MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018073	CATATT	2	12	15035	15046	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018073	ACTAAT	2	12	24131	24142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018073	AGAAAA	2	12	109406	109417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018073	CCAAAA	2	12	130231	130242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018073	AGGAAA	2	12	132211	132222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018073	TTAAAA	2	12	135194	135205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018073	GAAAAT	2	12	157325	157336	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018073	TGATAG	2	12	188105	188116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018073	AATTAT	2	12	192020	192031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018073	TATCTA	2	12	202630	202641	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018073	GAATGG	2	12	227131	227142	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018073	TGTCTA	2	12	245921	245932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018073	CTTTTT	2	12	246400	246411	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018073	ACTTTA	2	12	263858	263869	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018073	TTTGAA	2	12	268353	268364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018073	GTTTTT	2	12	279250	279261	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018073	ACTAAT	2	12	315513	315524	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018073	TGAAAA	2	12	334466	334477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018073	AAAAAT	2	12	355624	355635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018073	AAAAAG	2	12	365295	365306	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018073	ATTTAT	2	12	386851	386862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018073	TTTTTA	2	12	399718	399729	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018073	TCAATA	2	12	420488	420499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018073	GATAAA	2	12	483269	483280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018073	TCTGTG	2	12	489485	489496	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018073	AACGAA	2	12	491240	491251	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018073	CTTTTG	2	12	495852	495863	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018073	GCTTTT	2	12	517573	517584	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018073	CTTTTC	2	12	544187	544198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018073	GAAGCA	2	12	545817	545828	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018073	TGAAAA	2	12	556115	556126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018073	TATTCT	2	12	566591	566602	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018073	TGTTCT	2	12	566966	566977	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018073	GGAGCT	2	12	569186	569197	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018073	AAAACC	2	12	576300	576311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018073	ATTGTA	2	12	612608	612619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018073	AAAGGC	2	12	760331	760342	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018073	TATAAT	2	12	806085	806096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018073	ATTTTT	2	12	862142	862153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018073	TTTGAT	2	12	869718	869729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018073	TTTTCT	2	12	875986	875997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018073	TCAAAT	2	12	879717	879728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018073	TCTGCT	2	12	898208	898219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018073	AATGAA	2	12	907932	907943	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018073	TTGAGA	2	12	921520	921531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018073	AATTTT	2	12	946528	946539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018073	GATAAT	2	12	948952	948963	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018073	GAGAAA	2	12	949441	949452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018073	TTCGGG	2	12	954035	954046	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018073	AAAATT	2	12	978454	978465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018073	TTTTTA	2	12	1024922	1024933	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018073	AATTTA	2	12	1034359	1034370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018073	AAAAAT	2	12	1064511	1064522	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018073	ATAGCA	2	12	1075665	1075676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018073	TTTCCT	2	12	1098436	1098447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018073	TCAGTT	2	12	1102055	1102066	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018073	TTCCTT	2	12	1128195	1128206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018073	AAAATA	2	12	1146195	1146206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018073	GCTTCT	2	12	1156846	1156857	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018073	CCACGA	2	12	1167001	1167012	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018073	ATTAGA	2	12	1202372	1202383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018073	TAAACA	2	12	1202462	1202473	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018073	TCAACA	2	12	1202920	1202931	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018073	ATTCCT	2	12	1208335	1208346	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018073	CTTTTT	2	12	1211016	1211027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018073	AATCAA	2	12	1211051	1211062	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018073	AAGCCA	2	12	1250298	1250309	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018073	CTTTTT	2	12	1303231	1303242	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018073	AACAGA	2	12	1335724	1335735	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018073	ATCATA	2	12	1369517	1369528	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018073	TCCTTA	2	12	1410335	1410346	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018073	TATTAG	2	12	1427535	1427546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018073	CTTTTT	2	12	1488749	1488760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018073	AATTTT	2	12	1496267	1496278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018073	AAAAAC	2	12	1515352	1515363	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018073	CAATAC	2	12	1536660	1536671	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018073	CACTAT	2	12	1578565	1578576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018073	GATTTA	2	12	1638442	1638453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018073	ATTTTG	2	12	1644643	1644654	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018073	TATAAA	2	12	1656038	1656049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018073	TGTAAT	2	12	1657948	1657959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018073	TAAAAA	2	12	1680845	1680856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018073	ATTTAT	2	12	1694293	1694304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018073	AGATCA	2	12	1740452	1740463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018073	TAAAAT	2	12	1742638	1742649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018073	CCCGAA	2	12	1742835	1742846	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018073	TATTAG	2	12	1744562	1744573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018073	ATTTCA	2	12	1802771	1802782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018073	ATTTAT	6	36	1814679	1814714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018073	GATAGA	2	12	1817361	1817372	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018073	AAAATC	2	12	1818446	1818457	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018073	AAAAAC	2	12	1832591	1832602	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018073	TCGCAT	2	12	1862057	1862068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018073	TGAAAA	2	12	1883388	1883399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018073	CTGCTT	2	12	1889157	1889168	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018073	AATTTT	2	12	1895226	1895237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018073	ATCGTA	2	12	1917895	1917906	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018073	TTATTT	2	12	1933391	1933402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.