MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans GS-5 chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018089	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018089	GGAATA	2	12	14702	14713	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018089	TTACGT	2	12	19447	19458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018089	GGTAAA	2	12	40575	40586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018089	ATTTTA	2	12	43061	43072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018089	ACGACA	2	12	51216	51227	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018089	TGGATT	2	12	68601	68612	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018089	AATAAG	2	12	89280	89291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018089	TAGAAT	2	12	106462	106473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018089	ATGAGA	2	12	128466	128477	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018089	TCTTTT	2	12	154462	154473	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018089	ATCGTT	2	12	160095	160106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018089	TTTAAG	2	12	182888	182899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018089	TTACGT	2	12	185783	185794	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018089	TAATCT	2	12	205250	205261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018089	TAAAGG	2	12	217976	217987	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018089	CGATTT	2	12	226711	226722	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018089	TGCAGT	2	12	239400	239411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018089	AAATTT	2	12	245415	245426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018089	AATGTT	2	12	253061	253072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018089	TCTTTT	2	12	277944	277955	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018089	AATTTT	2	12	279078	279089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018089	CTTTTG	2	12	284284	284295	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018089	AATTTA	2	12	286769	286780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018089	AAGTCA	2	12	290001	290012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018089	TTTTCA	2	12	299176	299187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018089	TGAAAT	2	12	310733	310744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018089	TTACTA	2	12	326011	326022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018089	GCTTAG	2	12	326821	326832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018089	GCTGTT	2	12	335941	335952	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018089	TGATTT	2	12	359056	359067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018089	TTAATT	2	12	374710	374721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018089	TTTAAT	2	12	392104	392115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018089	ATTTTT	2	12	392271	392282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018089	ACTTTT	2	12	415139	415150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018089	GATGAC	2	12	424675	424686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018089	AGAAAC	2	12	434694	434705	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018089	TCTTTA	2	12	443395	443406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018089	CTGATA	2	12	476211	476222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018089	AATTTT	2	12	486715	486726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018089	ACATTT	2	12	488347	488358	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018089	AACTAT	2	12	489269	489280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018089	TAATAG	2	12	506028	506039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018089	AATTTT	2	12	515539	515550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018089	GAGATC	2	12	569333	569344	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018089	ATTATG	2	12	580332	580343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018089	CTTTTT	2	12	586833	586844	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018089	AAATAG	2	12	609027	609038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018089	AATTTT	2	12	626692	626703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018089	TAACAA	2	12	627963	627974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018089	GTTTTT	2	12	651073	651084	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018089	CTTTTT	2	12	655753	655764	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018089	ACCATA	2	12	655817	655828	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018089	TCTTTT	2	12	672410	672421	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018089	TGATTT	2	12	675168	675179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018089	AAGTCC	2	12	683178	683189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018089	GGTTAC	2	12	693629	693640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018089	AGAATG	2	12	694282	694293	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018089	TCTTTT	2	12	697584	697595	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018089	GATTTT	2	12	711348	711359	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018089	GTCTTC	2	12	713081	713092	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018089	CTAAGG	2	12	729563	729574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018089	AGTAGA	2	12	731159	731170	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018089	GGAAAA	2	12	737128	737139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018089	TAATTT	2	12	739093	739104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018089	TATAAA	2	12	743051	743062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018089	TTTGTT	2	12	759518	759529	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018089	GAGGTG	2	12	761753	761764	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018089	GTAATA	2	12	765302	765313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018089	CTTTTT	2	12	794109	794120	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018089	ATTAAT	2	12	817497	817508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018089	TATACA	2	12	817656	817667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018089	AGTTAT	2	12	817743	817754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018089	GGAGAT	2	12	888999	889010	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018089	AGACTG	2	12	906621	906632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018089	TGGTTT	2	12	906864	906875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018089	TTCACT	2	12	921170	921181	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018089	ATGTAG	2	12	922016	922027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018089	ATTACT	2	12	927447	927458	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018089	CTAACT	2	12	945402	945413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018089	AGATTT	2	12	984963	984974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018089	TAATCA	2	12	992115	992126	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018089	TTGTTT	2	12	992674	992685	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018089	ACCTTC	2	12	999749	999760	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018089	TTAAAA	2	12	1005344	1005355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018089	GTTCAA	2	12	1015536	1015547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018089	TCTCCT	2	12	1024850	1024861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018089	AAATTA	2	12	1027950	1027961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018089	CTTTTT	2	12	1063751	1063762	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018089	TAAAAA	2	12	1113058	1113069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018089	ACTTAA	2	12	1113095	1113106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018089	CCCGAA	2	12	1124818	1124829	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018089	AATAGT	2	12	1133777	1133788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018089	TTGACA	2	12	1151262	1151273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018089	AAAAAC	2	12	1159438	1159449	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018089	CTACTT	2	12	1181552	1181563	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018089	AGAAAA	2	12	1207369	1207380	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018089	CTTTCA	2	12	1219397	1219408	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018089	TGAAAG	2	12	1219422	1219433	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018089	CCATAT	2	12	1240797	1240808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018089	TTGTTA	2	12	1242063	1242074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018089	CGATTT	2	12	1242126	1242137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018089	CAATAA	2	12	1244745	1244756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018089	GTCAGC	2	12	1278928	1278939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018089	TATTTA	2	12	1281525	1281536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018089	ACTTGA	2	12	1285324	1285335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018089	ATATTT	2	12	1291091	1291102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018089	TAAAGC	2	12	1303210	1303221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018089	TCTTTA	2	12	1303222	1303233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018089	ATCTGC	2	12	1314375	1314386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018089	AGTTTC	2	12	1314411	1314422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018089	ATTAGC	2	12	1314444	1314455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018089	TTATAA	2	12	1327081	1327092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018089	TAAAAT	2	12	1329810	1329821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018089	TTTAAA	2	12	1370042	1370053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018089	AAAATT	2	12	1372649	1372660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018089	GATAAG	2	12	1375818	1375829	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018089	AATCTA	2	12	1375853	1375864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018089	CGTTTT	2	12	1410969	1410980	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018089	CTTTAA	2	12	1419554	1419565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018089	ATTATC	2	12	1437492	1437503	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018089	AAAAGA	2	12	1481315	1481326	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018089	CAATCA	2	12	1485369	1485380	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018089	AAAAGA	2	12	1522820	1522831	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018089	AATCAA	2	12	1531144	1531155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018089	TCTTTT	2	12	1547489	1547500	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_018089	TATTTT	2	12	1548945	1548956	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018089	TTTGAG	2	12	1559205	1559216	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.