50029	50034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018191	TC	3	6	50144	50149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018191	GC	3	6	50620	50625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018191	GC	3	6	51543	51548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018191	CG	3	6	54803	54808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018191	GA	3	6	57553	57558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018191	GC	3	6	58857	58862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018191	GC	3	6	59523	59528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018191	AC	3	6	73201	73206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018191	AT	4	8	74123	74130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018191	TG	3	6	82228	82233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018191	CT	3	6	85555	85560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018191	CG	3	6	88437	88442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018191	GC	3	6	88591	88596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018191	GC	3	6	88900	88905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018191	CT	3	6	91014	91019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018191	CA	3	6	91214	91219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018191	GC	3	6	91228	91233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018191	CG	3	6	97747	97752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018191	CG	3	6	99810	99815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018191	CG	4	8	102682	102689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018191	GA	3	6	103014	103019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018191	GA	4	8	113722	113729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018191	GA	3	6	121378	121383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018191	GC	3	6	122881	122886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018191	GC	3	6	128053	128058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018191	GC	3	6	133995	134000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018191	GC	3	6	151301	151306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018191	CT	3	6	155317	155322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018191	AT	3	6	168470	168475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018191	CG	3	6	180393	180398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018191	CG	3	6	185928	185933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018191	GT	3	6	186580	186585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018191	GC	3	6	194099	194104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018191	GA	3	6	196187	196192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018191	AG	3	6	198503	198508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018191	CT	3	6	198570	198575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018191	CG	3	6	201522	201527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018191	GC	4	8	203462	203469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018191	GA	3	6	204529	204534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018191	GA	3	6	205172	205177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018191	CG	4	8	209732	209739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018191	TC	3	6	209846	209851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018191	GC	3	6	210325	210330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018191	GC	3	6	210581	210586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.